| 符号说明 | 第4-5页 |
| 项目资助 | 第5-8页 |
| 中文摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9页 |
| 1 前言 | 第10-23页 |
| 1.1 榕树与榕小蜂 | 第10-14页 |
| 1.1.1 榕树 | 第10-11页 |
| 1.1.1.1 榕果结构 | 第10页 |
| 1.1.1.2 榕小孔 | 第10-11页 |
| 1.1.1.3 榕果的发育时期 | 第11页 |
| 1.1.2 榕小蜂 | 第11-14页 |
| 1.1.2.1 雌雄传粉榕小蜂的形态特征差异 | 第12-13页 |
| 1.1.2.2 雌雄传粉榕小蜂的生活环境差异 | 第13页 |
| 1.1.2.3 榕树与榕小蜂的协同进化 | 第13-14页 |
| 1.2 转录因子简介 | 第14-17页 |
| 1.2.1 转录因子分类 | 第14页 |
| 1.2.2 转录因子的结构 | 第14-15页 |
| 1.2.2.1 DNA结构域 | 第14-15页 |
| 1.2.2.2 效应结构域 | 第15页 |
| 1.2.3 转录因子预测方法 | 第15-17页 |
| 1.2.3.1 转录因子预测方法简介 | 第15页 |
| 1.2.3.2 基于DBD数据库预测转录因子 | 第15-17页 |
| 1.3 转录组 | 第17-21页 |
| 1.3.1 转录组学简介 | 第17-18页 |
| 1.3.2 转录组研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3.3 RNA-Seq原理 | 第19-20页 |
| 1.3.4 RNA-Seq的应用 | 第20-21页 |
| 1.3.4.1 编码基因表达谱研究 | 第20页 |
| 1.3.4.2 非编码基因表达谱研究 | 第20-21页 |
| 1.3.4.3 疾病的应用研究 | 第21页 |
| 1.3.5 榕小蜂的转录组数据 | 第21页 |
| 1.4 立题思路 | 第21-23页 |
| 2 方法简介 | 第23-25页 |
| 2.1 转录因子预测 | 第23-24页 |
| 2.1.1 通用转录因子预测方法 | 第23页 |
| 2.1.2 特异性转录因子预测方法 | 第23-24页 |
| 2.2 进化分析和聚类分析 | 第24页 |
| 2.3 基因组数据和转录组数据 | 第24页 |
| 2.4 差异表达基因分析 | 第24页 |
| 2.5 发育阶段 | 第24-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-40页 |
| 3.1 膜翅目3个物种间DNA结构域的数目比较 | 第25-26页 |
| 3.2 DNA结构域的进化分析 | 第26-29页 |
| 3.3 传粉榕小蜂中的基因表达情况 | 第29-30页 |
| 3.4 榕小蜂中的转录因子表达情况 | 第30-31页 |
| 3.5 转录因子的表达量与基因的表达量比较 | 第31-32页 |
| 3.6 从结构域角度分析转录因子的表达模式 | 第32-33页 |
| 3.7 具有homeobox和forkhead结构域的转录因子是低表达的 | 第33-34页 |
| 3.8 转录因子在不同时期的差异表达情况 | 第34-35页 |
| 3.9 组间差异表达的转录因子和阶段特异性表达的转录因子 | 第35-37页 |
| 3.10 差异表达的转录因子与差异表达的基因之间的联系 | 第37-40页 |
| 4 讨论 | 第40-42页 |
| 4.1 膜翅目的转录因子DNA结构域之间的差异比较 | 第40页 |
| 4.2 传粉榕小蜂的功能比较 | 第40页 |
| 4.3 从结构域角度分析差异表达 | 第40-41页 |
| 4.4 低表达的转录因子结构域 | 第41页 |
| 4.5 不同时期的差异表达情况 | 第41-42页 |
| 5 结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-50页 |
| 附录 | 第50-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
