| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 绪论 | 第12-21页 |
| 1.1 土壤微生物多样性概述 | 第12页 |
| 1.2 土壤微生物多样性的影响因素 | 第12-14页 |
| 1.2.1 土壤 | 第12-13页 |
| 1.2.2 植被 | 第13页 |
| 1.2.3 季节变化（温度，水分） | 第13-14页 |
| 1.2.4 管理方式 | 第14页 |
| 1.3 土壤微生物多样性研究方法 | 第14-19页 |
| 1.3.1 平板培养法 | 第14-15页 |
| 1.3.2 磷脂脂肪酸（PLFA）图谱分析法 | 第15页 |
| 1.3.3 Biolog微量分析法 | 第15页 |
| 1.3.4 基于PCR的测序技术（The PCR-Clone-Sequence Approach） | 第15-16页 |
| 1.3.5 实时荧光定量PCR（FQ-PCR） | 第16页 |
| 1.3.6 变性凝胶电泳技术（DGGE） | 第16页 |
| 1.3.7 限制性片段长度多态性（RFLP）、末端限制性长度多态性（T-RFLP）和扩增核糖体DNA限制性分析（ARDAR） | 第16-17页 |
| 1.3.8 随机扩增片段多态性DNA（RAPD）技术 | 第17页 |
| 1.3.9 单链构象多态性（SSCP）图谱分析 | 第17-18页 |
| 1.3.10 荧光原位杂交（FISH）技术 | 第18页 |
| 1.3.11 自动核糖体间隔分析(ARISA) | 第18页 |
| 1.3.12 环境基因组技术 | 第18页 |
| 1.3.13 高通量测序技术 | 第18-19页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第19-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-25页 |
| 2.1 研究区域概况 | 第21页 |
| 2.2 样地选择及样品采集 | 第21-22页 |
| 2.2.1 样地选择 | 第21-22页 |
| 2.2.2 样品的采集 | 第22页 |
| 2.3 土样理化性质测定 | 第22页 |
| 2.4 可培养微生物的培养与计数 | 第22-23页 |
| 2.5 Biolog实验 | 第23页 |
| 2.6 MiSeq宏基因组测序 | 第23-24页 |
| 2.7 数据统计与分析 | 第24-25页 |
| 3 研究结果与分析 | 第25-67页 |
| 3.1 土壤理化性质 | 第25-28页 |
| 3.1.1 土壤酸碱度 | 第25-26页 |
| 3.1.2 土壤酶活性 | 第26-27页 |
| 3.1.3 土壤碳氮含量 | 第27-28页 |
| 3.2 祁连山土壤微生物数量特征 | 第28-31页 |
| 3.2.1 细菌数量变化特征 | 第28-29页 |
| 3.2.2 真菌数量变化特征 | 第29-30页 |
| 3.2.3 放线菌数量变化特征 | 第30-31页 |
| 3.3 Biolog生态板对土壤微生物群落分析 | 第31-41页 |
| 3.3.1 土壤AWCD（Average Well Color Development）值及多样性指数、利用碳源能力变化情况 | 第31-34页 |
| 3.3.2 六大类碳源的利用情况 | 第34-41页 |
| 3.4 相关性分析 | 第41-56页 |
| 3.4.1 土壤微生物数量与土壤环境因子之间的相关性 | 第41-50页 |
| 3.4.2 土壤微生物利用碳源的能力与微生物数量之间的相关性 | 第50-53页 |
| 3.4.3 土壤微生物利用碳源的能力与土壤理化性质之间的相关性 | 第53-56页 |
| 3.5 MiSeq宏基因组测序 | 第56-67页 |
| 3.5.1 DNA的提取及PCR扩增 | 第56-57页 |
| 3.5.2 原始数据整理、过滤及质量评估 | 第57-58页 |
| 3.5.3 稀释曲线（Rarefaction Curve） | 第58-59页 |
| 3.5.4 OTU聚类分析 | 第59-61页 |
| 3.5.5 Alpha多样性分析 | 第61-62页 |
| 3.5.6 Rank-Abundance曲线 | 第62-63页 |
| 3.5.7 样本群落组成分析 | 第63-65页 |
| 3.5.8 RDA分析 | 第65-67页 |
| 4 结论 | 第67-69页 |
| 4.1 土壤理化性质 | 第67页 |
| 4.2 土壤可培养微生物数量特征 | 第67页 |
| 4.3 Biolog Eco板对土壤微生物群落分析 | 第67-68页 |
| 4.4 MiSeq宏基因组测序 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-77页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第77页 |
