| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-22页 |
| ·转基因作物的安全性 | 第12-15页 |
| ·转基因作物 | 第12页 |
| ·转基因作物的安全评价 | 第12-15页 |
| ·分子特征 | 第12-13页 |
| ·遗传稳定性 | 第13-14页 |
| ·环境安全性 | 第14页 |
| ·食品安全性 | 第14-15页 |
| ·转基因水稻研究进展 | 第15-17页 |
| ·抗病毒转基因水稻 | 第16页 |
| ·转基因水稻中的外源基因 | 第16-17页 |
| ·转基因植物中侧翼序列获得方法的研究 | 第17-20页 |
| ·HiTail-PCR | 第17-18页 |
| ·反向PCR | 第18-19页 |
| ·Genome walking | 第19-20页 |
| ·基因表达差异的分析 | 第20-21页 |
| ·数字基因表达谱测序 | 第20-21页 |
| ·Swath测序 | 第21页 |
| ·本课题的目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-32页 |
| ·材料 | 第22-23页 |
| ·转基因材料 | 第22页 |
| ·非转基因材料 | 第22页 |
| ·菌株与质粒 | 第22页 |
| ·酶和生化试剂 | 第22页 |
| ·引物 | 第22-23页 |
| ·实验方法 | 第23-32页 |
| ·植物总DNA的提取（CTAB法） | 第23-24页 |
| ·转基因植株的PCR检测 | 第24页 |
| ·转基因植物的Southern blot分析 | 第24-27页 |
| ·植物总DNA的酶切 | 第24页 |
| ·DNA凝胶电泳 | 第24-25页 |
| ·转膜 | 第25页 |
| ·探针标记（随机引物法） | 第25页 |
| ·预杂交与杂交 | 第25-26页 |
| ·洗膜与显影 | 第26-27页 |
| ·HiTail-PCR获得侧翼序列 | 第27-28页 |
| ·Genome walking方法获得侧翼序列 | 第28-32页 |
| ·预酶切 | 第28-29页 |
| ·酶切 | 第29页 |
| ·纯化酶切后的DNA | 第29页 |
| ·连接接头 | 第29-30页 |
| ·初步PCR | 第30页 |
| ·第二步PCR | 第30-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-52页 |
| ·确定实验材料目的基因的拷贝数 | 第32页 |
| ·KRSV-1 插入的T-DNA的染色体定位 | 第32-38页 |
| ·KRSV-1 插入的T-DNA右边界侧翼序列的获得 | 第32-35页 |
| ·HiTail-PCR的方法获得侧翼序列 | 第32-34页 |
| ·普通PCR验证获得的侧翼序列 | 第34-35页 |
| ·KRSV-1 插入的T-DNA左边界侧翼序列的获得 | 第35-38页 |
| ·HiTail-PCR的方法获得侧翼序列 | 第35-36页 |
| ·Genome Walking的方法获得侧翼序列 | 第36-38页 |
| ·T-DNA在水稻基因组中插入位点的鉴定 | 第38-46页 |
| ·T-DNA右边界侧翼序列向水稻基因方向的探究 | 第38-45页 |
| ·T-DNA左边界侧翼序列向水稻基因方向的探究 | 第45页 |
| ·T-DNA在转基因水稻KRSV-1 基因组中整合方式的分析 | 第45-46页 |
| ·水稻的数字基因表达谱测序分析 | 第46-48页 |
| ·数字基因表达谱测序结果的获得 | 第46页 |
| ·数字基因表达谱测序结果的分析 | 第46-48页 |
| ·Swath测序分析 | 第48-52页 |
| ·Swath测序结果的获得 | 第48页 |
| ·Swath测序结果的分析 | 第48-52页 |
| 4 讨论 | 第52-55页 |
| 5 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
