| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 第一部分 猪内脏与胴体重的GWAS分析 | 第8-25页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-12页 |
| 1.1 猪内脏和胴体重的研究 | 第8-9页 |
| 1.1.1 内脏与胴体重的QTL定位研究进展 | 第8-9页 |
| 1.2 全基因组关联分析（GWAS） | 第9-10页 |
| 1.2.1 GWAS概述 | 第9页 |
| 1.2.2 GWAS在家畜QTL定位中的应用 | 第9页 |
| 1.2.3 单群体GWAS分析 | 第9-10页 |
| 1.2.4 多群体荟萃分析Meta-GWAS | 第10页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第10-12页 |
| 第二章 研究正文 | 第12-25页 |
| 2.1 引言 | 第12页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第12-13页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第12页 |
| 2.2.2 表型测定 | 第12页 |
| 2.2.3 基因型数据的获取 | 第12-13页 |
| 2.2.3.1 DNA提取 | 第12-13页 |
| 2.2.3.2 高通量分型 | 第13页 |
| 2.3 实验结果 | 第13-23页 |
| 2.3.1 内脏重与胴体重的表型统计学分析 | 第13-15页 |
| 2.3.2 影响内脏重和胴体重的GWAS分析结果 | 第15-22页 |
| 2.3.2.1 影响心脏重的GWAS分析结果 | 第15-16页 |
| 2.3.2.2 影响肝脏重的GWAS分析结果 | 第16-17页 |
| 2.3.2.3 影响脾脏重的GWAS分析结果 | 第17-18页 |
| 2.3.2.4 影响肾脏中的GWAS分析结果 | 第18-19页 |
| 2.3.2.5 影响胴体重的GWAS分析结果 | 第19-22页 |
| 2.3.3 影响内脏重和胴体重的Meta-GWAS分析结果 | 第22-23页 |
| 2.4.分析与讨论 | 第23-24页 |
| 2.4.1 内脏重与胴体重GWAS分析与前人研究结果的比较 | 第23页 |
| 2.4.2 种群遗传异质性 | 第23-24页 |
| 2.4.3 基因多效性 | 第24页 |
| 2.5 小结 | 第24-25页 |
| 第二部分 猪肉C20:0 脂肪酸含量变异的遗传解析 | 第25-45页 |
| 第一章 文献综述 | 第25-29页 |
| 3.1 脂肪酸概述 | 第25-28页 |
| 3.1.1 花生酸（C20:0）的研究进展 | 第25-28页 |
| 3.1.1.1 C20:0 与炎症反应 | 第25页 |
| 3.1.1.2 C20:0 与内质网应激（ERS） | 第25-26页 |
| 3.1.1.3 C20:0 与TLR4（toll-like receptor 4）信号通路 | 第26-27页 |
| 3.1.1.4 C20:0 含量相关的QTL定位的前期研究结果 | 第27-28页 |
| 3.1.1.4.1 QTL连锁分析结果 | 第27页 |
| 3.1.1.4.2 GWAS QTL定位结果 | 第27-28页 |
| 3.2 本研究的目的和意义 | 第28-29页 |
| 第二章 研究正文 | 第29-45页 |
| 4.1 引言 | 第29页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第29-31页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第29页 |
| 4.2.2 表型测定 | 第29页 |
| 4.2.3 总RNA的提取及反转录 | 第29页 |
| 4.2.4 Taqman探针分型 | 第29-30页 |
| 4.2.5 统计分析 | 第30-31页 |
| 4.2.5.1 多群体GWAS验证 | 第30-31页 |
| 4.2.5.2 单倍型关联分析 | 第31页 |
| 4.2.5.3 IBD分析 | 第31页 |
| 4.3 结果 | 第31-42页 |
| 4.3.1 C20:0 含量的表型统计学分析结果 | 第31页 |
| 4.3.2 扩大群体的GWAS分析结果 | 第31-34页 |
| 4.3.2.1 单群体GWAS分析结果 | 第32-33页 |
| 4.3.2.2 五个群体的meta-GWAS分析结果 | 第33-34页 |
| 4.3.3 影响C20:0 含量的精细定位 | 第34-36页 |
| 4.3.3.1 单倍型关联分析 | 第34-35页 |
| 4.3.3.1.1 F2群体的单倍型关联分析结果 | 第34页 |
| 4.3.3.1.2 苏太群体单倍型关联分析结果 | 第34-35页 |
| 4.3.3.2 IBD分析 | 第35-36页 |
| 4.3.3.2.1 F2资源家系IBD分析结果 | 第35-36页 |
| 4.3.3.2.2 苏太家系IBD分析结果 | 第36页 |
| 4.3.4 目的区域候选基因的分析结果 | 第36-37页 |
| 4.3.5 F2群体中ELOVL7基因的眼肌组织表达分析结果 | 第37-38页 |
| 4.3.6 ELOVL7基因内多态位点的鉴别 | 第38-39页 |
| 4.3.7 加入候选SNPs分型结果后的GWAS分析 | 第39-42页 |
| 4.3.7.1 两个候选SNPs在五个群体中的分型 | 第39-40页 |
| 4.3.7.2 加入两个候选SNPs后的GWAS分析 | 第40-42页 |
| 4.4 分析与讨论 | 第42-44页 |
| 4.4.1 候选基因ELOVL7的研究进展 | 第42-43页 |
| 4.4.1.1 ELOVL7在脂肪酸延伸中的作用 | 第42页 |
| 4.4.1.2 ELOVL7在前列腺癌发病中的研究进展 | 第42-43页 |
| 4.4.1.3 ELOVL7与线粒体肌病 | 第43页 |
| 4.4.2 影响C20:0 的QTL的精细定位 | 第43-44页 |
| 4.5 小结 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-48页 |
| 附录 | 第48-65页 |
| 附录1内脏和胴体重表型相关性分析结果（95%的置信区间和标准差） | 第48-50页 |
| 附录2研究性状中所有达到显著性阈值的SNPs | 第50-64页 |
| 附录 3 F2和苏太群体中单倍型显著性检验 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
