| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 前言 | 第10-22页 |
| 1.1 引言 | 第10-11页 |
| 1.2 菊属植物系统学与菊花起源研究进展 | 第11-17页 |
| 1.2.1 基于形态学的研究 | 第11-13页 |
| 1.2.1.1 比较形态学和数量分类研究 | 第11-12页 |
| 1.2.1.2 种间杂交研究 | 第12-13页 |
| 1.2.2 基于细胞学的研究 | 第13-14页 |
| 1.2.3 基于同功酶的研究 | 第14页 |
| 1.2.4 基于限制性酶切和PCR技术的DNA分子标记研究 | 第14-17页 |
| 1.2.4.1 RFLP研究 | 第15页 |
| 1.2.4.2 RAPD研究 | 第15-16页 |
| 1.2.4.3 ISSR研究 | 第16页 |
| 1.2.4.4 AFLP研究 | 第16-17页 |
| 1.3 基于DNA序列的分子系统学研究进展 | 第17-20页 |
| 1.3.1 分子钟假说和中性进化理论简介 | 第17-19页 |
| 1.3.2 叶绿体DNA基因间隔序列在分子系统学中的应用 | 第19-20页 |
| 1.3.2.1 trnL-trnF间隔序列 | 第19页 |
| 1.3.2.2 rpl16,rps16内含子序列 | 第19-20页 |
| 1.3.3 叶绿体DNA序列在菊属植物分子系统学研究中的应用 | 第20页 |
| 1.4 本研究的内容、目的和意义 | 第20-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-36页 |
| 2.1 材料的采集 | 第22-25页 |
| 2.2 试验方法 | 第25-36页 |
| 2.2.1 药品及仪器 | 第25-27页 |
| 2.2.1.1 试验所用药品及配方 | 第25-26页 |
| 2.2.1.2 试验所用仪器 | 第26页 |
| 2.2.1.3 序列分析软件 | 第26-27页 |
| 2.2.2 基因组总DNA的提取与质量检测 | 第27-28页 |
| 2.2.2.1 基因组总DNA的提取 | 第27页 |
| 2.2.2.2 所提取基因组总DNA的质量检测 | 第27-28页 |
| 2.2.3 序列选择与引物设计 | 第28-32页 |
| 2.2.4 PCR扩增 | 第32-33页 |
| 2.2.4.1 PCR扩增反应体系 | 第32-33页 |
| 2.2.4.2 PCR扩增程序 | 第33页 |
| 2.2.4.3 PCR扩增产物的检测 | 第33页 |
| 2.2.5 目标序列的获取 | 第33-35页 |
| 2.2.5.1 PCR扩增产物测序 | 第33-34页 |
| 2.2.5.2 GeneBank中相关序列信息的获取 | 第34-35页 |
| 2.2.6 序列比对分析及系统进化树的构建 | 第35页 |
| 2.2.7 神农香菊和野菊形态学对比观察 | 第35页 |
| 2.2.8 神农香菊和野菊叶片挥发物质测定 | 第35-36页 |
| 2.2.8.1 气相色谱条件的确定 | 第35页 |
| 2.2.8.2 气质联用测定神农香菊和野菊叶片挥发物质 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-49页 |
| 3.1 基因组DNA提取方法的优化 | 第36页 |
| 3.2 序列的筛选 | 第36-37页 |
| 3.3 序列比对分析与系统进化树的构建 | 第37-45页 |
| 3.3.1 基于自测叶绿体基因组trnL-trnF序列的系统进化树构建 | 第37-39页 |
| 3.3.2 基于叶绿体基因组Chlp1序列的系统进化树构建 | 第39-41页 |
| 3.3.3 基于叶绿体matK-trnK序列的系统进化树构建 | 第41-43页 |
| 3.3.4 基于GeneBank trnL-trnF序列的系统进化树构建 | 第43-44页 |
| 3.3.5 基于GeneBank ITS序列的系统进化树构建 | 第44-45页 |
| 3.4 神农香菊与野菊的形态学观察 | 第45-47页 |
| 3.5 神农香菊与野菊叶片挥发物质的测定 | 第47-49页 |
| 4 讨论 | 第49-55页 |
| 4.1 关于叶绿体DNA序列在菊属植物分子系统学中的应用 | 第49-50页 |
| 4.2 关于ITS序列在菊属植物分子系统学中的应用 | 第50-51页 |
| 4.3 关于栽培菊花起源的探讨 | 第51-52页 |
| 4.4 关于基于限制性酶切和PCR的分子标记与基于序列的分子系统学方法对比 | 第52-53页 |
| 4.5 关于神农香菊的分类地位 | 第53页 |
| 4.6 存在的不足 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
