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纤维堆囊菌So0157-2木聚糖酶Xyn11B催化域的结构与性质研究

摘要第10-12页
Abstract第12-13页
符号说明及缩略词第14-16页
第一章 文献综述第16-34页
    1.1 蛋白质晶体学第16-23页
        1.1.1 测定蛋白质结构的基本步骤第17页
        1.1.2 蛋白质的结晶和结晶条件的筛选与优化第17-21页
        1.1.3 X射线衍射数据的收集第21-22页
        1.1.4 X射线衍射数据的处理第22-23页
    1.2 木聚糖酶概述第23-30页
        1.2.1 木聚糖的组成和结构第23-24页
        1.2.2 木聚糖酶的分类第24-25页
        1.2.3 GH11木聚糖酶第25-29页
        1.2.4 木聚糖酶的应用第29-30页
    1.3 纤维堆囊菌中的木聚糖酶第30-32页
        1.3.1 纤维堆囊菌概述第30-31页
        1.3.2 纤维堆囊菌So0157-2木聚糖酶研究进展第31-32页
    1.4 本论文工作开展思路和研究内容第32-34页
第二章 Xyn11B-C降解底物特性分析第34-40页
    2.1 实验材料第35-36页
        2.1.1 主要实验试剂和材料第35-36页
        2.1.2 主要仪器设备第36页
    2.2 实验方法第36-37页
        2.2.1 Xyn11B-C与PNP-X2作用及产物检测第36页
        2.2.2 Xyn11B-C与ANTS-Xn作用及产物检测第36-37页
    2.3 实验结果与讨论第37-38页
        2.3.1 Xyn11B-C与PNP-X2作用的产物分析第37页
        2.3.2 Xyn11B-C与ANTS-Xn作用的产物分析第37-38页
    2.4 本章小结第38-40页
第三章 Xyn11B-C的表达、纯化和结晶第40-57页
    3.1 实验材料第41-45页
        3.1.1 菌株和质粒第41页
        3.1.2 培养基第41页
        3.1.3 主要实验试剂第41-44页
        3.1.4 主要仪器第44-45页
    3.2 实验方法第45-51页
        3.2.1 Xyn11B-C氨基酸序列分析第45页
        3.2.2 表达载体的构建第45-48页
        3.2.3 目的蛋白的异源表达及纯化第48-50页
        3.2.4 Xyn11B-C蛋白质结晶条件的筛选和优化第50-51页
    3.3 实验结果与讨论第51-56页
        3.3.1 Xyn11B-C的氨基酸序列分析第51-52页
        3.3.2 表达载体的构建第52页
        3.3.3 目的蛋白的异源表达及纯化第52-55页
        3.3.4 Xyn11B-C的结晶条件筛选和优化第55-56页
    3.4 本章小结第56-57页
第四章 Xyn11B-C(E331A/Q)的表达、纯化及其与底物共晶的尝试第57-71页
    4.1 实验材料第58-59页
        4.1.1 菌株和质粒第58-59页
        4.1.2 培养基第59页
        4.1.3 主要实验试剂第59页
        4.1.4 主要仪器第59页
    4.2 实验方法第59-64页
        4.2.1 表达载体的构建第59-62页
        4.2.2 目的蛋白的异源表达及纯化第62-63页
        4.2.3 Xyn11B-C(E331A/Q)蛋白-底物共晶的尝试第63-64页
    4.3 实验结果与讨论第64-70页
        4.3.1 表达载体的构建第64页
        4.3.2 目的蛋白的诱导表达及纯化第64-65页
        4.3.3 Xyn11B-C(E331A)+X6共晶条件的筛选及优化第65-68页
        4.3.4 Xyn11B-C(E331Q)底物共晶的尝试第68-70页
        4.3.5 Xyn11B-C(E331Q)蛋白结晶的底物浸泡结果第70页
    4.4 本章小结第70-71页
第五章 Xyn11B-C与Xyn11B-C(E331Q)结构的获得和分析第71-82页
    5.1 实验材料第71页
        5.1.1 晶体衍射数据收集所需材料和仪器第71页
    5.2 实验方法第71-76页
        5.2.1 晶体衍射数据的测试和收集第71-73页
        5.2.2 衍射数据的处理第73-74页
        5.2.3 相角的求解第74-75页
        5.2.4 结构模型的建立第75页
        5.2.5 结构模型的修正第75-76页
    5.3 实验结果与讨论第76-81页
        5.3.1 Xyn11B-C晶体和Xyn11B-C(E331Q)晶体的衍射数据处理结果第76页
        5.3.2 Xyn11B-C的三维结构第76-80页
        5.3.3 Xyn11B-C(E331Q)的三维结构第80-81页
    5.4 本章小结第81-82页
总结与展望第82-83页
附录第83-86页
参考文献第86-92页
致谢第92-93页
攻读硕士期间主要研究成果第93-94页
学位论文评阅及答辩情况表第94页

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