| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第13-30页 |
| 1.1 化学视角下的DNA分子 | 第13-17页 |
| 1.1.1 DNA与纳米工程 | 第13-15页 |
| 1.1.2 DNA的化学合成 | 第15-17页 |
| 1.2 DNA动态逻辑回路 | 第17-24页 |
| 1.2.1 DNA杂交和链置换的热力学及动力学基础 | 第17-19页 |
| 1.2.2 DNA链置换反应与动态逻辑回路 | 第19-24页 |
| 1.3 DNA的结构自组装 | 第24-28页 |
| 1.3.1 DNA催化自组装 | 第24-25页 |
| 1.3.2 DNA杂交自组装 | 第25-27页 |
| 1.3.3 DNA结构辅助自组装 | 第27-28页 |
| 1.4 本论文的研究构想 | 第28-30页 |
| 第2章 熵驱动信标：一种无酶无发夹核酸放大策略的设计与应用研究 | 第30-46页 |
| 2.1 引言 | 第30-32页 |
| 2.2 实验部分 | 第32-35页 |
| 2.2.1 实验试剂 | 第32-33页 |
| 2.2.2 实验仪器 | 第33页 |
| 2.2.3 实验步骤 | 第33-35页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第35-45页 |
| 2.3.1 熵驱动信标的构建和热动力学计算 | 第35-37页 |
| 2.3.2 目标DNA引发的零背景信号增强 | 第37-40页 |
| 2.3.3 信标系统的热稳定性 | 第40-41页 |
| 2.3.4 单碱基突变的选择性 | 第41-42页 |
| 2.3.5 链呼吸速率和系统选择性的关系 | 第42-43页 |
| 2.3.6 细胞匀浆监测以及信号触发设计 | 第43-45页 |
| 2.4 小结 | 第45-46页 |
| 第3章 内建DNA反应网络的智能原型细胞的构建与免疫模拟研究 | 第46-68页 |
| 3.1 引言 | 第46-48页 |
| 3.2 实验部分 | 第48-52页 |
| 3.2.1 实验试剂 | 第48-49页 |
| 3.2.2 实验仪器 | 第49页 |
| 3.2.3 实验步骤 | 第49-52页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第52-67页 |
| 3.3.1 原型细胞中AIRS工作机理的分步阐述 | 第53-54页 |
| 3.3.2 AIRS构建 | 第54-59页 |
| 3.3.3 人工病原体和原型细胞的表征 | 第59-61页 |
| 3.3.4 装载效率 | 第61-63页 |
| 3.3.5 人工病原体侵染和病原体DNA的转运 | 第63-64页 |
| 3.3.6 原型细胞中的AIRS | 第64-67页 |
| 3.4 小结 | 第67-68页 |
| 第4章 DNA步行者探针用于监测活细胞膜上动态瞬时的分子碰撞 | 第68-90页 |
| 4.1 引言 | 第68-69页 |
| 4.2 实验部分 | 第69-76页 |
| 4.2.1 实验试剂 | 第69-70页 |
| 4.2.2 实验仪器 | 第70页 |
| 4.2.3 实验步骤 | 第70-76页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第76-89页 |
| 4.3.1 DNA探针的表征 | 第76-79页 |
| 4.3.2 DNA探针的运动 | 第79-85页 |
| 4.3.3 通过设计DNA竞争游戏来研究膜脂分子碰撞取的向性 | 第85-86页 |
| 4.3.4 膜脂分子碰撞速率的计算 | 第86-87页 |
| 4.3.5 细胞膜上每种脂分子的有效浓度以及脂分子扩散面积估算 | 第87-88页 |
| 4.3.6 DNA探针用于研究膜蛋白分子的碰撞速率 | 第88-89页 |
| 4.4 小结 | 第89-90页 |
| 第5章 树枝状DNA催化自组装复合物用于有效的基因沉默 | 第90-102页 |
| 5.1 引言 | 第90-91页 |
| 5.2 实验部分 | 第91-96页 |
| 5.2.1 实验试剂 | 第91-92页 |
| 5.2.2 实验仪器 | 第92页 |
| 5.2.3 实验步骤 | 第92-96页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第96-101页 |
| 5.3.1 DNA树枝状复合物的组装与表征 | 第96-98页 |
| 5.3.2 DNA树枝状复合物的细胞选择性 | 第98-99页 |
| 5.3.3 DNA树枝状复合物作为载体的si RNA基因沉默 | 第99-101页 |
| 5.4 小结 | 第101-102页 |
| 第6章 金属交联的DNA胶束：球面合成，结构阐明以及细胞内在化研究 | 第102-121页 |
| 6.1 引言 | 第102-104页 |
| 6.2 实验部分 | 第104-110页 |
| 6.2.1 实验试剂 | 第104-105页 |
| 6.2.2 实验仪器 | 第105页 |
| 6.2.3 实验步骤 | 第105-110页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第110-120页 |
| 6.3.1 铜交联的DNA胶束 | 第110-111页 |
| 6.3.2 银交联的DNA胶束 | 第111-113页 |
| 6.3.3 金交联的DNA胶束 | 第113-115页 |
| 6.3.4 标准电极电势的计算 | 第115-116页 |
| 6.3.5 金属交联的DNA胶束探针 | 第116-118页 |
| 6.3.6 铜交联的双链DNA胶束 | 第118-120页 |
| 6.4 小结 | 第120-121页 |
| 结论 | 第121-123页 |
| 参考文献 | 第123-139页 |
| 附录A 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第139-140页 |
| 致谢 | 第140-142页 |
