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链状亚历山大藻microRNA高通量测序及生物信息学分析

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 文献综述第13-37页
    1. 赤潮研究概况第13-21页
        1.1 赤潮的发生及其危害第13-15页
        1.2 赤潮的发生与甲藻的关系第15-17页
        1.3 赤潮爆发机理的生理生态及分子生物学研究现状第17-21页
    2. microRNA研究进展第21-30页
        2.1 microRNA的起源及加工第21-24页
        2.2 microRNA的特征第24-25页
        2.3 microRNA的调控机制第25-26页
        2.4 microRNA在植物中的调节作用第26-28页
        2.5 microRNA的分离及鉴定方法第28-29页
        2.6 检测及定量分析microRNA表达的方法第29-30页
    3. microRNA高通量测序及荧光定量技术第30-36页
        3.1 测序技术的发展第30页
        3.2 microRNA高通量测序技术第30-32页
        3.3 microRNA高通量测序技术在藻类中的应用第32-33页
        3.4 microRNA荧光定量PCR技术第33-36页
    4. 本研究的目标和意义第36-37页
第二章 链状亚历山大藻microRNA的高通量测序及结果分析第37-60页
    1. 前言第37页
    2. 材料和方法第37-44页
        2.1 藻种的来源及培养第37-38页
        2.2 实验所需的试剂及仪器第38-39页
        2.3 链状亚历山大藻的培养和藻细胞的收集第39页
        2.4 总RNA的提取及质量检测第39-41页
        2.5 小RNA文库的构建第41页
        2.6 数据过滤及基础分析流程第41-42页
        2.7 差异表达microRNA的靶基因预测及功能注释第42-44页
    3. 结果第44-56页
        3.1 小RNA文库的测序结果第44-45页
        3.2 小RNA长度分布第45-46页
        3.3 链状业历山大藻中保守microRNA的鉴定和分析第46-52页
        3.4 链状亚历山大藻中新颖的microRNA第52-53页
        3.5 链状亚历山大藻不同生长时期差异表达的microRNA第53-54页
        3.6 差异表达的microRNA的靶基因预测及其功能注释第54-56页
    4. 讨论第56-59页
        4.1 链状亚历山大藻中小RNA长度分布模式第56-57页
        4.2 已知micoRNA在链状亚历山大藻不同生长时期的调控作用第57-58页
        4.3 差异表达的micoRNA在链状亚历山大藻不同生长时期的调控作用第58-59页
    5. 小结第59-60页
第三章 链状亚历山大藻差异表达的microRNA在不同生长时期和生长状态下的qPCR验证第60-71页
    1. 前言第60页
    2. 实验所需的材料、试剂及仪器第60-61页
        2.1 实验材料第60页
        2.2 实验试剂第60-61页
        2.3 实验仪器第61页
    3. 实验方法第61-63页
        3.1 链状亚历山大藻的培养和收集第61页
        3.2 引物设计第61-62页
        3.3 样本的RNA提取及反转录第62页
        3.4 目的序列的回收和克隆测序第62页
        3.5 qPCR溶解曲线和标准曲线的制作第62-63页
        3.6 qPCR检测基因的差异表达第63页
    4. 结果与分析讨论第63-68页
        4.1 一链合成效率的检测第63-64页
        4.2 质粒的检测第64-65页
        4.3 目的基因溶解曲线和标准曲线的制作第65-67页
        4.4 四个差异miRNA表达量的变化第67-68页
    5. 讨论第68-70页
    6. 小结第70-71页
参考文献第71-85页
致谢第85-86页
附录第86-88页

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