| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述: miRNA与哺乳动物生殖的研究进展 | 第9-17页 |
| ·miRNA发现 | 第9页 |
| ·miRNA生成 | 第9-10页 |
| ·miRNA作用机制 | 第10-11页 |
| ·miRNA异构体与碱基变异 | 第11-12页 |
| ·miRNA研究方法 | 第12-13页 |
| ·动物miRNA研究概况 | 第13-15页 |
| ·研究内容 | 第15-16页 |
| ·研究目的与意义 | 第16-17页 |
| 第二章 香猪睾丸组织miRNA文库构建及高通量测序 | 第17-29页 |
| ·材料 | 第17-18页 |
| ·方法 | 第18-29页 |
| ·不同发育阶段香猪睾丸组织的形态学分析 | 第18-19页 |
| ·总RNA提取与质量检测 | 第19-20页 |
| ·小分子RNA cDNA文库构建 | 第20-22页 |
| ·HiSeq高通量测序 | 第22-24页 |
| ·基于HiSeq测序的miRNA差异表达分析 | 第24页 |
| ·实时荧光定量PCR验证 | 第24-28页 |
| ·实时荧光定量PCR分析 | 第28-29页 |
| 第三章 结果 | 第29-67页 |
| ·香猪睾丸组织的显微结构 | 第29-31页 |
| ·样品总RNA提取与质量检测 | 第31-32页 |
| ·HiSeq文库测序结果生物信息学分析 | 第32-62页 |
| ·HiSeq文库概述 | 第32-35页 |
| ·小RNA与猪基因组序列的比对 | 第35-36页 |
| ·小RNA在各条染色体上的分布 | 第36-37页 |
| ·小RNA的分类注释 | 第37页 |
| ·己知与保守miRNA分析 | 第37-42页 |
| ·与猪同源的共有及特有miRNA分析 | 第42-43页 |
| ·高丰度miRNA分析 | 第43-44页 |
| ·共表达miRNAs的聚类分析 | 第44-45页 |
| ·miRNA碱基特性分析 | 第45-47页 |
| ·isomiRs分析 | 第47-52页 |
| ·新的miRNA分析 | 第52页 |
| ·基于HiSeq测序的miRNAs差异表达分析 | 第52-54页 |
| ·Real time q RT-PCR | 第54-56页 |
| ·差异表达miRNA的靶基因预测 | 第56-57页 |
| ·miRNAs靶基因及功能分析 | 第57-61页 |
| ·KEGG分析 | 第61-62页 |
| ·miRNA的时序性表达规律研究 | 第62-65页 |
| ·miRNA在其它组织的表达 | 第65-67页 |
| 第四章 讨论 | 第67-71页 |
| ·香猪睾丸组织的形态学分析 | 第67页 |
| ·关于miRNA的鉴定方法 | 第67-68页 |
| ·不同时期特有miRNA分析 | 第68-69页 |
| ·microRNA差异表达分析 | 第69页 |
| ·靶基因功能分析 | 第69页 |
| ·miRNA表达分析 | 第69-71页 |
| 第五章 小结 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 附录一 | 第78-79页 |
| 附录二 | 第79-118页 |