| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-22页 |
| 1.1 杂种优势的发现 | 第11-12页 |
| 1.2 杂种优势的假说 | 第12-14页 |
| 1.2.1 杂种优势的显性假说 | 第12页 |
| 1.2.2 杂种优势的超显性假说 | 第12-13页 |
| 1.2.3 杂种优势的上位性假说 | 第13-14页 |
| 1.3 杂种优势形成的表观遗传学 | 第14-15页 |
| 1.4 水稻远缘杂种优势利用研究现状与展望 | 第15-16页 |
| 1.5 水稻全基因组关联分析（GWAS）研究进展及问题展望 | 第16-21页 |
| 1.5.1 关联分析 | 第17页 |
| 1.5.2 水稻全基因组关联分析的研究进展 | 第17-20页 |
| 1.5.3 问题与展望 | 第20-21页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-29页 |
| 2.1 非洲栽培稻基因渗入系与部分种间杂交稻农艺性状考察分析 | 第22-24页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第22页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第22页 |
| 2.1.3 农艺性状考察 | 第22-23页 |
| 2.1.4 数据处理与分析 | 第23-24页 |
| 2.2 简化基因组测序与农艺性状种间杂种优势的全基因组关联分析 | 第24-29页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第24页 |
| 2.2.2 试验方法 | 第24-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-62页 |
| 3.1 部分种间杂交稻的杂种优势鉴定 | 第29-36页 |
| 3.1.1 部分种间杂交种的中亲优势 | 第29-32页 |
| 3.1.2 部分种间杂交种的超亲优势 | 第32-34页 |
| 3.1.3 部分种间杂交种的竞争优势 | 第34-36页 |
| 3.2 农艺性状相关性分析 | 第36-43页 |
| 3.2.1 非洲栽培稻基因渗入系农艺性状相关性分析 | 第36-40页 |
| 3.2.2 部分种间杂交种农艺性状相关性分析 | 第40-43页 |
| 3.3 非洲栽培稻基因渗入系的遗传多样性分析 | 第43-55页 |
| 3.3.1 简化基因组测序数据量统计 | 第43-48页 |
| 3.3.2 非洲栽培稻基因渗入系的SNP图谱 | 第48-50页 |
| 3.3.3 系统进化树构建 | 第50页 |
| 3.3.4 群体结构分析 | 第50-51页 |
| 3.3.5 主成分分析 | 第51-52页 |
| 3.3.6 非洲栽培稻基因渗入系不同分组间农艺性状的多重比较 | 第52-55页 |
| 3.4 非洲栽培稻基因渗入系农艺性状的全基因组关联分析 | 第55-62页 |
| 3.4.1 农艺性状相关QTL定位 | 第55-58页 |
| 3.4.2 部分种间杂交种杂种优势关联位点 | 第58-62页 |
| 4 讨论 | 第62-66页 |
| 4.1 部分种间杂交稻农艺性状的杂种优势 | 第62-63页 |
| 4.2 非洲栽培稻基因渗入系农艺性状间的相关性 | 第63页 |
| 4.3 非洲栽培稻基因渗入系农艺性状的全基因组关联分析 | 第63-65页 |
| 4.4 部分种间杂交种农艺性状杂种优势的全基因组关联分析 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-75页 |
| 附录 | 第75-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
