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利用改进的CRISPR/Cas9技术靶向突变三个水稻MAPK基因的研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略语表第10-12页
1 文献综述第12-24页
    1.1 植物在生物逆境胁迫下的免疫反应分子机制第12-13页
    1.2 水稻的抗病信号通路第13-16页
        1.2.1 植物激素在水稻抗病中的功能第13-14页
        1.2.2 MAPK激酶级联反应第14-15页
        1.2.3 PR基因第15-16页
    1.3 基因组编辑技术第16-19页
        1.3.1 基因组编辑技术的原理第16-17页
        1.3.2 用于基因组编辑的序列特异性核酸酶第17-19页
    1.4 CRISPR/Cas9技术的进展第19-23页
        1.4.1 Cas9和gRNA表达技术优化的进展第19-20页
        1.4.2 降低CRISPR/Cas9脱靶效应的进展第20-21页
        1.4.3 CRISPR/Cas9PAM限制问题的进展第21页
        1.4.4 CRISPR/Cas9技术的其它应用第21-22页
        1.4.5 其它CRISPR相关蛋白的发展第22-23页
    1.5 研究目的与意义第23-24页
2 材料和方法第24-34页
    2.1 实验材料第24-25页
        2.1.1 实验所用载体第24页
        2.1.2 实验所用材料第24-25页
        2.1.3 常用试剂及仪器第25页
    2.2 实验方法第25-34页
        2.2.1 靶向敲除载体的构建第25-29页
        2.2.2 水稻原生质体制备及转染第29页
        2.2.3 RT?PCR(ReverseTranscriptPCR)第29页
        2.2.4 qPCR(QuantitativePCR)第29-30页
        2.2.5 Western-blotting第30页
        2.2.6 靶向DNA片段切除的检测第30-32页
        2.2.7 水稻抗病性鉴定第32-34页
3 结果与分析第34-63页
    3.1 利用内含子表达gRNA的设计第34-36页
    3.2 敲除载体的构建第36-37页
    3.3 inPTG-Cas9的可行性验证第37-41页
        3.3.1 inPTG不影响内含子的正常剪接第37-39页
        3.3.2 原生质体中载体的转录后Cas9表达水平分析第39-40页
        3.3.3 原生质体中不同载体的Cas9蛋白表达水平分析第40-41页
    3.4 inPTG-Cas9融合基因编辑效率验证第41-52页
        3.4.1 原生质体中不同载体的基因编辑效率检测第41-44页
        3.4.2 转基因水稻的编辑效率检测第44-50页
        3.4.3 靶向编辑的遗传稳定性分析第50-52页
    3.5 inPTG-Cas9的进一步优化第52-58页
        3.5.1 在3’-UTR融合inPTG内含子第52-54页
        3.5.2 inPTG内含子可以与抗性基因融合第54-56页
        3.5.3 对tRNA-gRNA串联序列的优化第56-58页
    3.6 两个MAPK基因编辑材料的抗性分析第58-63页
        3.6.1 PR5和PR10基因表达量分析第58-60页
        3.6.2 基因编辑水稻对稻瘟病菌的抗性分析第60-61页
        3.6.3 基因编辑水稻对根结线虫的抗性分析第61-63页
4 讨论第63-67页
    4.1 inPTG-Cas9的特点小结第63-64页
    4.2 inPTG-Cas9载体的改进与应用第64-65页
    4.3 展望第65-67页
参考文献第67-77页
附录A 实验操作步骤第77-85页
附录B 载体图谱第85-87页
附录C 附图第87-96页
附录D 作者简介与在读期间研究成果第96-97页
致谢第97页

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