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新型酯酶EstZF172的克隆表达及其在制备普瑞巴林手性中间体中的应用

致谢第5-6页
摘要第6-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 文献综述第14-32页
    1.1 酯酶第14-19页
        1.1.1 酯类水解酶第14页
        1.1.2 酯酶的来源与分类第14-17页
        1.1.3 酯酶的结构特征与催化机理第17-19页
            1.1.3.1 酯酶的结构特征第17-18页
            1.1.3.2 酯酶的催化机理第18-19页
        1.1.4 酯酶的立体选择性在手性药物制备中的应用第19页
    1.2 普瑞巴林概述第19-21页
        1.2.1 普瑞巴林简介第19-21页
        1.2.2 普瑞巴林的市场前景及研究意义第21页
    1.3 普瑞巴林的制备方法及研究进展第21-29页
        1.3.1 化学法制备普瑞巴林第21-25页
            1.3.1.1 化学不对称合成法第21-24页
            1.3.1.2 外消旋体化学拆分法第24-25页
        1.3.2 外消旋体生物拆分法制备普瑞巴林第25-29页
            1.3.2.1 对二腈类衍生物的生物拆分第25-26页
            1.3.2.2 对氰基取代二酯类衍生物的生物拆分第26-29页
    1.4 本课题的研究思路和内容第29-32页
第二章 ESTZF172的基因克隆及表达第32-58页
    2.1 前言第32页
    2.2 材料与方法第32-38页
        2.2.1 质粒与菌种第32-33页
        2.2.2 实验仪器第33-34页
        2.2.3 主要药品与试剂第34-36页
        2.2.4 试剂与培养基配制第36-38页
    2.3 实验方法第38-48页
        2.3.1 Pseudomonas CGMCC No.4184基因文库的构建第38-41页
            2.3.1.1 Pseudomonas CGMCC No.4184全基因组的提取第38页
            2.3.1.2 质粒的提取第38页
            2.3.1.3 E. coli DH5α超级感受态细胞的制备第38-39页
            2.3.1.4 超级感受态细胞转化效率验证第39页
            2.3.1.5 基因组文库构建第39-41页
        2.3.2 阳性克隆子的筛选与检测第41-42页
        2.3.3 目标酯酶基因的确定第42-44页
            2.3.3.1 目标片段PCR扩增第42-43页
            2.3.3.2 表达载体的构建第43-44页
            2.3.3.3 重组工程菌拆分活性的检测第44页
        2.3.4 estZF172基因的克隆与可溶表达第44-46页
            2.3.4.1 estZF172基因的克隆第44页
            2.3.4.2 表达载体的构建第44-45页
            2.3.4.3 estZF172基因的可溶表达第45页
            2.3.4.4 SDS-PAGE凝胶电泳检测表达结果第45-46页
        2.3.5 酯酶EstZF172的活性测定第46-48页
            2.3.5.1 对硝基苯酚酯水解法测定酶活力第46页
            2.3.5.2 CNDE水解法测定酶活力第46-47页
            2.3.5.3 针对目标底物拆分能力的鉴定第47-48页
        2.3.6 分析方法第48页
    2.4 结果与讨论第48-57页
        2.4.1 目的基因的筛选与克隆第48-54页
            2.4.1.1 全基因组的提取第48-49页
            2.4.1.2 全基因组的部分酶切第49-50页
            2.4.1.3 含酯酶基因转化子的筛选和验证第50-52页
            2.4.1.4 目标基因片段的筛选与确定第52-54页
        2.4.2 EstZF172相应的基因克隆及蛋白表达第54-57页
            2.4.2.1 estZF172基因的克隆第54-55页
            2.4.2.2 表达载体的构建及鉴定第55-56页
            2.4.2.3 EstZF172蛋白的表达第56页
            2.4.2.4 EstZF172活性验证第56-57页
            2.4.2.5 estZF172基因序列提交第57页
    2.5 本章小结第57-58页
第三章 ESTZF172的序列分析及酶学性质表征第58-81页
