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蓝舌病毒感染细胞(A.albopictus和PST)miRNA表达谱的鉴定与功能分析

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第一章 引言第14-23页
    1.1 蓝舌病概况第14-15页
    1.2 蓝舌病毒第15-18页
        1.2.1 蓝舌病毒形态和基因组结构第15-18页
        1.2.2 蓝舌病毒复制周期第18页
    1.3 microRNA概述第18-21页
        1.3.1 miRNA生物起源第18-20页
        1.3.2 miRNA作用机制第20页
        1.3.3 miRNA研究方法-高通量测序技术第20-21页
    1.4 细胞miRNA与病原相互作用的研究第21-22页
    1.5 研究目的与意义第22-23页
第二章 蓝舌病毒感染A. albopictus细胞miRNA表达谱的鉴定第23-44页
    2.1 实验材料第23-24页
        2.1.1 细胞与病毒第23页
        2.1.2 主要实验试剂第23页
        2.1.3 主要仪器设备第23-24页
    2.2 实验方法第24-31页
        2.2.1 细胞培养第24页
        2.2.2 BTV感染A.albopictus细胞的收集和总RNA提取第24-25页
        2.2.3 RT-PCR和噬斑试验第25-26页
        2.2.4 高通量测序第26-27页
        2.2.5 测序数据分析第27-28页
        2.2.6 miRNA分析第28页
        2.2.7 miRNA靶基因预测第28页
        2.2.8 实时定量PCR验证miRNA及其靶基因第28-31页
        2.2.9 miRNA靶基因的GO和KEGG分析第31页
    2.3 结果第31-43页
        2.3.1 BTV在A.albopictus细胞中的增殖特性第31-33页
        2.3.2 测序数据分析第33-34页
        2.3.3 已知miRNA的鉴定和差异表达分析第34-36页
        2.3.4 新miRNA的预测和差异表达分析第36-40页
        2.3.5 miRNA靶基因的GO及KEGG分析第40-41页
        2.3.6 实时定量PCR验证miRNA及其对应靶基因第41-43页
    2.4 讨论第43-44页
第三章 蓝舌病毒感染PST细胞miRNA表达谱的鉴定第44-58页
    3.1 实验材料第44页
        3.1.1 细胞、病毒和抗体第44页
        3.1.2 主要实验试剂与仪器设备第44页
    3.2 实验方法第44-47页
        3.2.1 PST细胞的制备与培养第44-45页
        3.2.2 细胞免疫荧光试验第45页
        3.2.3 BTV感染PST细胞的收集和RNA提取第45页
        3.2.4 RT-PCR和噬斑试验第45页
        3.2.5 测序样品收集第45-46页
        3.2.6 高通量测序第46页
        3.2.7 生物信息学分析第46页
        3.2.8 新miRNA和对应靶基因的预测第46页
        3.2.9 miRNA差异分析第46页
        3.2.10 GO功能和KEGG路径分析第46-47页
        3.2.11 实时定量PCR验证mi RNA第47页
    3.3 结果第47-56页
        3.3.1 BTV在PST细胞中的生长增殖特性第47-49页
        3.3.2 测序数据分析第49-51页
        3.3.3 显著差异表达miRNA分析第51-55页
        3.3.4 miRNA靶基因分析第55页
        3.3.5 GO功能和KEGG路径分析第55-56页
        3.3.6 实时定量PCR验证显著差异表达miRNA第56页
    3.4 讨论第56-58页
第四章 蓝舌病毒感染细胞后3个细胞miRNA功能初步研究第58-71页
    4.1 实验材料第58页
        4.1.1 细胞与病毒第58页
        4.1.2 主要实验试剂第58页
    4.2 实验方法第58-62页
        4.2.1 miRNA模拟体和抑制剂的设计与合成第58-59页
        4.2.2 siRNA的设计与合成第59-60页
        4.2.3 PST细胞转染miRNA最佳条件摸索第60页
        4.2.4 A.albopictus细胞转染miRNA和siRNA最佳条件摸索第60页
        4.2.5 转染实验第60-61页
        4.2.6 转染样品收集及RNA提取第61页
        4.2.7 实时定量PCR和噬斑试验验证miRNA和靶标基因对BTV复制的调节作用第61-62页
    4.3 结果第62-69页
        4.3.1 miRNA和siRNA转染实验最佳条件的确定第62-64页
        4.3.2 Novel-mir-105抑制BTV在PST细胞中复制第64-65页
        4.3.3 Aae-miR18895p和aae-miR29405p均促进BTV在A.albopictus细胞中复制第65-68页
        4.3.4 靶标基因AAEL012723和AAEL018190表达量下调抑制BTV在A.albopictus细胞中复制第68-69页
    4.4 讨论第69-71页
第五章 全文结论第71-72页
参考文献第72-79页
致谢第79-80页
作者简历第80页

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