| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| 英文缩略表 | 第16-17页 |
| 第一章 引言 | 第17-27页 |
| 1.1 玉米起源及其在国民经济中的重要性 | 第17-18页 |
| 1.2 植物育种方法的发展 | 第18-20页 |
| 1.2.1 表型选择育种 | 第18页 |
| 1.2.2 最优线性无偏预测育种 | 第18-19页 |
| 1.2.3 分子辅助选择育种 | 第19-20页 |
| 1.2.3.1 QTL定位与GWAS分析 | 第19-20页 |
| 1.2.3.2 分子辅助选择在植物育种中的应用 | 第20页 |
| 1.3 全基因组选择育种策略 | 第20-26页 |
| 1.3.1 全基因组选择育种流程 | 第21页 |
| 1.3.2 全基因组选择预测准确度影响因素 | 第21-24页 |
| 1.3.2.1 训练群体大小 | 第21-22页 |
| 1.3.2.2 分子标记密度 | 第22页 |
| 1.3.2.3 训练群体与预测群体间的亲缘关系 | 第22-23页 |
| 1.3.2.4 统计模型 | 第23页 |
| 1.3.2.5 遗传率 | 第23-24页 |
| 1.3.3 GS在植物育种中的应用 | 第24页 |
| 1.3.4 全基因组选择与遗传增益 | 第24-26页 |
| 1.4 本试验研究的目的及意义 | 第26-27页 |
| 第二章 全基因组选择预测准确度的影响因素 | 第27-47页 |
| 2.1 引言 | 第27-29页 |
| 2.2 材料与方法 | 第29-33页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第29页 |
| 2.2.2 田间试验方法 | 第29-30页 |
| 2.2.3 田间表型鉴定 | 第30页 |
| 2.2.4 表型数据分析方法 | 第30-31页 |
| 2.2.5 基因型数据分析 | 第31页 |
| 2.2.6 GS预测准确度的影响因素及其设置 | 第31页 |
| 2.2.7 统计模型 | 第31-32页 |
| 2.2.8 统计模型间聚类分析 | 第32-33页 |
| 2.2.9 交叉验证 | 第33页 |
| 2.3 结果 | 第33-43页 |
| 2.3.1 不同群体各性状的方差和遗传率 | 第33-34页 |
| 2.3.2 不同群体各性状间的相关性 | 第34-37页 |
| 2.3.3 标记密度、群体大小和遗传率对预测准确度的影响 | 第37-39页 |
| 2.3.4 训练集与测试集间群体大小比率对预测准确度的影响 | 第39-40页 |
| 2.3.5 训练群体与预测群体间亲缘关系对预测准确度的影响 | 第40-42页 |
| 2.3.6 不同统计模型对预测准确度的影响 | 第42-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-47页 |
| 第三章 基于表型GWAS和QTL的全基因组选择研究 | 第47-61页 |
| 3.1 引言 | 第47-48页 |
| 3.2 材料与方法 | 第48-51页 |
| 3.2.1 试验材料与田间试验方法 | 第48页 |
| 3.2.2 表型数据分析 | 第48页 |
| 3.2.3 基因型数据分析 | 第48-50页 |
| 3.2.4 QTL定位分析 | 第50页 |
| 3.2.5 全基因组关联分析 | 第50页 |
| 3.2.6 全基因组选择分析 | 第50-51页 |
| 3.3 结果 | 第51-59页 |
| 3.3.1 自然群体主成分和LD | 第51-52页 |
| 3.3.2 自然群体产量相关性状的GWAS位点及其候选基因 | 第52-53页 |
| 3.3.3 双亲群体产量相关性状的QTL及其候选基因 | 第53-56页 |
| 3.3.4 基于性状相关位点的全基因组选择 | 第56-59页 |
| 3.4 讨论 | 第59-61页 |
| 第四章 基于一般配合力GWAS和QTL的全基因组选择 | 第61-73页 |
| 4.1 引言 | 第61-62页 |
| 4.2 材料与方法 | 第62-63页 |
| 4.2.1 试验材料 | 第62页 |
| 4.2.2 田间试验方法 | 第62页 |
| 4.2.3 数据分析 | 第62-63页 |
| 4.2.4 基因型数据 | 第63页 |
| 4.2.5 QTL定位分析与关联分析 | 第63页 |
| 4.2.6 全基因组选择分析方法 | 第63页 |
| 4.3 结果 | 第63-71页 |
| 4.3.1 不同群体各性状的配合力方差和遗传率 | 第63-65页 |
| 4.3.2 自然群体产量相关性状一般配合力的GWAS位点及其候选基因 | 第65-66页 |
| 4.3.3 双亲群体产量相关性状一般配合力的QTL及其候选基因 | 第66-69页 |
| 4.3.4 基于性状GCA相关位点的全基因组选择 | 第69-71页 |
| 4.4 讨论 | 第71-73页 |
| 第五章 双亲群体不同世代间及测交表现的全基因组选择研究 | 第73-81页 |
| 5.1 引言 | 第73-74页 |
| 5.2 材料与方法 | 第74-75页 |
| 5.2.1 试验材料 | 第74页 |
| 5.2.2 田间试验设计及表型调查 | 第74页 |
| 5.2.3 表型和基因型数据分析 | 第74页 |
| 5.2.4 全基因组选择分析 | 第74-75页 |
| 5.3 结果 | 第75-79页 |
| 5.3.1 双亲群体不同世代间全基因组选择 | 第75-76页 |
| 5.3.2 双亲群体不同世代间测交后代的全基因组选择 | 第76-79页 |
| 5.4 讨论 | 第79-81页 |
| 第六章 全文结论 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-99页 |
| 附录 | 第99-101页 |
| 致谢 | 第101-102页 |
| 作者简历 | 第102页 |
