| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 第一章 综述 | 第11-19页 |
| 1.1 禽流感流行病学 | 第12-15页 |
| 1.1.1 LPAIV与HPAIV | 第12-13页 |
| 1.1.2 宿主 | 第13页 |
| 1.1.3 传播机制 | 第13-15页 |
| 1.2 AIV流行现状 | 第15-17页 |
| 1.2.1 流感大流行 | 第15页 |
| 1.2.2 国内流感流行情况 | 第15-16页 |
| 1.2.3 AIV的遗传进化 | 第16页 |
| 1.2.4 影响AIV传播能力的决定因素 | 第16-17页 |
| 1.2.5 疫苗接种 | 第17页 |
| 1.3 本研究的目的与意义 | 第17-19页 |
| 第二章 AIV病原分离鉴定与测序 | 第19-26页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-22页 |
| 2.1.1 鸡胚与红细胞及病原保存液 | 第19页 |
| 2.1.2 AIV标准阳性抗原与血清 | 第19页 |
| 2.1.3 引物与试剂 | 第19页 |
| 2.1.4 样品采样 | 第19页 |
| 2.1.5 病毒分离 | 第19-20页 |
| 2.1.6 血凝抑制试验 | 第20页 |
| 2.1.7 病毒纯化 | 第20页 |
| 2.1.8 病毒全基因序列测定 | 第20-22页 |
| 2.2 结果 | 第22-25页 |
| 2.2.1 AIV阳性分离情况 | 第22页 |
| 2.2.2 养殖场AIV地域分布情况 | 第22-24页 |
| 2.2.3 各AIV分离株HA及NA亚型组合结果 | 第24-25页 |
| 2.3 小结及讨论 | 第25-26页 |
| 第三章 各亚型AIV的遗传进化分析 | 第26-75页 |
| 3.1 方法 | 第26页 |
| 3.1.1 AIV毒株挑选 | 第26页 |
| 3.1.2 基因进化树的绘制 | 第26页 |
| 3.1.3 基因型的划分 | 第26页 |
| 3.2 AIV分离株HA基因的遗传演化分析 | 第26-52页 |
| 3.2.1 H5亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第26-30页 |
| 3.2.2 H1亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第30-31页 |
| 3.2.3 H3亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第31-35页 |
| 3.2.4 H4亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第35-38页 |
| 3.2.5 H6亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第38-40页 |
| 3.2.6 H7亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第40页 |
| 3.2.7 H9亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第40-41页 |
| 3.2.8 H10亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第41页 |
| 3.2.9 H11亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第41-52页 |
| 3.3 AIV分离株NA基因的遗传演化分析 | 第52-61页 |
| 3.3.1 N1亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第52页 |
| 3.3.2 N2亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第52页 |
| 3.3.3 N3亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第52-53页 |
| 3.3.4 N4亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第53页 |
| 3.3.5 N5亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第53页 |
| 3.3.6 N6亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第53页 |
| 3.3.7 N7亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第53-54页 |
| 3.3.8 N8亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第54页 |
| 3.3.9 N9亚型AIV毒株序列及遗传进化分析 | 第54-61页 |
| 3.4 内部基因的遗传演化分析 | 第61-71页 |
| 3.4.1 PB2基因 | 第61-63页 |
| 3.4.2 PB1基因 | 第63-65页 |
| 3.4.3 PA基因 | 第65页 |
| 3.4.4 NP基因 | 第65-68页 |
| 3.4.5 M基因 | 第68页 |
| 3.4.6 NS基因 | 第68-71页 |
| 3.5 53株AIV基因型划分结果与分析 | 第71-73页 |
| 3.6小结与讨论 | 第73-75页 |
| 第四章 全文结论 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 作者简介 | 第82页 |