| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-24页 |
| ·真菌的生存策略 | 第9-11页 |
| ·腐生 | 第9页 |
| ·捕食 | 第9-10页 |
| ·共生 | 第10页 |
| ·寄生 | 第10页 |
| ·植物内生 | 第10-11页 |
| ·植物内生真菌 | 第11-14页 |
| ·植物内生真菌研究简史 | 第11-12页 |
| ·植物内生真菌的种类 | 第12页 |
| ·植物内生真菌的内生生存机制研究进展 | 第12-13页 |
| ·植物内生真菌的次级代谢产物 | 第13-14页 |
| ·真菌组学是解决真菌生存策略及次级代谢的有效手段 | 第14-16页 |
| ·真菌组学与生存策略 | 第15-16页 |
| ·真菌组学与次级代谢 | 第16页 |
| ·次级代谢产物合成的途径及其调控 | 第16-21页 |
| ·次级代谢产物的合成途径 | 第16-18页 |
| ·次级代谢的调控 | 第18-21页 |
| ·拟盘多毛孢属的研究进展 | 第21-23页 |
| ·拟盘多毛孢属的生物学 | 第21页 |
| ·拟盘多毛孢属真菌的次级代谢 | 第21-22页 |
| ·无花果拟盘多毛孢的研究进展 | 第22-23页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第23-24页 |
| 第二章 无花果拟盘多毛孢基因组的基本特征 | 第24-37页 |
| ·材料与方法 | 第24-27页 |
| ·试验材料 | 第24-25页 |
| ·基因组测序与组装 | 第25页 |
| ·基因预测与功能注释 | 第25-26页 |
| ·转座子(TE)和重复诱导点突变(RIP)的分析 | 第26页 |
| ·交配型基因分析 | 第26页 |
| ·直系基因预测及系统发育分析 | 第26-27页 |
| ·多基因家族分析及蛋白家族进化 | 第27页 |
| ·结果与分析 | 第27-35页 |
| ·无花果拟盘多毛孢基因组测序与组装 | 第27-28页 |
| ·无花果拟盘多毛孢基因组特征 | 第28-29页 |
| ·无花果拟盘多毛孢的交配型预测 | 第29-31页 |
| ·无花果拟盘多毛孢的多基因家族分析 | 第31-33页 |
| ·蛋白家族进化分析 | 第33-35页 |
| ·讨论 | 第35页 |
| ·小结 | 第35-37页 |
| 第三章 无花果拟盘多毛孢内生生存策略的研究 | 第37-58页 |
| ·材料与方法 | 第37-39页 |
| ·试验材料 | 第37-38页 |
| ·无花果拟盘多毛孢的GFP标记 | 第38-39页 |
| ·无花果拟盘多毛孢在茶树内的定殖 | 第39页 |
| ·碳水化合物活性酶(CAZyme)分析 | 第39页 |
| ·转运蛋白的分析 | 第39页 |
| ·效应蛋白的分析 | 第39页 |
| ·细胞色素P450的分析 | 第39页 |
| ·结果与分析 | 第39-56页 |
| ·无花果拟盘多毛孢在茶树内的定殖 | 第39-40页 |
| ·无花果拟盘多毛孢基因组编码的碳水化合物活性酶 | 第40-48页 |
| ·转运蛋白家族的扩张 | 第48-50页 |
| ·无花果拟盘多毛孢编码的分泌组和效应子 | 第50-54页 |
| ·细胞色素P450单氧化酶的分析 | 第54-56页 |
| ·讨论 | 第56-57页 |
| ·小结 | 第57-58页 |
| 第四章 无花果拟盘多毛孢次级代谢产物丰富的基因组基础 | 第58-67页 |
| ·材料与方法 | 第58-60页 |
| ·试验材料 | 第58页 |
| ·次级代谢基因及其基因簇的注释 | 第58页 |
| ·无花果拟盘多毛孢的转录组分析 | 第58-59页 |
| ·聚酮合酶基因结构域预测及其进化分析 | 第59页 |
| ·双烯加成酶的鉴定和系统发育 | 第59-60页 |
| ·结果与分析 | 第60-65页 |
| ·无花果拟盘多毛孢合成次级代谢产物的潜力 | 第60-62页 |
| ·无花果拟盘多毛孢次级代谢基因簇的转录组分析 | 第62页 |
| ·无花果拟盘多毛孢中聚酮合酶基因的进化 | 第62-64页 |
| ·推测的双烯加成反应酶基因 | 第64-65页 |
| ·讨论 | 第65-66页 |
| ·小结 | 第66-67页 |
| 第五章 无花果拟盘多毛孢的转录因子PfzipA对次级代谢及活性氧胁迫的调控 | 第67-87页 |
| ·材料与方法 | 第67-78页 |
| ·试验材料 | 第67-69页 |
| ·大肠杆菌转化及质粒提取 | 第69-70页 |
| ·酵母菌感受态制备转化及质粒提取 | 第70页 |
| ·农杆菌感受态的制备及转化 | 第70-71页 |
| ·Southern blot分析 | 第71-73页 |
| ·无花果拟盘多毛孢基因组中转录因子PfbzipA的鉴定及生物信息学分析 | 第73页 |
| ·PfbzipA基因表达分析 | 第73-74页 |
| ·PfbzipA基因敲除突变株的构建 | 第74-76页 |
| ·PfbzipA突变株的氧化胁迫 | 第76-77页 |
| ·PfbzipA突变株的HPLC分析 | 第77页 |
| ·数据处理 | 第77-78页 |
| ·结果与分析 | 第78-85页 |
| ·无花果拟盘多毛孢基因组中转录因子PfbzipA的鉴定 | 第78-79页 |
| ·PfbzipA基因表达分析 | 第79页 |
| ·PfbzipA敲除突变株的构建 | 第79-81页 |
| ·PfbzipA突变株对氧化胁迫的应答 | 第81-82页 |
| ·PfbzipA基因对次级代谢的影响 | 第82-84页 |
| ·氧化胁迫时PfbzipA基因对次级代谢的影响 | 第84-85页 |
| ·讨论 | 第85-86页 |
| ·小结 | 第86-87页 |
| 第六章 结论 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-102页 |
| 致谢 | 第102-104页 |
| 作者简历 | 第104页 |
| 发表论文 | 第104页 |
