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日本落叶松small RNA分析与体细胞胚发生过程中microRNA及其目标基因的鉴定与表达

摘要第1-8页
Abstract第8-18页
第一章 绪论第18-37页
   ·引言第18-20页
     ·研究背景第18-19页
     ·研究目的与意义第19-20页
     ·项目来源与经费支持第20页
   ·植物MIRNA的研究现状第20-32页
     ·sRNA的研究进展第20-22页
     ·miRNA发现、生物合成、修饰与降解的研究进展第22-24页
     ·miRNA的鉴定与表达分析第24-26页
     ·miRNA作用机理第26-28页
     ·miRNA目标基因的预测与验证第28-30页
     ·miRNA的调控功能及应用研究现状第30-32页
   ·MIRNA在胚胎发育中调控作用研究进展第32-35页
     ·miRNA在动物胚胎发育中调控作用的研究现状第32-33页
     ·miRNA在植物胚胎发育中调控作用的研究现状第33-35页
   ·研究目标和主要研究内容第35-36页
     ·关键的科学问题与研究目标第35页
     ·主要研究内容第35-36页
   ·研究技术路线第36-37页
第二章 落叶松体细胞胚SRNA文库构建、SOLEXA测序及分析第37-54页
   ·材料与方法第37-46页
     ·实验材料第37-38页
     ·主要试剂和仪器第38-39页
     ·实验方法第39-46页
   ·结果分析第46-52页
     ·落叶松体细胞胚sRNA文库的测序结果第46-48页
     ·落叶松体细胞胚中各类RNAs的长度分析第48-50页
     ·落叶松各生长阶段的sRNA长度分析第50-51页
     ·RDR2 和RDR6 的表达分析第51-52页
   ·讨论第52-53页
     ·落叶松特异和共同的sRNA表达模式第52页
     ·落叶松不同生长阶段的sRNA分布第52-53页
   ·小结第53-54页
第三章 落叶松MICRORNA的鉴定、前体及目标基因分析第54-79页
   ·材料与方法第54-62页
     ·实验材料第54页
     ·主要试剂和仪器第54-55页
     ·研究方法第55-62页
   ·结果分析第62-76页
     ·落叶松miRNA的鉴定与验证第62-71页
     ·落叶松miRNA前体的获得与分析第71-73页
     ·miRNA目标基因的预测与验证第73-76页
   ·讨论第76-78页
     ·miRNA的保守性分析第76-77页
     ·MIR基因的进化特性分析第77-78页
     ·miRNA长度变异第78页
   ·小结第78-79页
第四章 落叶松体细胞胚发育中MIRNA、前体及目标基因的表达分析第79-93页
   ·材料与方法第79-82页
     ·实验材料第79页
     ·主要试剂和仪器第79-80页
     ·实验方法第80-82页
   ·实验结果第82-88页
     ·落叶松体细胞胚发育中成熟miRNA的表达分析第82-83页
     ·落叶松体细胞胚发育中miRNA前体的表达分析第83-86页
     ·miRNA成熟体与前体的关系分析第86-87页
     ·落叶松体细胞胚发育中目标基因的表达分析第87-88页
     ·miRNA与目标基因的相关分析第88页
   ·讨论第88-92页
     ·成熟miRNA在落叶松体细胞胚发育中的表达分析第88-90页
     ·miRNA前体在落叶松体细胞胚发育中的表达分析第90-91页
     ·目标基因mRNA在落叶松体细胞胚发育中的表达分析第91-92页
     ·miRNA与目标基因mRNA的相关性分析第92页
   ·小结第92-93页
第五章 落叶松TA-SIRNA与LONG SRNA的鉴定与分析第93-103页
   ·材料与方法第93-95页
     ·数据来源第93页
     ·实验材料第93-94页
     ·主要试剂和仪器第94页
     ·实验与分析方法第94-95页
   ·结果分析第95-100页
     ·落叶松ta-siRNA的鉴定第95-96页
     ·ta-siRNA的丰度分析第96-97页
     ·落叶松MIR产生miRNA和long sRNA第97-100页
   ·讨论第100-102页
     ·落叶松ta-siRNA的鉴定与分析第100-101页
     ·落叶松中MIR基因的双重功能分析第101-102页
   ·小结第102-103页
第六章 落叶松MIRNA降解与 3’端碱基添加分析第103-120页
   ·材料与方法第103-104页
     ·数据分析与miRNA筛选第103-104页
     ·落叶松isomiR的鉴定第104页
     ·统计分析第104页
   ·结果分析第104-117页
     ·落叶松体细胞胚和实生苗sRNA分析第104-105页
     ·落叶松miRNA缩减体鉴定和降解分析第105-108页
     ·落叶松isomiRs的鉴定第108-110页
     ·isomiRs与成熟miRNA的比率分析第110-113页
     ·miRNA 3’端碱基添加对miRNA稳定性影响第113-117页
   ·讨论第117-119页
     ·落叶松成熟miRNA的降解分析第117页
     ·成熟miRNA 3’端碱基添加的生物学意义第117-119页
   ·小结第119-120页
第七章 结论与讨论第120-123页
   ·结论第120-121页
   ·讨论第121-122页
   ·展望第122-123页
参考文献第123-141页
附录第141-142页
在读期间的学术研究第142-143页
致谢第143页

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