| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-16页 |
| 1 前言 | 第16-29页 |
| 1.1 芸薹属作物基因组及比较基因组学研究进展 | 第16-20页 |
| 1.1.1 芸薹属作物概述 | 第16页 |
| 1.1.2 芸薹属作物基因组概述 | 第16-17页 |
| 1.1.3 芸苔属比较基因组研究进展 | 第17-20页 |
| 1.2 植物线粒体基因测序研究进展及基因注释简述 | 第20-24页 |
| 1.2.1 植物线粒体基因组测序发展及特点 | 第20-21页 |
| 1.2.2 植物线粒体基因组测序常用方法 | 第21-23页 |
| 1.2.3 基因注释简述 | 第23-24页 |
| 1.3 植物线粒体基因组研究进展 | 第24-27页 |
| 1.3.1 高等植物线粒体基因组复杂的结构 | 第24页 |
| 1.3.2 高等植物线粒体基因组的基因组成 | 第24-26页 |
| 1.3.3 高等植物线粒体基因组重复序列 | 第26页 |
| 1.3.4 高等植物线粒体基因组重组 | 第26-27页 |
| 1.4 MSHl核基因调控线粒体和叶绿体的功能简述 | 第27-28页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第28-29页 |
| 2 芥菜和黑芥的线粒体基因组测序、组装与注释 | 第29-43页 |
| 2.1 实验材料 | 第29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-36页 |
| 2.2.1 芥菜线粒体基因组测序和组装 | 第29页 |
| 2.2.2 芥菜线粒体基因组间隙的填补 | 第29-35页 |
| 2.2.3 芥菜线粒体基因组注释 | 第35-36页 |
| 2.3 结果与分析 | 第36-42页 |
| 2.3.1 线粒体基因组上编码蛋白的基因 | 第36-37页 |
| 2.3.2 线粒体基因组上编码tRNA的基因 | 第37-38页 |
| 2.3.3 线粒体基因组上的ORF | 第38-39页 |
| 2.3.4 线粒体基因组上的大重复片段 | 第39-40页 |
| 2.3.5 线粒体基因组上的编码核糖体RNA的基因 | 第40页 |
| 2.3.6 线粒体基因组的绘制 | 第40-42页 |
| 2.4 讨论 | 第42-43页 |
| 3 线粒体基因组序列共线性比对 | 第43-47页 |
| 3.1 实验材料 | 第43页 |
| 3.2 实验方法 | 第43页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第43-46页 |
| 3.3.1 同源序列片段数目统计 | 第43-44页 |
| 3.3.2 单个线粒体基因组与其他5种线粒体基因组Ciocos分析 | 第44-46页 |
| 3.4 讨论 | 第46-47页 |
| 4 依据线粒体基因组的芸薹属物种分化时间探究 | 第47-49页 |
| 4.1 实验材料 | 第47页 |
| 4.2 实验方法 | 第47页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第47-48页 |
| 4.4 讨论 | 第48-49页 |
| 5 依据线粒体基因组的系统进化分析和主成分分析 | 第49-53页 |
| 5.1 实验材料 | 第49页 |
| 5.2 实验方法 | 第49-50页 |
| 5.2.1 系统进化分析 | 第49页 |
| 5.2.2 主成分分析 | 第49-50页 |
| 5.3 实验结果与分析 | 第50-51页 |
| 5.3.1 系统进化分析 | 第50-51页 |
| 5.3.2 主成分分析 | 第51页 |
| 5.4 讨论 | 第51-53页 |
| 6 重复序列分析、编码区域分析和线粒体基因组排分析 | 第53-58页 |
| 6.1 实验材料 | 第53页 |
| 6.2 实验方法 | 第53页 |
| 6.3 实验结果与分析 | 第53-56页 |
| 6.3.1 重复片段长度分析 | 第53-54页 |
| 6.3.2 编码区域分析 | 第54-55页 |
| 6.3.3 线粒体基因组排分析 | 第55-56页 |
| 6.4 讨论 | 第56-58页 |
| 7 叶片衰老过程中MSH1基因表达及线粒体基因组重组 | 第58-70页 |
| 7.1 实验材料及试剂 | 第58页 |
| 7.2 试验方法 | 第58-64页 |
| 7.2.1 前期准备 | 第58-59页 |
| 7.2.2 试验处理 | 第59页 |
| 7.2.3 atpA基因重组位点分析 | 第59-60页 |
| 7.2.4 和线粒体基因组相关的基因MSH1的基因表达 | 第60-64页 |
| 7.3 试验结果与分析 | 第64-69页 |
| 7.3.1 黑暗处理 | 第64-66页 |
| 7.3.2 离体培养(MES溶液) | 第66-68页 |
| 7.3.3 脱落酸处理(ABA溶液) | 第68-69页 |
| 7.4 讨论 | 第69-70页 |
| 8 MSH1基因介导的叶片衰老 | 第70-79页 |
| 8.1 试验材料、试剂及相关仪器 | 第70页 |
| 8.2 试验方法 | 第70-72页 |
| 8.2.1 前期准备 | 第70页 |
| 8.2.2 试验处理 | 第70-71页 |
| 8.2.3 和线粒体基因组相关的基因MSH1的表达 | 第71页 |
| 8.2.4 叶绿素含量测定 | 第71页 |
| 8.2.5 离子渗透率测定 | 第71-72页 |
| 8.3 试验结果与分析 | 第72-78页 |
| 8.3.1 黑暗处理 | 第72-74页 |
| 8.3.2 离体培养(MES溶液) | 第74-76页 |
| 8.3.3 脱落酸处理(ABA溶液) | 第76-78页 |
| 8.4 讨论 | 第78-79页 |
| 9 结论 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-89页 |
| 发表文章 | 第89页 |
