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翡翠贻贝足丝蛋白的鉴定及其汞、镉抗性和富集行为机制研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第1章 文献综述第11-19页
    1.1 重金属污染概况第11-12页
        1.1.1 重金属污染的定义第11页
        1.1.2 海洋重金属污染现状和危害第11-12页
    1.2 重金属污染的治理第12-14页
        1.2.1 重金属污染的传统治理方法第12-13页
        1.2.2 重金属污染的生物修复类型第13-14页
            1.2.2.1 微生物修复第13页
            1.2.2.2 植物修复第13-14页
            1.2.2.3 动物修复第14页
    1.3 贝类用于治理重金属污染的研究进展第14-16页
    1.4 研究内容与意义第16-19页
        1.4.1 研究内容第16-17页
        1.4.2 技术路线第17页
        1.4.3 研究意义第17-19页
第2章 翡翠贻贝足丝蛋白的转录组和蛋白组学分析第19-34页
    2.1 实验材料第19页
        2.1.1 样品的采集第19页
        2.1.2 主要仪器试剂第19页
    2.2 实验方法第19-24页
        2.2.1 RNA的提取第19-20页
        2.2.2 测序数据处理第20-22页
            2.2.2.1 测序和组装第20页
            2.2.2.2 Unigene的功能注释第20-21页
            2.2.2.3 Unigene的蛋白编码序列(CDs)预测第21页
            2.2.2.4 差异基因表达分析第21-22页
        2.2.3 蛋白的分离和LC-MS / MS质谱分析第22-23页
            2.2.3.1 蛋白的提取和分离第22页
            2.2.3.2 质谱分析第22-23页
        2.2.4 反转录PCR第23-24页
    2.3 结果与分析第24-31页
        2.3.1 高通量测序和组装第24-25页
        2.3.2 转录本的注释和功能分类第25-27页
        2.3.3 转录本编码序列和蛋白序列的预测第27-29页
            2.3.3.1 转录本编码序列第27页
            2.3.3.2 蛋白序列的预测第27-29页
        2.3.4 足丝蛋白序列鉴定第29-31页
    2.4 讨论第31-33页
    2.5 小结第33-34页
第3章 含贻贝足丝蛋白重组菌的构建和蛋白的表达与纯化第34-43页
    3.1 材料、试剂和仪器第34-35页
        3.1.1 实验菌株和质粒第34页
        3.1.2 培养基第34页
        3.1.3 抗生素、酶和试剂第34页
        3.1.4 引物设计以及合成第34-35页
        3.1.5 主要仪器第35页
    3.2 实验方法第35-37页
        3.2.1 质粒的提取第35页
        3.2.2 编码基因antistasin like protein和pvfp6的PCR扩增第35-36页
        3.2.3 重组质粒的构建第36-37页
        3.2.4 连接产物的转化第37页
        3.2.5 重组子的验证第37页
        3.2.6 工程菌表达目的蛋白第37页
    3.3 结果与分析第37-40页
        3.3.1 质粒提取结果第37-38页
        3.3.2 编码基因antistasin like protein和pvfp6扩增第38-39页
        3.3.3 重组子的验证第39-40页
        3.3.4 工程菌表达目的蛋白第40页
    3.4 讨论第40-42页
    3.5 小结第42-43页
第4章 重组菌对重金属的抗性及富集的研究第43-54页
    4.1 材料、试剂与仪器第43-44页
        4.1.2 培养基第43页
        4.1.3 主要试剂第43页
        4.1.4 主要仪器第43-44页
    4.2 实验方法第44-45页
        4.2.1 重组菌对Hg~(2+)和Cd~(2+)生长抗性的研究第44页
        4.2.2 重组菌对Hg~(2+)和Cd~(2+)平衡富集量的研究第44-45页
            4.2.2.1 菌体制备第44页
            4.2.2.2 重组菌对Hg~(2+)和Cd~(2+)平衡富集量研究第44-45页
    4.3 结果与分析第45-51页
        4.3.1 重组菌对重金属的抗性第45-48页
            4.3.1.1 工程菌对汞的抗性第45-47页
            4.3.1.2 工程菌对镉的抗性第47-48页
        4.3.2 重组菌对重金属的富集第48-51页
            4.3.2.1 重组菌对Hg~(2+)的富集第48-49页
            4.3.2.2 重组菌对Cd~(2+)的富集第49-51页
    4.4 讨论第51-53页
    4.5 小结第53-54页
第5章 结论与展望第54-56页
    5.1 主要结论第54-55页
    5.2 展望第55-56页
参考文献第56-63页
附录第63-65页
缩略语表第65-66页
致谢第66-67页
攻读硕士学位期间的研究成果第67页

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