| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-18页 |
| ·EST-SSR标记相关研究进展 | 第12-15页 |
| ·EST-SSR标记的概念 | 第12-13页 |
| ·EST-SSR标记的开发和应用 | 第13-15页 |
| ·作物EST-SSR标记的开发和应用 | 第13页 |
| ·棉花EST-SSR标记的开发和应用 | 第13-15页 |
| ·标记冗余性研究进展 | 第15页 |
| ·棉属的分类及进化 | 第15-17页 |
| ·本研究目的意义 | 第17-18页 |
| 第二章 研究报告 | 第18-53页 |
| ·实验材料 | 第18-21页 |
| ·植株材料 | 第18-20页 |
| ·引物功效评价的植株材料 | 第18-19页 |
| ·遗传多样性分析的植株材料 | 第19-20页 |
| ·遗传图谱定位时的群体材料 | 第20页 |
| ·EST序列及引物来源 | 第20-21页 |
| ·试剂药品 | 第21页 |
| ·实验方法 | 第21-24页 |
| ·EST-SSR的发掘 | 第21页 |
| ·非冗余性EST-SSR引物开发 | 第21-22页 |
| ·DNA提取、PCR扩增和电泳检测 | 第22页 |
| ·遗传多样性分析 | 第22页 |
| ·引物通用性分析 | 第22页 |
| ·相关分析 | 第22页 |
| ·测序 | 第22-23页 |
| ·基因组间转移性研究测序 | 第22页 |
| ·引物冗余性研究测序 | 第22-23页 |
| ·染色体定位 | 第23页 |
| ·200个标记在陆陆群体上的初级定位 | 第23页 |
| ·1000个标记在海陆群体上的定位 | 第23页 |
| ·功能注释与KEGG代谢分析 | 第23-24页 |
| ·结果与分析 | 第24-48页 |
| ·EST-SSR的发掘与特征分布 | 第24-25页 |
| ·非冗余EST-SSR新标记开发 | 第25-26页 |
| ·非冗余EST-SSR新标记及其软件的评价 | 第26-35页 |
| ·多态信息含量和引物通用性分析 | 第26-28页 |
| ·在陆×陆群体上的多态性及染色体初步定位 | 第28-29页 |
| ·冗余性软件评价 | 第29-31页 |
| ·基于棉属的基因组间可转移性评价新开发引物 | 第31-35页 |
| ·非冗余EST-SSR新标记的应用研究 | 第35-48页 |
| ·野生棉材料的遗传多样性评价 | 第35-38页 |
| ·海陆BC1群体遗传图谱上的定位 | 第38页 |
| ·新标记对应的EST功能注释及KEGG代谢分析 | 第38-48页 |
| ·讨论 | 第48-53页 |
| ·非冗余性EST-SSR新标记的开发及其评价 | 第48-50页 |
| ·棉属EST-SSR的特征及标记冗余性 | 第48页 |
| ·新开发引物的多态性和通用性 | 第48-49页 |
| ·棉属种间基因组可转移性 | 第49-50页 |
| ·非冗余EST-SSR新标记的应用 | 第50-53页 |
| ·棉属遗传多样性 | 第50-51页 |
| ·遗传图谱定位 | 第51页 |
| ·对应的EST功能注释与KEGG代谢分析 | 第51-53页 |
| 第三章 全文结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 附录1 部分开发的EST-SSR引物特征 | 第59-67页 |
| 附录2 SSR位点发掘软件SSRMINE1.0脚本 | 第67-75页 |
| 附录3 SSR分子标记冗余性分析系统软件SSRD1.0脚本 | 第75-80页 |
| 附录4 有KEGG代谢分析的EST序列特征表 | 第80-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 作者简历 | 第89-90页 |