| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 主要符号对照表 | 第11-12页 |
| 第1章 前言 | 第12-19页 |
| 1.1 概述 | 第12页 |
| 1.2 土壤微生物的作用 | 第12-13页 |
| 1.3 土壤微生物多样性 | 第13-17页 |
| 1.3.1 土壤微生物多样性研究方法 | 第14页 |
| 1.3.2 土壤微生物多样性研究进展 | 第14-17页 |
| 1.4 技术路线 | 第17页 |
| 1.5 研究内容 | 第17页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第17-19页 |
| 第2章 研究区概况 | 第19-21页 |
| 2.1 龙门山地震断裂带简介 | 第19页 |
| 2.2 研究区银厂沟地区概况 | 第19-21页 |
| 第3章 土壤细菌16SrRNA(V6~V8区)群落多样性研究 | 第21-29页 |
| 3.1 材料与方法 | 第21-23页 |
| 3.1.1 土壤样品的采集 | 第21页 |
| 3.1.2 测定土壤理化性质 | 第21页 |
| 3.1.3 总DNA的提取 | 第21页 |
| 3.1.4 PCR扩增 | 第21-22页 |
| 3.1.5 DGGE电泳 | 第22-23页 |
| 3.1.6 优势条带测序及分析 | 第23页 |
| 3.1.7 数据处理 | 第23页 |
| 3.2 结果与分析 | 第23-28页 |
| 3.2.1 土壤理化性质分析 | 第23页 |
| 3.2.2 土壤样品总DNA分析 | 第23-24页 |
| 3.2.3 PCR扩增分析 | 第24-25页 |
| 3.2.4 DGGE优势条带统计分析 | 第25-26页 |
| 3.2.5 DGGE优势条带测序分析 | 第26-27页 |
| 3.2.6 土壤细菌多样性分析 | 第27页 |
| 3.2.7 土壤理化性质与多样性指数相关性分析 | 第27-28页 |
| 3.3 本章小结 | 第28-29页 |
| 第4章 土壤细菌16SrRNA(V3~V4区)群落多样性研究 | 第29-50页 |
| 4.1 材料与方法 | 第29-31页 |
| 4.1.1 土壤样品的采集 | 第29页 |
| 4.1.2 土壤理化性质测定 | 第29页 |
| 4.1.3 高通量测序 | 第29-30页 |
| 4.1.4 数据处理 | 第30-31页 |
| 4.2 结果与分析 | 第31-49页 |
| 4.2.1 土壤理化性质分析 | 第31页 |
| 4.2.2 高通量测序结果统计 | 第31-32页 |
| 4.2.3 OTU划分和分类地位鉴定 | 第32-34页 |
| 4.2.4 Alpha多样性分析 | 第34-36页 |
| 4.2.4.1 Rarefaction稀疏曲线分析 | 第34-35页 |
| 4.2.4.2 丰度等级曲线分析 | 第35页 |
| 4.2.4.3 Alpha多样性指数计算 | 第35-36页 |
| 4.2.5 分类学组成分析 | 第36-44页 |
| 4.2.5.1 各分类水平细菌类群数统计分析 | 第36-37页 |
| 4.2.5.2 门分类水平上土壤细菌群落结构分析 | 第37-38页 |
| 4.2.5.3 纲分类水平上土壤细菌群落结构分析 | 第38-39页 |
| 4.2.5.4 目分类水平上土壤细菌群落结构分析 | 第39-40页 |
| 4.2.5.5 科分类水平上土壤细菌群落结构分析 | 第40-41页 |
| 4.2.5.6 属分类水平上土壤细菌群落结构分析 | 第41-43页 |
| 4.2.5.7 土壤总菌群分类等级树 | 第43-44页 |
| 4.2.6 Beta多样性分析 | 第44-46页 |
| 4.2.6.1 不同植被类型土壤细菌类群主成分分析 | 第44-45页 |
| 4.2.6.2 不同植被类型土壤细菌类群聚类分析 | 第45页 |
| 4.2.6.3 不同植被类型土壤细菌类群PLS-DA分析 | 第45-46页 |
| 4.2.7 土壤理化性质与土壤样品RDA分析 | 第46页 |
| 4.2.8 土壤样本菌群代谢功能预测 | 第46-49页 |
| 4.3 本章小结 | 第49-50页 |
| 第5章 土壤细菌群落代谢功能多样性研究 | 第50-55页 |
| 5.1 材料与方法 | 第50-51页 |
| 5.1.1 土壤样品的采集 | 第50页 |
| 5.1.2 土壤理化性质测定 | 第50页 |
| 5.1.3 Biolog实验 | 第50页 |
| 5.1.4 数据处理 | 第50-51页 |
| 5.2 结果与分析 | 第51-54页 |
| 5.2.1 土壤理化性质结果分析 | 第51页 |
| 5.2.2 土壤细菌AWCD值分析 | 第51-52页 |
| 5.2.3 主成分分析 | 第52-53页 |
| 5.2.4 六类碳源利用率分析 | 第53页 |
| 5.2.5 多样性指数分析 | 第53-54页 |
| 5.2.6 土壤理化性质与多样性指数相关性分析 | 第54页 |
| 5.3 本章小结 | 第54-55页 |
| 第6章 讨论与展望 | 第55-60页 |
| 6.1 讨论 | 第55-59页 |
| 6.1.1 土壤细菌16SrRNA(V6~V8区)研究结果讨论 | 第55-57页 |
| 6.1.1.1 土壤理化性质 | 第55页 |
| 6.1.1.2 土壤优势细菌类群 | 第55-56页 |
| 6.1.1.3 土壤细菌群落多样性 | 第56-57页 |
| 6.1.2 土壤细菌16SrRNA(V3~V4区)研究结果讨论 | 第57-58页 |
| 6.1.2.1 土壤理化性质 | 第57页 |
| 6.1.2.2 土壤细菌群落多样性 | 第57页 |
| 6.1.2.3 土壤细菌群落代谢功能预测 | 第57-58页 |
| 6.1.3 土壤细菌碳源代谢特征研究结果讨论 | 第58-59页 |
| 6.1.3.1 碳源代谢总特征 | 第58页 |
| 6.1.3.2 主要利用的碳源类型 | 第58页 |
| 6.1.3.3 代谢功能多样性 | 第58-59页 |
| 6.2 展望 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 附录 | 第69-81页 |
| 致谢 | 第81-84页 |
| 在学期间的科研情况 | 第84-85页 |