    3.1 前言第58页
    3.2 材料与方法第58-60页
        3.2.1 菌种第58-59页
        3.2.2 实验仪器第59页
        3.2.3 主要药品与试剂第59-60页
        3.2.4 试剂配制第60页
        3.2.5 分子生物学软件与网络资源第60页
    3.3 实验方法第60-64页
        3.3.1 基因与蛋白质序列分析第60-61页
        3.3.2 定点突变验证第61-62页
        3.3.3 蛋白质的纯化第62页
        3.3.4 EstZF172酶学性质研究第62-64页
            3.3.4.1 底物特异性第62-63页
            3.3.4.2 温度对酯酶的影响第63页
            3.3.4.3 pH对酯酶的影响第63页
            3.3.4.4 添加剂对酯酶的影响第63-64页
            3.3.4.5 酯酶的反应动力学参数测定第64页
    3.4 结果与讨论第64-79页
        3.4.1 estZF172基因开放阅读框及相关核苷酸片段分析第64-65页
        3.4.2 酯酶EstZF172的纯化第65-66页
        3.4.3 酯酶EstZF172序列同源性分析第66-68页
        3.4.4 同源建模第68-71页
        3.4.5 定点突变与分子对接验证第71-74页
        3.4.6 酯酶EstZF172的酶学性质表征第74-79页
            3.4.6.1 酯酶的底物特异性第74页
            3.4.6.2 温度对酯酶活力的影响第74-75页
            3.4.6.3 pH对酯酶活力的影响第75-77页
            3.4.6.4 添加剂对酯酶活力的影响第77-79页
            3.4.6.5 酯酶的动力学参数第79页
    3.5 本章小结第79-81页
第四章 重组全细胞水解制备(S)-CNDE的工艺研究第81-103页
    4.1 前言第81页
    4.2 材料与方法第81-82页
        4.2.1 菌种第81页
        4.2.2 实验仪器第81-82页
        4.2.3 主要药品与试剂第82页
    4.3 实验方法第82-86页
        4.3.1 酯酶EstZF172表达条件优化第82-83页
        4.3.2 最适转化温度及pH测定第83页
        4.3.3 底物自水解程度的测定第83页
        4.3.4 不同温度条件下的半衰期第83-84页
        4.3.5 全细胞载量的确定第84页
        4.3.6 固定底物/细胞载量比例下不同浓度底物的转化第84页
        4.3.7 底物和产物抑制影响测定第84页
        4.3.8 产物抑制解除方案探究第84-85页
            4.3.8.1 金属离子对产物抑制的解除作用第84-85页
            4.3.8.2 阴离子交换树脂对产物抑制的解除作用第85页
        4.3.9 底物/细胞载量比例的优化第85-86页
        4.3.10 气相分析方法第86页
    4.4 结果与讨论第86-102页
        4.4.1 酯酶的产酶条件优化第86-89页
            4.4.1.1 诱导强度的影响第86-87页
            4.4.1.2 诱导时机的影响第87页
            4.4.1.3 诱导温度的影响第87页
            4.4.1.4 诱导时间的影响第87-89页
        4.4.2 转化过程温度和pH的选择第89-92页
            4.4.2.1 转化过程的最适温度和pH第89-90页
            4.4.2.2 转化温度与pH的确定第90-92页
        4.4.3 全细胞用量的确定第92-93页
        4.4.4 固定底物/细胞载量比例下不同浓度底物的转化第93-94页
        4.4.5 底物、产物浓度对全细胞转化的影响第94-95页
        4.4.6 产物抑制解除测试第95-100页
            4.4.6.1 金属离子添加对产物抑制的解除效果第95-96页
            4.4.6.2 阴离子树脂添加对产物抑制的解除效果第96-100页
        4.4.7 高底物浓度下全细胞载量的优化第100-102页
    4.5 本章小结第102-103页
第五章 结论与展望第103-105页
    5.1 结论第103-104页
    5.2 展望第104-105页
参考文献第105-111页
附录第111-116页
作者简介及在学期间取得的科研成果第116页

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