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SCSMV-P1蛋白抑制RNA沉默的关键结构域及氨基酸定位

摘要第10-11页
Abstract第11页
第一章 文献综述第12-22页
    1.1 RNA沉默与植物病毒第12-19页
        1.1.1 RNA沉默第12-13页
        1.1.2 RNA沉默的作用机制第13-14页
        1.1.3 病毒RNA沉默抑制子第14-15页
        1.1.4 病毒RNA沉默抑制子的作用机制第15-18页
        1.1.5 RNA沉默在抗病毒中的应用第18-19页
    1.2 甘蔗条纹花叶病毒及其P1蛋白结构和功能第19-20页
        1.2.1 甘蔗条纹花叶病毒基因组结构第19页
        1.2.2 甘蔗条纹花叶病毒基因功能第19页
        1.2.3 不同植物病毒P1蛋白沉默抑制子功能第19-20页
    1.3 本研究的目的和意义第20-22页
第二章 材料与方法第22-35页
    2.1 植物材料与培养条件第22页
    2.2 质粒及菌株第22页
    2.3 试剂及配制第22-23页
        2.3.1 相关试剂第22-23页
        2.3.2 所有溶液配制第23页
    2.4 载体构建第23-29页
        2.4.1 pGD-3xflag-SCSMV P1/HC-Pro双元表达载体第23页
        2.4.2 片段缺失载体构建第23-26页
        2.4.3 点突变系列载体构建第26页
        2.4.4 酵母双杂交载体构建第26-28页
        2.4.5 双分子荧光互补载体构建第28-29页
    2.5 质粒提取第29-30页
    2.6 农杆菌介导的瞬时表达第30-31页
        2.6.1 农杆菌转化第30页
        2.6.2 农杆菌介导瞬时表达第30-31页
    2.7 长波紫外灯观察与拍照第31页
    2.8 Western blot第31-32页
        2.8.1 蛋白提取第31页
        2.8.2 Bio-Rad蛋白定量第31页
        2.8.3 Western杂交第31-32页
    2.9 酵母双杂交(Y2H)第32-33页
        2.9.1 酵母感受态的制备第32-33页
        2.9.2 酵母同源重组转化及鉴定第33页
    2.10 双分子荧光互补(BiFC)第33-34页
    2.11 蛋白质结构预测第34-35页
第三章 结果与分析第35-55页
    3.1 SCSMV P1沉默抑制子抑制局部GFP基因沉默第35-36页
    3.2 HC-Pro会削弱P1沉默抑制子活性第36-38页
    3.3 P1蛋白与HC-Pro蛋白之间互作验证第38-40页
        3.3.1 Y2H验证P1与HC-Pro之间蛋白互作第38-39页
        3.3.2 BiFC验证P1与HC-Pro无直接互作第39-40页
    3.4 SCSMV-P1蛋白功能生物信息学预测分析第40-47页
        3.4.1 SCSMV-P1蛋白理化性质第40-41页
        3.4.2 SCSMV-P1蛋白磷酸化位点预测第41页
        3.4.3 SCSMV-P1蛋白亲疏水性和跨膜区,跨膜方向预测第41-42页
        3.4.4 SCSMV-P1蛋白二级结构预测第42-43页
        3.4.5 SCSMV-P1保守结构域分析第43-44页
        3.4.6 SCSMV-P1选择压力分析第44-45页
        3.4.7 SCSMV-P1保守位点分析第45-46页
        3.4.8 SCSMV-P1蛋白三级结构预测分析第46-47页
    3.5 SCSMV-P1抑制RNA沉默的关键氨基酸及功能域定位第47-55页
        3.5.1 SCSMV-P1片段缺失和点突变载体构建及测序验证第47-49页
        3.5.2 SCSMV-P1全序列分段突变体抑制RNA沉默活性分析第49-50页
        3.5.3 SCSMV-P1保守结构域缺失突变体抑制RNA沉默活性分析第50-52页
        3.5.4 SCSMV-P1点突变体抑制RNA沉默活性分析第52-55页
第四章 讨论第55-59页
    4.1 SCSMV编码的P1蛋白是RNA沉默抑制子第55页
    4.2 HC-Pro对P1抑制RNA沉默的影响第55-56页
    4.3 影响P1沉默抑制子活性功能结构域和关键氨基酸残基第56-59页
第五章 结论与展望第59-60页
    5.1 结论第59页
    5.2 展望第59-60页
参考文献第60-66页
致谢第66-67页
附录第67-77页
攻读学位期间的学术论文与研究成果第77页

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