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番茄促分裂原活化蛋白激酶SlMPK20参与调控花粉发育的分子机制研究

致谢第8-17页
缩写词第17-19页
摘要第19-21页
Abstract第21-23页
前言第24-28页
1 文献综述:高等植物MAPK功能与花粉发育研究进展第28-46页
    1.1 植物花药的发育与花粉粒形成第28-31页
        1.1.1 花药的发育第28-29页
        1.1.2 花粉粒的发育与形态结构第29-31页
    1.2 花粉发育相关基因研究进展第31-35页
        1.2.1 花粉发育前期相关的基因第31-32页
        1.2.2 与减数分裂后花粉发育相关的基因第32-35页
            1.2.2.1 糖代谢与糖信号转导相关基因第33-34页
            1.2.2.2 植物激素合成与信号转导相关基因第34-35页
    1.3 高等植物中MAPK的研究进展第35-46页
        1.3.1 高等植物中的MAPK第35-36页
        1.3.2 TEY MAPKs的研究进展第36-41页
            1.3.2.1 参与植物的生殖生长发育第37-38页
            1.3.2.2 参与植物的营养生长发育第38页
            1.3.2.3 参与植物激素信号转导第38-39页
            1.3.2.4 参与植物的生物胁迫反应第39-41页
            1.3.2.5 参与植物的非生物胁迫反应第41页
        1.3.3 植物特有的TDY MAPKs的研究进展第41-42页
        1.3.4 MAPK下游作用因子的识别方法第42页
        1.3.5 MAPK下游底物的功能第42-46页
2 番茄促分裂原活化蛋白激酶基因SlMPK20的表达分析第46-72页
    2.1 材料与方法第46-58页
        2.1.1 植物材料第46-47页
        2.1.2 主要试剂第47-48页
        2.1.3 植物DNA、RNA的提取和cDNA合成第48-49页
            2.1.3.1 植物DNA的提取第48页
            2.1.3.2 植物RNA的提取和cDNA合成第48-49页
        2.1.4 番茄MAPK基因SlMPK20在不同物种中同源基因的查找及进化分析第49页
        2.1.5 SlMPK20的时空表达分析第49-53页
            2.1.5.1 荧光实时定量PCR分析第49-50页
            2.1.5.2 植物组织原位杂交分析第50-53页
        2.1.6 SlMPK20启动子序列的分离与表达活性分析第53-55页
            2.1.6.1 启动子融合表达载体的构建及农杆菌转化第53页
            2.1.6.2 启动子的活性检测第53页
            2.1.6.3 启动子融合表达载体对拟南芥的遗传转化和筛选第53-54页
            2.1.6.4 启动子融合表达载体在拟南芥中的表达分析第54-55页
        2.1.7 SlMPK20原核表达第55-57页
            2.1.7.1 原核表达载体的构建及对大肠杆菌菌株Rosetta的转化第55页
            2.1.7.2 SlMPK20融合蛋白的原核诱导表达与纯化第55-56页
            2.1.7.3 SlMPK20融合蛋白的SDS-PAGE及Western Blot印迹分析第56-57页
        2.1.8 SlMPK20亚细胞定位分析第57-58页
            2.1.8.1 SlMPK20过表达基因序列的分离第57页
            2.1.8.2 Gateway体系入门载体的构建第57页
            2.1.8.3 LR反应连接Gateway载体第57-58页
            2.1.8.4 利用基因枪介导的洋葱内表皮细胞瞬时表达体系分析SlMPK20亚细胞定位第58页
    2.2 结果与分析第58-69页
        2.2.1 SlMPK20的蛋白结构及进化分析第58-61页
        2.2.2 SlMPK20编码蛋白定位于细胞核、细胞膜和细胞质第61-64页
            2.2.2.1 SlMPK20能够编码一个70.5KD的蛋白第61-62页
            2.2.2.2 SlMPK20蛋白定位于细胞核、细胞膜和细胞质第62-64页
        2.2.3 SlMPK20在番茄雄蕊中优势表达第64-69页
            2.2.3.1 qRT-PCR分析SlMPK20在番茄不同组织器官中的时空表达第64-65页
            2.2.3.2 原位杂交分析SlMPK20在番茄雄蕊不同发育阶段的时空表达第65-66页
            2.2.3.3 SlMPK20启动子在拟南芥花序中优势表达第66-69页
    2.3 讨论第69-72页
        2.3.1 SlMPK20编码一个定位于细胞核、细胞膜和细胞质的TDY MAPK第69页
        2.3.2 SlMPK20在番茄雄蕊中优势表达第69页
        2.3.3 SlMPK20可能参与调控番茄生殖生长发育过程第69-72页
3 番茄SlMPK20的生物学功能分析第72-108页
    3.1 材料与方法第72-84页
        3.1.1 植物材料第72-73页
        3.1.2 主要试剂第73页
        3.1.3 番茄LAT52启动的SlMPK20 RNA干涉载体的构建第73-74页
