摘要 | 第4-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
1 前言 | 第13-28页 |
1.1 MADS box家族基因概述 | 第13页 |
1.1.1 MADS box家族基因概述 | 第13页 |
1.1.2 植物MADS box家族基因分类 | 第13页 |
1.2 MIKC~c型亚族基因在双子叶植物花发育中的功能 | 第13-22页 |
1.2.1 AG族基因 | 第13-14页 |
1.2.2 AGL2(SEP)亚族基因 | 第14-17页 |
1.2.3 AGL6亚族基因 | 第17页 |
1.2.4 AGL12亚族基因 | 第17页 |
1.2.5 AGL15亚族基因 | 第17-18页 |
1.2.6 AGL17亚族基因 | 第18-19页 |
1.2.7 DEF亚族和GLO亚族基因 | 第19页 |
1.2.8 FLC亚族基因 | 第19-20页 |
1.2.9 GGM13亚族基因 | 第20页 |
1.2.10 SQUA(AP1)亚族基因 | 第20-21页 |
1.2.11 STMADS11亚族基因 | 第21-22页 |
1.2.12 TM13(SOC1)亚族基因 | 第22页 |
1.3 双子叶植物全基因组范围的MADS box基因研究 | 第22-23页 |
1.4 MADS box基因在柑橘类花发育中的功能研究 | 第23-24页 |
1.5 表达水平定量分析内参基因筛选方法 | 第24-25页 |
1.6 本研究目的意义 | 第25-27页 |
1.7 主要研究内容与技术路线 | 第27-28页 |
1.7.1 主要研究内容 | 第27页 |
1.7.2 技术路线 | 第27-28页 |
2 融安金柑花器官发育显微观察与转录组测序分析 | 第28-46页 |
2.1 材料与方法 | 第28-32页 |
2.1.1 植物材料 | 第28页 |
2.1.2 方法 | 第28-32页 |
2.2 结果与分析 | 第32-44页 |
2.2.1 融安金柑花形态发育过程分析 | 第32-33页 |
2.2.2 转录组测序质量分析 | 第33-35页 |
2.2.3 测序组装结果统计 | 第35-37页 |
2.2.4 unigene注释与功能聚类分析 | 第37-42页 |
2.2.5 转录组SNP位点分析 | 第42页 |
2.2.6 转录组SSR位点分析 | 第42-43页 |
2.2.7 转录组代表性评价 | 第43-44页 |
2.3 讨论与小结 | 第44-46页 |
3 融安金柑花发育表达谱分析 | 第46-73页 |
3.1 材料与方法 | 第46-48页 |
3.1.1 植物材料 | 第46页 |
3.1.2 方法 | 第46-48页 |
3.2 结果与分析 | 第48-71页 |
3.2.1 样品RNA质量分析 | 第48-50页 |
3.2.2 测序质量分析 | 第50-52页 |
3.2.3 参考序列比对、基因表达水平及基础数据统计分析 | 第52-55页 |
3.2.4 样品基因表达差异分析 | 第55-61页 |
3.2.5 差异表达基因GO富集分析 | 第61-66页 |
3.2.6 差异基因KEGG富集分析 | 第66-69页 |
3.2.7 差异MADS box基因表达分析 | 第69-71页 |
3.3 讨论与小结 | 第71-73页 |
4 融安金柑基因表达水平荧光定量内参基因筛选 | 第73-84页 |
4.1 材料与方法 | 第73-75页 |
4.1.1 植物材料 | 第73页 |
4.1.2 方法 | 第73-75页 |
4.2 结果与分析 | 第75-81页 |
4.2.1 荧光定量数据基础分析与相对表达量分析 | 第75-76页 |
4.2.2 备选内参基因的稳定性分析 | 第76-79页 |
4.2.3 最佳组合内参基因与最佳组合内参数量 | 第79-80页 |
4.2.4 用Normfinder方法与Bestkeeper方法进行选择结果再比较 | 第80-81页 |
4.3 讨论 | 第81-83页 |
4.4 小结 | 第83-84页 |
5 融安金柑花发育MADS box基因的筛选与表达分析 | 第84-106页 |
5.1 材料与方法 | 第84-89页 |
5.1.1 植物材料 | 第84-85页 |
5.1.2 方法 | 第85-89页 |
5.2 结果与分析 | 第89-102页 |
5.2.1 转录组中MADS box基因基本生物信息学分析 | 第89-92页 |
5.2.2 融安金柑MADS box基因与柑桔同源基因比对分析及聚类分析 | 第92-95页 |
5.2.3 MADS box基因半定量PCR表达水平检测 | 第95-96页 |
5.2.4 融安金柑花发育相关MADS box基因荧光定量PCR表达水平分析 | 第96-102页 |
5.3 讨论与小结 | 第102-106页 |
6 融安金柑花发育相关MADS box基因功能验证 | 第106-122页 |
6.1 材料与方法 | 第106-109页 |
6.1.1 材料 | 第106页 |
6.1.2 方法 | 第106-109页 |
6.2 结果与分析 | 第109-120页 |
6.2.1 转植物基因载体质粒及转化农杆菌检测 | 第109-110页 |
6.2.2 T0与T1代阳性转化植株筛选 | 第110-112页 |
6.2.3 T1代转化植株生长观察 | 第112-114页 |
6.2.4 T1代转化植株整株GUS染色分析 | 第114-115页 |
6.2.5 T1代转化植株基因表达水平检测 | 第115-120页 |
6.3 讨论与小结 | 第120-122页 |
7 全文总结 | 第122-124页 |
7.1 全文主要结论 | 第122-123页 |
7.2 创新点 | 第123页 |
7.3 后续研究计划 | 第123-124页 |
致谢 | 第124-125页 |
参考文献 | 第125-141页 |
附件补充材料 | 第141-152页 |
附录 | 第152-153页 |