| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-28页 |
| 1 海洋环境中多环芳烃污染的来源、归宿及治理 | 第14-17页 |
| 1.1 海洋环境中多环芳烃污染的来源、危害与归宿 | 第14-16页 |
| 1.2 海洋环境中多环芳烃污染的治理与修复 | 第16-17页 |
| 2 海洋环境中的多环芳烃降解微生物及基因资源 | 第17-21页 |
| 2.1 海洋专性解烃菌的研究进展 | 第17-19页 |
| 2.2 海洋环境多环芳烃降解基因资源的研究与利用 | 第19-21页 |
| 3 海洋环境 HMW PAHs的微生物降解研究进展 | 第21-26页 |
| 3.1 HMW PAHs 的生物降解研究进展 | 第21-24页 |
| 3.2 海洋环境 HMW PAHs 降解过程中微生物互作的研究进展 | 第24-25页 |
| 3.3 海洋环境 HMW PAHs 降解过程中微生物共培养体系的构建及应用的研究现状 | 第25-26页 |
| 4 本研究目的及意义 | 第26-28页 |
| 第二章 海洋 PAHs 降解菌的分离及初步鉴定 | 第28-54页 |
| 0 前言 | 第28-29页 |
| 1 材料和试剂 | 第29-34页 |
| 1.1 试剂和仪器 | 第29-31页 |
| 1.2 海洋沉积物样品 | 第31-32页 |
| 1.3 引物 | 第32-33页 |
| 1.4 培养基 | 第33-34页 |
| 1.5 分析软件 | 第34页 |
| 2 方法 | 第34-40页 |
| 2.1 原油降解菌群的富集、转接 | 第34页 |
| 2.2 PAHs 降解菌群的富集、转接 | 第34-35页 |
| 2.3 可培养细菌的分离及原油、PAHs 降解菌的验证 | 第35页 |
| 2.4 PAHs 降解范围测定 | 第35页 |
| 2.5 典型 PAHs 菲降解率测定 | 第35-36页 |
| 2.6 细菌基因组 DNA 的提取 | 第36-37页 |
| 2.7 16S rRNA 的扩增、测序、比对及系统发育分析 | 第37页 |
| 2.8 DGGE 分析降解菌群结构 | 第37-39页 |
| 2.9 细菌培养物表面张力测定 | 第39页 |
| 2.10 菌株的负染及透射电镜观察 | 第39-40页 |
| 3 实验结果 | 第40-52页 |
| 3.1 降解菌群中可培养细菌的分离和鉴定 | 第40-44页 |
| 3.2 解环菌属细菌的初步鉴定以及协同菌株的初步筛选 | 第44-51页 |
| 3.3 菌群结构分析 | 第51-52页 |
| 4 讨论 | 第52-54页 |
| 第三章 解环菌属细菌的 PAHs 代谢特性及其 PAHs 双加氧酶基因分析 | 第54-65页 |
| 0 前言 | 第54页 |
| 1 材料和试剂 | 第54-56页 |
| 1.1 试剂 | 第54-55页 |
| 1.2 引物 | 第55页 |
| 1.3 培养基 | 第55页 |
| 1.4 分析软件 | 第55-56页 |
| 2 方法 | 第56-58页 |
| 2.1 细菌基因组 DNA 的提取 | 第56页 |
| 2.2 PAHs 起始双加氧酶全基因的克隆、比对分析 | 第56页 |
| 2.3 连接 PCR 片段至 T 载体 | 第56-57页 |
| 2.4 转化 E. coli DH5α感受态细胞 | 第57页 |
| 2.5 菌落 PCR | 第57页 |
| 2.6 阳性克隆的测序及比对分析 | 第57-58页 |
| 2.7 解环菌对典型 PAHs 菲、芘、荧蒽的降解实验 | 第58页 |
| 3 实验结果 | 第58-62页 |
| 3.1 解环菌属细菌的 PAHs 降解范围 | 第58-59页 |
| 3.2 解环菌属细菌的 PAHs 降解率 | 第59-60页 |
| 3.3 解环菌属细菌 PAHs 双加氧酶基因分析 | 第60-62页 |
| 4 讨论 | 第62-65页 |
| 第四章 海洋 PAHs 降解菌新种的鉴定 | 第65-99页 |
| 0 前言 | 第65-66页 |
| 1 材料和试剂 | 第66-68页 |
| 1.1 菌株 | 第66页 |
