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亚麻SNP遗传图谱的构建及品质相关性状的QTL定位研究

摘要第3-5页
abstract第5-6页
1 前言第15-33页
    1.1 亚麻概述第15-17页
        1.1.1 亚麻的生物学特性第15页
        1.1.2 亚麻的植物学特征第15页
        1.1.3 亚麻籽品质特性第15-16页
        1.1.4 亚麻的功能及其应用第16页
        1.1.5 亚麻的种植第16页
        1.1.6 亚麻的遗传育种改良第16-17页
    1.2 亚麻分子标记的开发和应用第17-25页
        1.2.1 RAPD在亚麻中的应用第17-19页
        1.2.2 AFLP在亚麻中的应用第19页
        1.2.3 SSR在亚麻中的应用第19-21页
        1.2.4 SNP标记的开发与利用第21-25页
    1.3 亚麻遗传图谱的构建第25-27页
        1.3.1 亚麻连锁遗传图谱的构建第25-26页
        1.3.2 亚麻物理图谱的构建第26-27页
    1.4 亚麻连锁图谱QTL定位方法第27-29页
        1.4.1 区间作图方法第28页
        1.4.2 复合区间作图第28-29页
        1.4.3 完备复合区间作图第29页
        1.4.4 QTL的统计方法第29页
    1.5 亚麻基因功能注释第29-30页
    1.6 本研究的目的意义、主要内容及技术路线第30-33页
        1.6.1 目的及意义第30-31页
        1.6.2 主要研究内容第31-32页
        1.6.3 技术路线第32-33页
2 亚麻农艺、品质性状的表型分析第33-44页
    2.1 材料与方法第33-35页
        2.1.1 植物材料第33-34页
        2.1.2 试验设计第34页
        2.1.3 试验方法第34-35页
        2.1.4 主要仪器与药品第35页
    2.2 结果与分析第35-42页
        2.2.1 F_1表型分析第35页
        2.2.2 F_(2:3)家系性状表型频率分析第35-38页
        2.2.3 F_(2:3)家系表型性状分析第38-39页
        2.2.4 F_(2:3)家系农艺品质性状相关性分析第39-41页
        2.2.5 F_(2:3)家系性状遗传力分析第41-42页
    2.3 讨论第42页
        2.3.1 交换重组和性状分离第42页
        2.3.2 遗传力第42页
    2.4 小结第42-44页
3 亚麻SLAF文库构建及SNP标记的检测第44-55页
    3.1 材料和方法第44-48页
        3.1.1 试验材料第44页
        3.1.2 试验方法第44-48页
    3.2 结果与分析第48-53页
        3.2.1 酶切预测第48-49页
        3.2.2 对照实验第49页
        3.2.3 亚麻SLAF标签的开发及验证第49-51页
        3.2.4 亚麻SNP标记的开发与基因分型第51-53页
    3.3 讨论第53页
        3.3.1 简化基因组测序第53页
        3.3.2 重复序列对SNP标记开发的影响第53页
    3.4 小结第53-55页
4 亚麻连锁遗传图谱构建第55-69页
    4.1 材料与方法第55-57页
        4.1.1 材料第55页
        4.1.2 试验方法第55-57页
    4.2 结果与分析第57-65页
        4.2.1 亚麻连锁遗传图谱构建第57-59页
        4.2.2 亚麻连锁遗传图谱评估第59-65页
    4.3 讨论第65-68页
        4.3.1 标记密度与图谱质量第65-66页
        4.3.2 与参考基因组的比对第66-67页
        4.3.3 偏分离对图谱构建的影响第67-68页
    4.4 小结第68-69页
5 亚麻农艺与品质性状的QTL定位第69-89页
    5.1 材料与方法第69-70页
        5.1.1 研究材料第69页
        5.1.2 研究方法第69-70页
    5.2 结果与分析第70-86页
        5.2.1 亚麻农艺和品质性状QTL分布第70页
        5.2.2 亚麻农艺和品质各性状的QTL定位和遗传效应分析第70-77页
        5.2.3 亚麻农艺和品质性状QTL及其关联的SNP标记第77-79页
        5.2.4 QTL遗传效应分析第79-81页
        5.2.5 绘制QTL图谱第81-86页
    5.3 讨论第86-87页
        5.3.1 亚麻农艺和品质性状QTL定位的稳定性第86页
        5.3.2 群体大小对QTL定位效果的影响第86-87页
    5.4 小结第87-89页
6 亚麻相关QTL位点的基因注释第89-106页
    6.1 材料与方法第89页
        6.1.1 亚麻基因组序列第89页
        6.1.2 亚麻基因注释方法第89页
    6.2 结果与分析第89-104页
        6.2.1 亚麻QTL区域编码基因数第89页
        6.2.2 亚麻QTL区域基因功能注释第89-104页
    6.3 讨论第104-105页
        6.3.1 亚麻脂肪酸代谢相关基因第104页
        6.3.2 千粒重相关基因第104-105页
    6.4 小结第105-106页
7 结论、创新性及工作展望第106-109页
    7.1 结论第106-107页
    7.2 创新性第107-108页
    7.3 工作展望第108-109页
致谢第109-110页
参考文献第110-127页
附表第127-152页
作者简介第152-153页

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