| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第9-14页 |
| 1.1 抗生素抗性基因污染 | 第9-11页 |
| 1.1.1 抗生素抗性基因污染国内外研究现状 | 第9-10页 |
| 1.1.2 抗生素抗性基因污染来源及传播机制 | 第10页 |
| 1.1.3 抗生素抗性基因污染治理方法 | 第10-11页 |
| 1.2 剩余污泥的处理处置 | 第11-12页 |
| 1.2.1 剩余污泥的处理处置方法及污泥脱水 | 第11页 |
| 1.2.2 污泥脱水预调理方法 | 第11-12页 |
| 1.2.3 污泥生物沥浸 | 第12页 |
| 1.3 研究目的及内容 | 第12-14页 |
| 1.3.1 研究目的意义 | 第12-13页 |
| 1.3.2 研究内容 | 第13-14页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第14-23页 |
| 2.1 生物酸化铁氧化深度脱水工艺供试菌种及反应器组成结构 | 第14-15页 |
| 2.1.1 供试菌种 | 第14页 |
| 2.1.2 生物酸化铁氧化深度脱水工艺反应器构建 | 第14-15页 |
| 2.2 样品采集及DNA提取方法 | 第15-16页 |
| 2.2.1 样品采集及样品预处理 | 第15页 |
| 2.2.2 污泥样本DNA的提取 | 第15-16页 |
| 2.2.3 样品DNA纯度和质量的测定 | 第16页 |
| 2.3 聚合酶链式反应实验(PolymeraseChainReaction,PCR) | 第16-20页 |
| 2.3.1 定性PCR实验 | 第16-17页 |
| 2.3.2 荧光定量PCR实验 | 第17页 |
| 2.3.3 定量PCR运行程序 | 第17页 |
| 2.3.4 高通量定量PCR实验 | 第17-20页 |
| 2.4 嗜酸性氧化亚铁硫杆菌特异性基因引物 | 第20页 |
| 2.5 定量PCR标准曲线绘制 | 第20-21页 |
| 2.6 16SrRNA基因高通量测序实验 | 第21页 |
| 2.7 供试菌株A.ferrooxidansXJF8基因组扫描测序 | 第21-22页 |
| 2.8 统计分析方法 | 第22-23页 |
| 第三章 生物酸化铁氧化深度脱水工艺对污泥ARGs的去除效果 | 第23-29页 |
| 3.1 实验设计思路 | 第23页 |
| 3.2 工艺处理各阶段污泥中目的抗生素抗性基因的检出 | 第23-24页 |
| 3.3 污泥抗生素抗性基因在工艺处理过程中的相对丰度变化 | 第24-27页 |
| 3.3.1 总抗生素抗性基因丰度变化趋势 | 第24-26页 |
| 3.3.2 污泥中抗生素抗性基因的去除效率 | 第26-27页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第27-29页 |
| 第四章 污泥菌群结构变化对污泥目的ARGs的去除影响 | 第29-40页 |
| 4.1 实验设计思路 | 第29页 |
| 4.2 数据质控及物种注释评估 | 第29-31页 |
| 4.3 生物酸化铁氧化深度脱水工艺对污泥中细菌群落结构组成的影响 | 第31-36页 |
| 4.3.1 生物酸化铁氧化深度脱水工艺处理过程中污泥菌群生物多样性变化 | 第31-32页 |
| 4.3.2 样本污泥在门和属水平上的优势菌群变化 | 第32-34页 |
| 4.3.3 样本污泥菌群优势菌属相对丰度的变化 | 第34-35页 |
| 4.3.4 供试菌A.ferrooxidansXJF8在工艺运行过程中的相对丰度变化 | 第35-36页 |
| 4.4 关联分析 | 第36-39页 |
| 4.4.1 pH和Fe2+对工艺运行过程中样本污泥菌群结构的影响 | 第36-37页 |
| 4.4.2 污泥菌群结构变化对污泥中ARGs相对丰度的影响 | 第37-39页 |
| 4.5 结果与讨论 | 第39-40页 |
| 第五章 供试菌株A.ferrooxidansXJF8全基因组扫描测序 | 第40-49页 |
| 5.1 实验设计思路 | 第40页 |
| 5.2 供试菌株A.ferrooxidansXJF8基因组基本特征分析 | 第40-42页 |
| 5.2.1 供试菌株A.ferrooxidansXJF8全基因组序列扫描圈图绘制 | 第40-41页 |
| 5.2.2 供试菌株A.ferrooxidansXJF8基因组基本特征比较分析 | 第41-42页 |
| 5.3 供试菌株A.ferrooxidansXJF8基因组基因功能预测分析 | 第42-47页 |
| 5.3.1 COG功能分析 | 第42-43页 |
| 5.3.2 GO注释统计 | 第43-44页 |
| 5.3.3 KEGG通路分析 | 第44-47页 |
| 5.3.4 CARD分析 | 第47页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第47-49页 |
| 第六章 结论与展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