            3.1.3.1 正义片段和反义片段序列的扩增第73页
            3.1.3.2 构建pLAT52:: pCAMBIA1301载体第73-74页
        3.1.4 SlMPK20过表达载体的构建第74-75页
            3.1.4.1 SlMPK20过表达片段的制备第74页
            3.1.4.2 构建SlMPK20过表达载体第74-75页
        3.1.5 SlMPK20 CRISPR/Cas9敲除载体的构建第75-76页
            3.1.5.1 设计SlMPK20基因的靶序列第75页
            3.1.5.2 构建SlMPK20 CRISPR/Cas9敲除载体第75-76页
        3.1.6 SlMPK20过表达载体、RNA干涉载体及CRISPR/Cas9敲除载体对番茄的遗传转化第76-78页
            3.1.6.1 培养基的配置第76-77页
            3.1.6.2 播种培养第77页
            3.1.6.3 预培养第77页
            3.1.6.4 共培养第77-78页
            3.1.6.5 分化培养第78页
            3.1.6.6 继代培养与生根培养第78页
            3.1.6.7 练苗与移栽第78页
        3.1.7 RNAi及CR转基因植株的分子检测第78-81页
            3.1.7.1 PCR检测第78-79页
            3.1.7.2 GUS组织化学染色第79-80页
            3.1.7.3 QRT-PCR检测第80页
            3.1.7.4 SlMPK20 CRISPR/Cas9敲除转基因植株的脱靶检测第80-81页
        3.1.8 RNAi及敲除转基因番茄植株形态和细胞学观察第81-84页
            3.1.8.1 RNAi及敲除转基因植株的形态观察第81页
            3.1.8.2 花粉活力及花粉萌发率观察第81-82页
            3.1.8.3 花粉形态扫描电镜观察第82-83页
            3.1.8.4 番茄雄蕊半薄切片观察第83页
            3.1.8.5 番茄雄蕊透射电镜观察第83-84页
            3.1.8.6 番茄花和果实性状观察与统计分析第84页
            3.1.8.7 番茄基因敲除纯合突变体杂交验证第84页
    3.2 结果与分析第84-106页
        3.2.1 成功构建SlMPK20 RNAi、CRISPR/Cas9敲除以及过表达载体第84-87页
            3.2.1.1 SlMPK20 RNA干涉载体第84-86页
            3.2.1.2 SlMPK20 CRISPR/Cas9敲除载体第86页
            3.2.1.3 SlMPK20过表达载体第86-87页
        3.2.2 SlMPK20不同类型转基因植株的获得与验证第87-94页
            3.2.2.1 获得SlMPK20 RNAi、CRISPR/Cas9敲除和SlMPK20过表达载体转化番茄植株第87页
            3.2.2.2 PCR和GUS染色验证番茄转基因植株第87-89页
            3.2.2.3 SlMPK20在SlMPK20 RNAi转基因植株的花序中的表达受到抑制第89-90页
            3.2.2.4 SlMPK20蛋白在CRISPR/Cas9敲除转基因植株花序中的表达受阻第90-91页
            3.2.2.5 SlMPK20干涉或敲除并不影响SlMAPK D亚组其他基因的表达第91页
            3.2.2.6 SlMPK20 CRISPR/Cas9敲除没有脱靶第91-94页
        3.2.3 敲除或抑制SlMPK20表达影响番茄花粉与果实发育第94-99页
            3.2.3.1 敲除或抑制SlMPK20表达不影响番茄正常营养生长与开花第94页
            3.2.3.2 敲除或抑制SlMPK20表达可引起番茄花粉败育第94-98页
            3.2.3.3 敲除或抑制SlMPK20表达影响果实正常发育,对雌性生殖发育无明显影响第98-99页
        3.2.4 敲除或抑制SlMPK20表达对花粉细胞学结构的影响第99-106页
            3.2.4.1 敲除或抑制SlMPK20表达导致花粉在单核中后期发生败育第99-104页
            3.2.4.2 敲除或组织特异性抑制SlMPK20表达导致花粉内含物降解,花粉粒皱缩第104-106页
    3.3 讨论第106-108页
        3.3.1 SlMPK20在番茄花粉发育过程中发挥重要作用第106页
        3.3.2 RNAi技术和CRISPR/Cas9系统编辑植物基因组的比较第106-108页
4 SlMPK20在花粉发育基因调控网络中的作用研究第108-134页
    4.1 材料与方法第109-113页
        4.1.1 植物材料第109页
        4.1.2 主要试剂第109页
        4.1.3 植物总RNA的提取及质量检测第109-110页
        4.1.4 RNA文库的构建及测序第110页
        4.1.5 测序数据处理第110-112页
            4.1.5.1 生物信息学分析流程第110-111页
            4.1.5.2 基因表达量分析与差异基因表达分析第111-112页
        4.1.6 植物激素测定方法第112-113页
        4.1.7 植物雄蕊糖含量测定方法第113页
