| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第15-46页 |
| 1.1 引言 | 第15-43页 |
| 1.1.1 次生维管系统的形成 | 第15-17页 |
| 1.1.2 次生维管系统发育的调控 | 第17-29页 |
| 1.1.3 microRNAs的概述 | 第29-43页 |
| 1.2 研究目标和主要研究内容 | 第43-45页 |
| 1.2.1 关键的科学问题与研究目标 | 第43-44页 |
| 1.2.2 主要研究内容 | 第44-45页 |
| 1.3 研究技术路线 | 第45-46页 |
| 第二章 毛白杨次生维管再生过程中miRNAs的鉴定及表达模式分析 | 第46-74页 |
| 2.1 材料与方法 | 第46-53页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第46页 |
| 2.1.2 样品的获得 | 第46页 |
| 2.1.3 石蜡切片和显微观察 | 第46-47页 |
| 2.1.4 总RNA的提取 | 第47-48页 |
| 2.1.5 毛白杨miRNAs的高通量测序及novel miRNAs的预测 | 第48-49页 |
| 2.1.6 miRNAs的标准化和聚类分析 | 第49-50页 |
| 2.1.7 miRNA实时荧光定量PCR的检测 | 第50-51页 |
| 2.1.8 novel miRNAs的验证 | 第51-53页 |
| 2.2 结果与分析 | 第53-72页 |
| 2.2.1 毛白杨次生维管系统再生过程 | 第53-55页 |
| 2.2.2 RNA的提取和检测 | 第55-56页 |
| 2.2.3 毛白杨次生维管再生过程中small RNA高通量测序的结果 | 第56-59页 |
| 2.2.4 毛白杨次生维管再生过程中known和novel miRNAs的鉴定 | 第59-63页 |
| 2.2.5 novel miRNAs中基因簇的发现 | 第63-66页 |
| 2.2.6 毛白杨次生维管再生过程中miRNA的表达模式分析 | 第66-72页 |
| 2.3 小结 | 第72-74页 |
| 第三章 降解组高通量测序鉴定毛白杨次生维管再生过程中miRNAs的靶基因 | 第74-99页 |
| 3.1 材料与方法 | 第74-82页 |
| 3.1.1 植物材料及样品获取 | 第74页 |
| 3.1.2 总RNA的提取 | 第74页 |
| 3.1.3 构建降解组文库 | 第74-77页 |
| 3.1.4 高通量测序和降解组数据分析 | 第77页 |
| 3.1.5 毛白杨维管再生过程中芯片制备 | 第77-80页 |
| 3.1.6 芯片杂交、染色和扫描 | 第80-82页 |
| 3.1.7 芯片数据的处理和分析 | 第82页 |
| 3.2 结果与分析 | 第82-97页 |
| 3.2.1 毛白杨次生维管系统再生过程中的降解组测序结果 | 第82-83页 |
| 3.2.2 通过降解组测序得到的毛白杨miRNA的靶基因 | 第83-88页 |
| 3.2.3 miRNAs的前体能受到自身或其它成熟体miRNAs的剪切 | 第88-91页 |
| 3.2.4 miRNAs靶基因的GO enrichment分析 | 第91-94页 |
| 3.2.5 miRNAs参与调控维管再生过程的生物学途径 | 第94-97页 |
| 3.3 小结 | 第97-99页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第99-110页 |
| 4.1 结论 | 第99-102页 |
| 4.1.1 small RNA高通量测序 | 第99-100页 |
| 4.1.2 miRNAs在毛白杨次生维管再生过程中的表达谱分析 | 第100页 |
| 4.1.3 novel miRNAs中的基因簇 | 第100-101页 |
| 4.1.4 miRNA靶基因的降解组高通量测序分析 | 第101页 |
| 4.1.5 miRNA靶基因的GO enrichment分析 | 第101页 |
| 4.1.6 miRNA前体序列可作为靶基因被自身或其他成熟体miRNA剪切 | 第101-102页 |
| 4.2 讨论 | 第102-108页 |
| 4.2.1 毛白杨次生维管再生过程中miRNA的鉴定 | 第102-103页 |
| 4.2.2 miRNA基因簇可能是起源于不同的基因组复制方式 | 第103-104页 |
| 4.2.3 miRNA前体受到自身或是其它成熟体miRNAs的调控 | 第104页 |
| 4.2.4 miRNAs与其靶基因之间的表达不完全呈负相关 | 第104-105页 |
| 4.2.5 miRNA通过生长素运输和信号途径调控次生维管的再生过程 | 第105-106页 |
| 4.2.6 miRNA介导次生维管再生过程细胞和组织的分化 | 第106-107页 |
| 4.2.7 miRNA介导次生维管再生过程分生组织的发育和结构的分化 | 第107-108页 |
| 4.3 展望 | 第108-110页 |
| 参考文献 | 第110-127页 |
| 附录 | 第127-178页 |
| 在读期间的学术研究 | 第178-179页 |
| 致谢 | 第179-180页 |
