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菊花脑低氮胁迫表达谱分析及microRNA挖掘

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
缩略词表第9-10页
引言第10-12页
第一章 文献综述第12-22页
 1 植物的氮素营养第12-13页
   ·氮素是重要的生命元素第12页
   ·氮素利用现状第12-13页
 2 氮素吸收、转运、同化和再活化第13-18页
   ·氮吸收和转运第13-15页
   ·NO_3~-的还原第15-16页
   ·氨同化第16-17页
   ·氮再活化第17页
   ·转基因提高氮素利用率第17-18页
 3 植物低氮胁迫表达谱和相关MIRNA的研究进展第18-21页
   ·植物低氮胁迫表达谱研究进展第19页
   ·参与低氮胁迫调节的miRNA第19-21页
 4 本研究的目的意义第21-22页
第二章 低氨胁迫下菊花脑表达谱分析第22-44页
 摘要第22-23页
 1 材料与方法第23-25页
   ·实验材料第23页
   ·实验方法第23-24页
   ·RNA提取和Illumina测序第24页
   ·基因注释第24页
   ·qRT-PCR验证DTGs通过第24-25页
 2 结果与分析第25-36页
   ·RNA-Seq测序结果质量评估第25-27页
   ·菊花脑响应低氮胁迫的差异表达基因(DTGs)第27页
   ·对DTGs进行Gene Ontology(GO)和KEGG pathway分析第27-34页
   ·响应于低氮胁迫的转录因子、激酶参与光合作用、氮代谢等基因第34页
   ·qRT-PCR验证差异表达基因第34-36页
 3 讨论第36-44页
   ·响应低氮胁迫的转录因子第36-37页
   ·DTGs中参与光合作用的基因第37-38页
   ·DTGs中参与氮代谢的基因第38-39页
   ·响应低氮胁迫的激酶第39-44页
第三章 菊花脑低氨胁迫下miRNA差异表达分析第44-62页
 摘要第44-45页
 1 材料和方法第45-46页
   ·植物材料第45页
   ·营养液配法第45页
   ·低氮处理过程第45页
   ·RNA提取第45页
   ·Illumina测序第45页
   ·基因注释第45-46页
   ·鉴定响应低氮胁迫的miRNA第46页
   ·Real-time RCR定量验证第46页
 2 结果与分析第46-60页
   ·高通量测序的小RNA库信息第46-49页
   ·差异表达miRNA的鉴定与比较分析第49-52页
   ·差异表达miRNA靶基因预测及其功能分析第52-54页
   ·qRT-PCR分析菊花脑根及叶片低硝酸盐响应miRNA第54-60页
 3 讨论和结论第60-62页
全文结论第62-64页
创新之处第64-66页
参考文献第66-78页
附录一第78-79页
附录二第79-82页
附录三第82-85页
附录四第85-90页
攻读学位期间论文发表情况及获奖情况第90-92页
致谢第92页

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