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毛竹生殖器官发育相关miRNA挖掘与miR159-GAMYB途径对花药发育调控研究

摘要第5-8页
Abstract第8-11页
第一章 绪论第19-36页
    1.1 引言第19-20页
    1.2 植物花药和花粉的发育与调控第20-27页
        1.2.1 植物花药和花粉发育过程第20-24页
        1.2.2 绒毡层的发育和调控第24-26页
        1.2.3 胼胝质壁的形成和调控第26页
        1.2.4 花药的开裂和调控第26-27页
    1.3 植物转录因子和miRNA研究进展第27-31页
        1.3.1 miR159家族功能研究进展第28-29页
        1.3.2 植物MYB转录因子功能研究进展第29-31页
    1.4 毛竹生殖器官发育研究进展第31-33页
    1.5 研究目的和意义第33-34页
    1.6 经费来源第34页
    1.7 研究的技术路线第34-36页
第二章 毛竹生殖器官相关miRNA挖掘及其靶基因鉴定第36-63页
    2.1 试验材料第37页
    2.2 试验方法第37-41页
        2.2.1 RNA提取第37页
        2.2.2 small RNA测序和分析第37-40页
        2.2.3 miRNA靶基因预测和分析第40页
        2.2.4 miRNA差异表达分析和实时荧光定量PCR验证第40-41页
    2.3 结果与分析第41-59页
        2.3.1 毛竹不同组织miRNA文库测序数据整体分析第41-43页
        2.3.2 毛竹不同组织已知miRNAs和新miRNAs分析鉴定第43-44页
        2.3.3 已知miRNAs和新miRNAs在毛竹不同组织中的表达模式第44-48页
        2.3.4 毛竹差异表达已知miRNAs的靶基因预测第48-56页
        2.3.5 荧光定量PCR验证差异表达miRNAs和靶基因的表达模式第56-59页
    2.4 讨论第59-62页
    2.5 小结第62-63页
第三章 毛竹miR159对花药发育调控研究第63-82页
    3.1 试验材料第63-64页
        3.1.1 植物材料第63-64页
        3.1.2 酶和试剂第64页
        3.1.3 菌株和载体第64页
    3.2 试验方法第64-66页
        3.2.1 植物DNA提取第64页
        3.2.2 毛竹miR159前体基因的分析和克隆第64-65页
        3.2.3 载体构建第65页
        3.2.4 大肠杆菌转化第65页
        3.2.5 农杆菌转化第65页
        3.2.6 表型鉴定第65-66页
    3.3 实验结果第66-78页
        3.3.1 毛竹miR159编码基因全长克隆和序列分析第66-68页
        3.3.2 毛竹PremiR159可不同程度恢复mir159ab双突体表型第68-71页
        3.3.3 毛竹PremiR159异源转化拟南芥表型初步分析第71-72页
        3.3.4 毛竹PremiR159影响超表达拟南芥花药的开裂第72-77页
        3.3.5 毛竹PremiR159异源转化影响拟南芥花药开裂基因表达第77-78页
    3.4 讨论第78-81页
        3.4.1 毛竹PremiR159结构和功能具有保守性第78-79页
        3.4.2 毛竹miR159超表达可影响转基因拟南芥花药裂口区的开裂第79-81页
    3.5 小结第81-82页
第四章 毛竹R2R3MYB基因家族的生物信息学和表达模式分析第82-106页
    4.1 试验材料第83-84页
    4.2 试验方法第84-86页
        4.2.1 在毛竹和其他物种中R2R3MYB和GAST基因的确定第84页
        4.2.2 序列分析和进化树建立第84-85页
        4.2.3 毛竹R2R3MYB家族Ka/Ks计算第85页
        4.2.4 基因表达量分析第85-86页
        4.2.5 共表达网络建立第86页
    4.3 实验结果第86-100页
        4.3.1 毛竹R2R3MYB和GAST家族成员的鉴定第86-87页
        4.3.2 毛竹R2R3MYB基因家族进化树分析第87-90页
        4.3.3 毛竹R2R3MYB家族序列的保守性和特征性分析第90-94页
        4.3.4 毛竹R2R3MYB和GAST基因表达模式分析第94-99页
        4.3.5 毛竹R2R3MYB和GAST共表达网络分析第99-100页
    4.4 讨论第100-105页
        4.4.1 毛竹R2R3MYB基因家族第100-101页
        4.4.2 毛竹R2R3MYB基因家族序列的保守性和特异性第101-102页
        4.4.3 毛竹R2R3MYB和GAST基因家族参与了毛竹花的发育第102-104页
        4.4.4 毛竹R2R3MYB和GAST基因共表达网络建立第104-105页
    4.5 小结第105-106页
第五章 毛竹GAMYB基因对花药发育调控研究第106-128页
    5.1 试验材料第106-107页
        5.1.1 植物材料第106页
        5.1.2 酶和试剂第106-107页
        5.1.3 菌株和载体第107页
    5.2 试验方法第107-109页
        5.2.1 植物DNA提取第107页
        5.2.2 PheGAMYBs的获取和靶切位点突变第107页
        5.2.3 载体构建第107页
        5.2.4 大肠杆菌转化第107-108页
        5.2.5 农杆菌转化第108页
        5.2.6 表型鉴定第108页
        5.2.7 PheGAMYBs亚细胞定位分析第108页
        5.2.8 PheGAMYBs转录激活活性分析第108页
        5.2.9 酵母单杂第108-109页
    5.3 实验结果第109-124页
        5.3.1 毛竹GAMYBs基因序列和进化分析第109-110页
        5.3.2 毛竹GAMYBs亚细胞定位分析第110-111页
        5.3.3 毛竹GAMYBs转录激活活性鉴定第111-113页
        5.3.4 毛竹GAMYBs异源转化拟南芥表型初步分析第113-115页
        5.3.5 毛竹GAMYBs影响超表达株系花粉发育第115-120页
        5.3.6 毛竹GAMYBs影响花粉发育相关基因的表达第120-122页
        5.3.7 酵母单杂体外鉴定毛竹中PheMYB2R-42下游基因第122-124页
    5.4 讨论第124-127页
        5.4.1 毛竹GAMYB基因具有保守性和特殊性第124页
        5.4.2 毛竹GAMYBs基因调控转基因拟南芥花粉发育第124-126页
        5.4.3 毛竹PheMYB2R-42可在体外结合PheDATP3启动子第126-127页
    5.5 小结第127-128页
第六章 结论与展望第128-130页
    6.1 结论第128页
    6.2 展望第128-130页
参考文献第130-144页
附录第144-150页
缩略词表第150-151页
在读期间的学术研究第151-153页
致谢第153-154页

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