| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第11-31页 |
| 1.1 水产动物育种技术 | 第11-23页 |
| 1.1.1 传统育种技术 | 第11-16页 |
| 1.1.2 分子标记在遗传育种中的应用 | 第16-23页 |
| 1.2 数量遗传学在育种中的应用 | 第23-25页 |
| 1.2.1 数量性状 | 第23页 |
| 1.2.2 数量性状的特征 | 第23页 |
| 1.2.3 数量性状的多基因效应 | 第23-24页 |
| 1.2.4 数量性状的基本统计方法 | 第24页 |
| 1.2.5 遗传力和遗传相关 | 第24-25页 |
| 1.3 转录组测序技术 | 第25-28页 |
| 1.3.1 转录组 | 第25-26页 |
| 1.3.2 转录组测序技术 | 第26页 |
| 1.3.3 转录组测序的应用 | 第26-28页 |
| 1.4 卵形鲳鲹的研究进展 | 第28-30页 |
| 1.5 本研究的主要内容 | 第30页 |
| 1.6 本研究的创新点 | 第30-31页 |
| 2 卵形鲳鲹家系的亲子鉴定 | 第31-43页 |
| 2.1 材料与方法 | 第31-38页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第31-34页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第34-38页 |
| 2.2 结果与分析 | 第38-41页 |
| 2.2.1 基因组DNA | 第38页 |
| 2.2.2 PCR扩增结果 | 第38-39页 |
| 2.2.3 亲本和子代基因型分析结果 | 第39-40页 |
| 2.2.4 亲子鉴定结果 | 第40-41页 |
| 2.3 讨论 | 第41-42页 |
| 2.4 小结 | 第42-43页 |
| 3 卵形鲳鲹家系形态性状与体重的相关性分析 | 第43-50页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第43-44页 |
| 3.1.1 研究群体的建立 | 第43页 |
| 3.1.2 子代的培育 | 第43页 |
| 3.1.3 数据采集 | 第43-44页 |
| 3.1.4 数据分析 | 第44页 |
| 3.2 实验结果 | 第44-47页 |
| 3.2.1 卵形鲳鲹性状参数指标 | 第44页 |
| 3.2.2 卵形鲳鲹形态性状的主成分分析 | 第44-45页 |
| 3.2.3 卵形鲳鲹形态性状对体重的影响 | 第45-46页 |
| 3.2.4 不同家系全长和体重的方差及变异系数分析 | 第46-47页 |
| 3.3 讨论 | 第47-49页 |
| 3.4 小结 | 第49-50页 |
| 4 卵形鲳鲹遗传连锁图谱的构建和生长性状的QTLs定位 | 第50-65页 |
| 4.1 实验材料与方法 | 第50-54页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第50页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第50-54页 |
| 4.2 实验结果 | 第54-62页 |
| 4.2.1 基因组DNA的检测 | 第54-55页 |
| 4.2.2 DNA浓度和纯度的检测 | 第55-56页 |
| 4.2.3 SNP标记的筛选 | 第56页 |
| 4.2.4 作图标记的筛选 | 第56页 |
| 4.2.5 卵形鲳鲹遗传连锁图谱的构建 | 第56-59页 |
| 4.2.6 卵形鲳鲹与全长相关QTLs分析 | 第59页 |
| 4.2.7 卵形鲳鲹与体高相关QTLs分析 | 第59页 |
| 4.2.8 卵形鲳鲹与体重相关QTLs分析 | 第59-62页 |
| 4.3 讨论 | 第62-64页 |
| 4.4 小结 | 第64-65页 |
| 5 不同温度下卵形鲳鲹垂体-肝脏转录组的分析 | 第65-88页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第65-67页 |
| 5.1.1 材料 | 第65-66页 |
| 5.1.2 文库的制备和深度测序 | 第66页 |
| 5.1.3 转录本的组装和注释 | 第66页 |
| 5.1.4 差异表达基因的分析 | 第66页 |
| 5.1.5 GO富集分析 | 第66-67页 |
| 5.1.6 聚类分析 | 第67页 |
| 5.2 实验结果 | 第67-84页 |
| 5.2.1 测序产量统计 | 第67页 |
| 5.2.2 转录本的组装和表达丰度的估计 | 第67-74页 |
| 5.2.3 卵形鲳鲹肝脏和垂体的差异表达基因 | 第74-78页 |
| 5.2.4 差异表达基因的GO功能注释 | 第78-81页 |
| 5.2.5 差异表达基因的GO富集 | 第81-83页 |
| 5.2.6 聚类分析 | 第83-84页 |
| 5.3 讨论 | 第84-86页 |
| 5.4 小结 | 第86-88页 |
| 总结 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-102页 |
| 附录 | 第102-114页 |
| 在读期间发表论文情况 | 第114页 |
| 在读期间申请专利 | 第114-115页 |
| 致谢 | 第115页 |