    4.2 结果与分析第113-129页
        4.2.1 抑制或敲除SlMPK20对花粉发育转录组变化的影响第113-122页
        4.2.2 花粉发育早期重要调控基因的表达变化第122-124页
        4.2.3 可能受SlMPK20调控的102个基因在花粉发育后期发挥重要作用第124-126页
        4.2.4 糖代谢与激素代谢相关基因的表达分析第126-128页
        4.2.5 不同发育时期糖与激素含量的变化第128-129页
    4.3 讨论第129-134页
        4.3.1 SlMPK20对番茄雄蕊发育基因调控网络的影响第129-130页
        4.3.2 SlMPK20的抑制或敲除不影响绒毡层的发育第130页
        4.3.3 SlMPK20的敲除影响糖代谢和糖运输相关基因的表达第130-131页
        4.3.4 SlMPK20的敲除影响植物激素合成和信号转导相关基因第131-134页
5 SlMPK20蛋白的互作因子筛选以及对花粉发育的调控途径研究第134-172页
    5.1 材料与方法第134-147页
        5.1.1 植物材料第134-135页
        5.1.2 主要试剂第135页
        5.1.3 酵母双杂交筛库试验第135-141页
            5.1.3.1 用于酵母双杂交筛库的诱饵载体pGBKT7- SlMPK20的构建第135-136页
            5.1.3.2 质粒转化酵母菌株Y187(LiAC法)第136-137页
            5.1.3.3 SlMPK20蛋白对酵母毒性及其自激活活性的检测第137-138页
            5.1.3.4 番茄文库滴定第138页
            5.1.3.5 用融合法(mating)进行酵母双杂交筛库第138-140页
            5.1.3.6 酵母双杂交重组质粒的构建第140页
            5.1.3.7 酵母双杂交验证两种已知蛋白的互作第140-141页
        5.1.4 酵母双杂交试验检测SlMPK20蛋白与上游SlMAPKKs蛋白的互作第141-142页
            5.1.4.1 酵母双杂交重组质粒的构建第141-142页
            5.1.4.2 酵母双杂交分析第142页
        5.1.5 SlMPK20、SlMYB32与SlMKK4蛋白的亚细胞定位分析第142-143页
            5.1.5.1 亚细胞定位载体的构建第142-143页
            5.1.5.2 烟草瞬时表达第143页
        5.1.7 双分子荧光互补试验(BiFC)第143-145页
            5.1.7.1 载体构建第143-144页
            5.1.7.2 农杆菌C58C1感受态的制备(CaCl2法)第144页
            5.1.7.3 农杆菌浸润以及激光共聚焦观察BiFC的结果第144-145页
        5.1.8 SlMYB32 CRISPR/Cas9敲除载体的构建第145-146页
            5.1.8.1 SlMPK20与SlMKK4原核表达载体的构建及对大肠杆菌的转化第145页
            5.1.8.2 SlMKK4融合蛋白的原核诱导表达与纯化第145-146页
            5.1.8.3 Phos-tag体外磷酸化试验第146页
        5.1.10 蛋白定量组学分析(TMT标记)第146-147页
    5.2 结果与分析第147-169页
        5.2.1 SlMPK20蛋白对酵母毒性及其自激活活性的检测第147页
        5.2.2 番茄中与SlMPK20互作蛋白的筛选第147-148页
        5.2.3 酵母双杂交验证SlMYB32与SlMPK20,SlMAPKKs与SlMPK20蛋白的互作第148-153页
            5.2.3.1 酵母双杂交验证SlMYB32与SlMAPKKs pGADT7重组载体的构建第148-151页
            5.2.3.2 酵母双杂交验证SlMYB32与SlMPK20, SlMAPKKs与SlMPK20蛋白的互作第151-153页
        5.2.4 SlMYB32与SlMKK4的亚细胞定位第153-156页
            5.2.4.1 SlMYB32与SlMKK4亚细胞定位载体的构建第153-154页
            5.2.4.2 利用农杆菌侵染烟草进行体内瞬时表达第154-156页
        5.2.5 BiFC验证SlMYB32与SlMPK20, SlMKK4与SlMPK20蛋白的互作第156-160页
            5.2.5.1 SlMPK20,SlMYB32和SlMKK4 BiFC载体的构建第156-158页
            5.2.5.2 BiFC验证SlMYB32与SlMPK20, SlMKK4与SlMPK20蛋白在植物体内的互作第158-160页
        5.2.6 Phos-tag体外磷酸化试验验证SlMKK4与SlMPK20蛋白的互作第160-164页
        5.2.7 蛋白定量组学分析第164-169页
    5.3 讨论第169-172页
        5.3.1 SlMYB32是SlMPK20的下游作用因子第169-170页
        5.3.2 SlMPK20通过SlMKK4-SlMPK20-SlMYB32级联途径在番茄减数分裂后花粉发育发挥重要作用第170-172页
结论第172-174页
参考文献第174-200页
附录第200-203页

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