摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
第1章 文献综述 | 第11-19页 |
1.1 重金属污染概况 | 第11-12页 |
1.1.1 重金属污染的定义 | 第11页 |
1.1.2 海洋重金属污染现状和危害 | 第11-12页 |
1.2 重金属污染的治理 | 第12-14页 |
1.2.1 重金属污染的传统治理方法 | 第12-13页 |
1.2.2 重金属污染的生物修复类型 | 第13-14页 |
1.2.2.1 微生物修复 | 第13页 |
1.2.2.2 植物修复 | 第13-14页 |
1.2.2.3 动物修复 | 第14页 |
1.3 贝类用于治理重金属污染的研究进展 | 第14-16页 |
1.4 研究内容与意义 | 第16-19页 |
1.4.1 研究内容 | 第16-17页 |
1.4.2 技术路线 | 第17页 |
1.4.3 研究意义 | 第17-19页 |
第2章 翡翠贻贝足丝蛋白的转录组和蛋白组学分析 | 第19-34页 |
2.1 实验材料 | 第19页 |
2.1.1 样品的采集 | 第19页 |
2.1.2 主要仪器试剂 | 第19页 |
2.2 实验方法 | 第19-24页 |
2.2.1 RNA的提取 | 第19-20页 |
2.2.2 测序数据处理 | 第20-22页 |
2.2.2.1 测序和组装 | 第20页 |
2.2.2.2 Unigene的功能注释 | 第20-21页 |
2.2.2.3 Unigene的蛋白编码序列(CDs)预测 | 第21页 |
2.2.2.4 差异基因表达分析 | 第21-22页 |
2.2.3 蛋白的分离和LC-MS / MS质谱分析 | 第22-23页 |
2.2.3.1 蛋白的提取和分离 | 第22页 |
2.2.3.2 质谱分析 | 第22-23页 |
2.2.4 反转录PCR | 第23-24页 |
2.3 结果与分析 | 第24-31页 |
2.3.1 高通量测序和组装 | 第24-25页 |
2.3.2 转录本的注释和功能分类 | 第25-27页 |
2.3.3 转录本编码序列和蛋白序列的预测 | 第27-29页 |
2.3.3.1 转录本编码序列 | 第27页 |
2.3.3.2 蛋白序列的预测 | 第27-29页 |
2.3.4 足丝蛋白序列鉴定 | 第29-31页 |
2.4 讨论 | 第31-33页 |
2.5 小结 | 第33-34页 |
第3章 含贻贝足丝蛋白重组菌的构建和蛋白的表达与纯化 | 第34-43页 |
3.1 材料、试剂和仪器 | 第34-35页 |
3.1.1 实验菌株和质粒 | 第34页 |
3.1.2 培养基 | 第34页 |
3.1.3 抗生素、酶和试剂 | 第34页 |
3.1.4 引物设计以及合成 | 第34-35页 |
3.1.5 主要仪器 | 第35页 |
3.2 实验方法 | 第35-37页 |
3.2.1 质粒的提取 | 第35页 |
3.2.2 编码基因antistasin like protein和pvfp6的PCR扩增 | 第35-36页 |
3.2.3 重组质粒的构建 | 第36-37页 |
3.2.4 连接产物的转化 | 第37页 |
3.2.5 重组子的验证 | 第37页 |
3.2.6 工程菌表达目的蛋白 | 第37页 |
3.3 结果与分析 | 第37-40页 |
3.3.1 质粒提取结果 | 第37-38页 |
3.3.2 编码基因antistasin like protein和pvfp6扩增 | 第38-39页 |
3.3.3 重组子的验证 | 第39-40页 |
3.3.4 工程菌表达目的蛋白 | 第40页 |
3.4 讨论 | 第40-42页 |
3.5 小结 | 第42-43页 |
第4章 重组菌对重金属的抗性及富集的研究 | 第43-54页 |
4.1 材料、试剂与仪器 | 第43-44页 |
4.1.2 培养基 | 第43页 |
4.1.3 主要试剂 | 第43页 |
4.1.4 主要仪器 | 第43-44页 |
4.2 实验方法 | 第44-45页 |
4.2.1 重组菌对Hg~(2+)和Cd~(2+)生长抗性的研究 | 第44页 |
4.2.2 重组菌对Hg~(2+)和Cd~(2+)平衡富集量的研究 | 第44-45页 |
4.2.2.1 菌体制备 | 第44页 |
4.2.2.2 重组菌对Hg~(2+)和Cd~(2+)平衡富集量研究 | 第44-45页 |
4.3 结果与分析 | 第45-51页 |
4.3.1 重组菌对重金属的抗性 | 第45-48页 |
4.3.1.1 工程菌对汞的抗性 | 第45-47页 |
4.3.1.2 工程菌对镉的抗性 | 第47-48页 |
4.3.2 重组菌对重金属的富集 | 第48-51页 |
4.3.2.1 重组菌对Hg~(2+)的富集 | 第48-49页 |
4.3.2.2 重组菌对Cd~(2+)的富集 | 第49-51页 |
4.4 讨论 | 第51-53页 |
4.5 小结 | 第53-54页 |
第5章 结论与展望 | 第54-56页 |
5.1 主要结论 | 第54-55页 |
5.2 展望 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-63页 |
附录 | 第63-65页 |
缩略语表 | 第65-66页 |
致谢 | 第66-67页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第67页 |