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融安金柑花器官发育转录特征分析及相关MADS box基因功能研究

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-9页
1 前言第13-28页
    1.1 MADS box家族基因概述第13页
        1.1.1 MADS box家族基因概述第13页
        1.1.2 植物MADS box家族基因分类第13页
    1.2 MIKC~c型亚族基因在双子叶植物花发育中的功能第13-22页
        1.2.1 AG族基因第13-14页
        1.2.2 AGL2(SEP)亚族基因第14-17页
        1.2.3 AGL6亚族基因第17页
        1.2.4 AGL12亚族基因第17页
        1.2.5 AGL15亚族基因第17-18页
        1.2.6 AGL17亚族基因第18-19页
        1.2.7 DEF亚族和GLO亚族基因第19页
        1.2.8 FLC亚族基因第19-20页
        1.2.9 GGM13亚族基因第20页
        1.2.10 SQUA(AP1)亚族基因第20-21页
        1.2.11 STMADS11亚族基因第21-22页
        1.2.12 TM13(SOC1)亚族基因第22页
    1.3 双子叶植物全基因组范围的MADS box基因研究第22-23页
    1.4 MADS box基因在柑橘类花发育中的功能研究第23-24页
    1.5 表达水平定量分析内参基因筛选方法第24-25页
    1.6 本研究目的意义第25-27页
    1.7 主要研究内容与技术路线第27-28页
        1.7.1 主要研究内容第27页
        1.7.2 技术路线第27-28页
2 融安金柑花器官发育显微观察与转录组测序分析第28-46页
    2.1 材料与方法第28-32页
        2.1.1 植物材料第28页
        2.1.2 方法第28-32页
    2.2 结果与分析第32-44页
        2.2.1 融安金柑花形态发育过程分析第32-33页
        2.2.2 转录组测序质量分析第33-35页
        2.2.3 测序组装结果统计第35-37页
        2.2.4 unigene注释与功能聚类分析第37-42页
        2.2.5 转录组SNP位点分析第42页
        2.2.6 转录组SSR位点分析第42-43页
        2.2.7 转录组代表性评价第43-44页
    2.3 讨论与小结第44-46页
3 融安金柑花发育表达谱分析第46-73页
    3.1 材料与方法第46-48页
        3.1.1 植物材料第46页
        3.1.2 方法第46-48页
    3.2 结果与分析第48-71页
        3.2.1 样品RNA质量分析第48-50页
        3.2.2 测序质量分析第50-52页
        3.2.3 参考序列比对、基因表达水平及基础数据统计分析第52-55页
        3.2.4 样品基因表达差异分析第55-61页
        3.2.5 差异表达基因GO富集分析第61-66页
        3.2.6 差异基因KEGG富集分析第66-69页
        3.2.7 差异MADS box基因表达分析第69-71页
    3.3 讨论与小结第71-73页
4 融安金柑基因表达水平荧光定量内参基因筛选第73-84页
    4.1 材料与方法第73-75页
        4.1.1 植物材料第73页
        4.1.2 方法第73-75页
    4.2 结果与分析第75-81页
        4.2.1 荧光定量数据基础分析与相对表达量分析第75-76页
        4.2.2 备选内参基因的稳定性分析第76-79页
        4.2.3 最佳组合内参基因与最佳组合内参数量第79-80页
        4.2.4 用Normfinder方法与Bestkeeper方法进行选择结果再比较第80-81页
    4.3 讨论第81-83页
    4.4 小结第83-84页
5 融安金柑花发育MADS box基因的筛选与表达分析第84-106页
    5.1 材料与方法第84-89页
        5.1.1 植物材料第84-85页
        5.1.2 方法第85-89页
    5.2 结果与分析第89-102页
        5.2.1 转录组中MADS box基因基本生物信息学分析第89-92页
        5.2.2 融安金柑MADS box基因与柑桔同源基因比对分析及聚类分析第92-95页
        5.2.3 MADS box基因半定量PCR表达水平检测第95-96页
        5.2.4 融安金柑花发育相关MADS box基因荧光定量PCR表达水平分析第96-102页
    5.3 讨论与小结第102-106页
6 融安金柑花发育相关MADS box基因功能验证第106-122页
    6.1 材料与方法第106-109页
        6.1.1 材料第106页
        6.1.2 方法第106-109页
    6.2 结果与分析第109-120页
        6.2.1 转植物基因载体质粒及转化农杆菌检测第109-110页
        6.2.2 T0与T1代阳性转化植株筛选第110-112页
        6.2.3 T1代转化植株生长观察第112-114页
        6.2.4 T1代转化植株整株GUS染色分析第114-115页
        6.2.5 T1代转化植株基因表达水平检测第115-120页
    6.3 讨论与小结第120-122页
7 全文总结第122-124页
    7.1 全文主要结论第122-123页
    7.2 创新点第123页
    7.3 后续研究计划第123-124页
致谢第124-125页
参考文献第125-141页
附件补充材料第141-152页
附录第152-153页

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