| 1.2 试剂和仪器 | 第66-67页 |
| 1.3 培养基 | 第67-68页 |
| 1.4 分析软件 | 第68页 |
| 2 方法 | 第68-72页 |
| 2.1 菌株负染及透射电镜观察 | 第68页 |
| 2.2 基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析 | 第68-69页 |
| 2.3 细菌生化指标的测定 | 第69页 |
| 2.4 菌株生长的温度、盐度、初始 pH 范围 | 第69页 |
| 2.5 菌株抗性实验 | 第69页 |
| 2.6 细菌基因组 DNA 的提取以及 DNA G+C 含量测定 | 第69-70页 |
| 2.7 细菌的全细胞脂肪酸含量测定 | 第70-71页 |
| 2.8 Biolog 碳源利用情况测定 | 第71页 |
| 2.9 细菌细胞呼吸醌的测定 | 第71页 |
| 2.10 DNA 杂交实验 | 第71页 |
| 2.11 菌株烷烃降解能力测定 | 第71-72页 |
| 2.12 菌株 PAHs 降解能力测定 | 第72页 |
| 3 实验结果 | 第72-95页 |
| 3.1 PAHs 降解菌新种 Marinobacter sp. PY97S 的鉴定 | 第72-78页 |
| 3.2 PAHs 降解菌新种 Marinobacter nanhaiticus D15-8W~T的鉴定 | 第78-85页 |
| 3.3 PAHs 降解菌新种 Marinobacter aromaticivorans D15-8P~T的鉴定 | 第85-95页 |
| 4 讨论 | 第95-99页 |
| 4.1 海洋 PAHs 降解菌新种 Marinobacter sp. PY97S 的鉴定 | 第95-97页 |
| 4.2 海洋 PAHs 降解菌新种 Marinobacter nanhaiticus D15-8W~T的鉴定 | 第97-98页 |
| 4.3 海洋 PAHs 降解菌新种 Marinobacter aromaticivorans D15-8P~T的鉴定 | 第98-99页 |
| 第五章 细菌间协同降解 HMW PAHs 的研究 | 第99-114页 |
| 0 前言 | 第99-100页 |
| 1 材料和试剂 | 第100-102页 |
| 1.1 试剂和仪器 | 第100页 |
| 1.2 菌株 | 第100-101页 |
| 1.3 培养基 | 第101-102页 |
| 2 方法 | 第102-105页 |
| 2.1 共培养体系的构建及 HMW PAHs 降解实验 | 第102页 |
| 2.2 菌群 PY97M + D15-8W 对 HMW PAHs 混合碳源的降解实验 | 第102-103页 |
| 2.3 较低温度条件下菌群 PY97M + D15-8W 对 HMW PAHs 的降解实验 | 第103页 |
| 2.4 样品前处理及 HMW PAHs 降解率测定 | 第103页 |
| 2.5 发光细菌法检测 HMW PAHs 代谢中间产物的生物毒性 | 第103-105页 |
| 3 实验结果 | 第105-112页 |
| 3.1 构建的共培养体系中的细菌 | 第105-107页 |
| 3.2 不同共培养体系对芘的降解率 | 第107-108页 |
| 3.3 不同共培养体系对荧蒽的降解率 | 第108-109页 |
| 3.4 降解菌群 PY97M + D15-8W 对 HMW PAHs 混合碳源的降解率 | 第109-110页 |
| 3.5 菌群 PY97M + D15-8W 降解 HMW PAHs 混合碳源的代谢产物生物毒性 | 第110-111页 |
| 3.6 较低温度条件下菌群 PY97M + D15-8W 对 HMW PAHs 的降解率 | 第111-112页 |
| 4 讨论 | 第112-114页 |
| 第六章 结论及后续工作 | 第114-116页 |
| 1 结论 | 第114-115页 |
| 2 后续工作 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
| 个人简历 | 第132页 |
| 发表的学术论文 | 第132-133页 |
