| 致谢 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 英文缩略语表 | 第10-13页 |
| 第一章 中国碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌多位点序列分型研究 | 第13-52页 |
| 引言 | 第13-15页 |
| 1 材料与方法 | 第15-23页 |
| 1.1 材料 | 第15-17页 |
| 1.1.1 菌株来源 | 第15-16页 |
| 1.1.2 试剂和仪器 | 第16-17页 |
| 1.2 研究方法 | 第17-23页 |
| 1.2.1 体外药物敏感性试验 | 第17-18页 |
| 1.2.2 多位点序列分型(MLST) | 第18-23页 |
| 2 MLST数据处理与分析流程 | 第23-38页 |
| 2.1 MLST数据处理 | 第23-26页 |
| 2.2 eBURST分析 | 第26-28页 |
| 2.3 Bionumerics分析 | 第28-38页 |
| 2.3.1 Bionumerics数据库的建立 | 第28-30页 |
| 2.3.2 MLST插件的安装与参数设置 | 第30-35页 |
| 2.3.3 MLST数据处理与分析 | 第35-38页 |
| 3 结果 | 第38-48页 |
| 3.1 MLST方案各管家基因特征 | 第38页 |
| 3.2 MLST分型结果 | 第38-42页 |
| 3.3 eBURST分析结果 | 第42-45页 |
| 3.4 Bionumerics分析结果 | 第45-46页 |
| 3.5 体外药物敏感性试验结果 | 第46-48页 |
| 4 讨论 | 第48-51页 |
| 5 小结 | 第51-52页 |
| 第二章 不动杆菌OXA耐药基因传播机制研究 | 第52-78页 |
| 引言 | 第52-54页 |
| 1 材料与方法 | 第54-65页 |
| 1.1 材料 | 第54-56页 |
| 1.1.1 菌株来源 | 第54页 |
| 1.1.2 试剂和仪器 | 第54-56页 |
| 1.2 研究方法 | 第56-65页 |
| 1.2.1 不动杆菌菌种鉴定 | 第56-57页 |
| 1.2.2 体外药物敏感性试验 | 第57页 |
| 1.2.3 菌株同源性分析 | 第57页 |
| 1.2.4 PCR检测耐药基因 | 第57-59页 |
| 1.2.5 OXA基因定位分析 | 第59-63页 |
| 1.2.6 细菌质粒抽提 | 第63-64页 |
| 1.2.7 质粒电转化 | 第64-65页 |
| 2 结果 | 第65-75页 |
| 2.1 OXA耐药基因分布情况 | 第65-66页 |
| 2.2 体外药物敏感性试验结果 | 第66-67页 |
| 2.3 bla_(OXA-51)-like基因分布情况 | 第67-68页 |
| 2.4 bla_(OXA-23)-like基因分布情况 | 第68-70页 |
| 2.5 bla_(OXA-24)-like基因分布情况 | 第70-72页 |
| 2.6 bla_(OXA-58)-like基因分布情况 | 第72页 |
| 2.7 bla_(OXA-143)-like基因分布情况 | 第72-75页 |
| 3 讨论 | 第75-77页 |
| 4 小结 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-89页 |
| 文献综述 | 第89-111页 |
| 引言 | 第89-91页 |
| 1 MLST方法的特点 | 第91-93页 |
| 2 MLST数据库发展历程 | 第93-100页 |
| 3 MLST数据分析工具 | 第100-102页 |
| 3.1 eBURST软件 | 第100-101页 |
| 3.2 Bionumerics软件 | 第101页 |
| 3.3 CLC Main Workbench软件 | 第101-102页 |
| 3.4 START2软件 | 第102页 |
| 4 小结 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-111页 |
| 附录 | 第111-124页 |
| 作者简历及在读期间所取得的科研成果 | 第124页 |
