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迟缓爱德华氏菌Ⅲ型分泌系统EsaG/Orf13/EsaH复合物的晶体结构研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略语表第11-12页
1 前言第12-28页
    1.1 研究问题的由来第12页
    1.2 迟缓爱德华氏菌第12-14页
    1.3 Ⅲ型分泌系统概述第14-15页
    1.4 Ⅲ型分泌系统的分子伴侣第15-16页
    1.5 Ⅲ型分泌系统的结构研究进展第16-18页
        1.5.1 Ⅲ型分泌系统的结构概述第16-17页
        1.5.2 Needle和Needle蛋白第17-18页
        1.5.3 Needle蛋白与其分子伴侣复合物第18页
    1.6 蛋白质相互作用的检测第18-20页
        1.6.1 酵母双杂交第18-19页
        1.6.2 GST pull down第19-20页
    1.7 结构生物学第20-26页
        1.7.1 结构生物学概述第20页
        1.7.2 蛋白质结晶第20-21页
        1.7.3 晶体数据收集第21-22页
        1.7.4 晶体结构解析第22-26页
    1.8 本研究的背景、目的与意义第26-28页
2 实验材料与方法第28-34页
    2.1 实验材料第28页
    2.2 生物信息学分析第28-29页
    2.3 酵母双杂交第29页
    2.4 表达载体构建第29-30页
    2.5 蛋白表达与纯化第30-32页
        2.5.1 蛋白表达与亲和纯化第30-31页
        2.5.2 Orf13/EsaH复合物表达与纯化第31页
        2.5.3 硒代蛋白的表达与纯化第31-32页
        2.5.4 EsaG~(33-73)/Orf13/EsaH复合物表达与纯化第32页
    2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳第32页
        2.6.1 SDS-PAGE第32页
        2.6.2 Tricine-SDS-PAGE第32页
    2.7 结晶条件筛选与晶体优化第32-33页
        2.7.1 结晶条件的初筛第32-33页
        2.7.2 晶体的优化第33页
    2.8 数据收集与结构解析第33-34页
        2.8.1 衍射数据收集第33页
        2.8.2 数据处理第33页
        2.8.3 结构解析第33-34页
3 实验结果第34-51页
    3.1 生物信息学分析第34-35页
        3.1.1 结构域分析第34页
        3.1.2 二级结构预测第34-35页
    3.2 酵母双杂交第35-36页
    3.3 蛋白表达纯化第36-41页
        3.3.1 融合蛋白表达纯化第36-37页
        3.3.2 Orf13/EsaH表达纯化第37-39页
        3.3.3 EsaG/Orf13/EsaH复合物表达纯化第39-41页
    3.4 结晶条件筛选与晶体优化第41-43页
        3.4.1 Orf13/EsaH复合物结晶条件筛选与晶体优化第41-42页
        3.4.2 EsaG/Orf13/EsaH复合物结晶条件筛选与晶体优化第42-43页
    3.5 衍射数据收集与处理第43-44页
    3.6 晶体结构解析与修正第44-45页
        3.6.1 晶胞内容分析第44页
        3.6.2 晶体结构解析第44-45页
    3.7 Orf13/EsaH复合物晶体结构第45-47页
    3.8 EsaG/Orf13/EsaH复合物晶体结构第47-51页
4 讨论第51-55页
    4.1 酵母双杂交实验结果讨论第51页
    4.2 EsaH的生物学功能第51-52页
    4.3 EsaG~(33-54)是否在晶体中第52-54页
    4.4 潜在的药物设计价值第54页
    4.5 研究展望第54-55页
参考文献第55-62页
附录Ⅰ 溶液配制第62-65页
附录Ⅱ 分子克隆反应体系第65-66页
附录Ⅲ 数据收集与结构修正统计信息第66-67页
致谢第67页

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