| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| 1. 研究背景 | 第13-16页 |
| ·我国城市河道污染现状及治理瓶颈 | 第13-14页 |
| ·仿生植物净化污染河道研究现状分析 | 第14-15页 |
| ·金山湖和古运河概况 | 第15-16页 |
| 2. 氨氧化细菌和氨氧化古菌的分类及环境因子对其生态分布的影响 | 第16-26页 |
| ·AOB的分类及环境因子对其生态分布的影响 | 第17-21页 |
| ·AOA的分类及环境因子对其生态分布的影响 | 第21-26页 |
| 3. 研究目的、主要内容和技术路线 | 第26-29页 |
| ·研究目的 | 第26页 |
| ·研究的主要内容 | 第26-27页 |
| ·技术路线 | 第27-29页 |
| 第二章 研究方法 | 第29-47页 |
| 1. 试验仪器和生化试剂 | 第29-32页 |
| ·试验仪器 | 第29-30页 |
| ·主要生化试剂 | 第30-32页 |
| 2. 仿生植物的制作 | 第32-33页 |
| 3. 室内外实验设计 | 第33-36页 |
| ·古运河流域相关实验设计 | 第33-35页 |
| ·仿生植物相关实验设计 | 第35-36页 |
| ·环境因子相关实验设计 | 第36页 |
| 4. 理化参数的测定 | 第36页 |
| 5. DNA的提取 | 第36-37页 |
| 6. 引物的选择和PCR扩增 | 第37-41页 |
| ·引物的选择 | 第37-39页 |
| ·PCR扩增 | 第39-41页 |
| 7. 克隆文库的构建 | 第41-44页 |
| ·扩增产物的连接、转化与筛选 | 第41-42页 |
| ·DNA测序 | 第42-44页 |
| ·克隆文库的分析 | 第44页 |
| 8. 系统发育分析 | 第44页 |
| 9. 实时荧光定量PCR | 第44-46页 |
| ·实时荧光定量PCR程序 | 第44-45页 |
| ·标准曲线的建立 | 第45-46页 |
| 10. 数据分析 | 第46-47页 |
| ·多样性指数和物种丰度计算 | 第46页 |
| ·多元统计分析 | 第46-47页 |
| 第三章 古运河流域氨氧化微生物群落结构及其对环境因子的响应 | 第47-97页 |
| 1. 引言 | 第47-48页 |
| 2. 金山湖AOA和AOB群落结构及其对环境因子的响应 | 第48-70页 |
| ·金山湖环境样品理化参数 | 第48-50页 |
| ·金山湖环境样品amoA基因定量分析 | 第50-54页 |
| ·金山湖环境样品amoA基因多样性分析 | 第54-58页 |
| ·金山湖环境样品amoA基因系统发育分析 | 第58-66页 |
| ·金山湖环境样品AOA和AOB群落结构与环境因子的相关性分析 | 第66-67页 |
| ·金山湖环境样品AOA和AOB群落结构聚类分析 | 第67-69页 |
| ·小结 | 第69-70页 |
| 3. 大运河镇江段AOA和AOB群落结构及对环境因子的响应 | 第70-80页 |
| ·大运河镇江段水样理化参数 | 第70-71页 |
| ·大运河镇江段amoA基因定量分析 | 第71-73页 |
| ·大运河镇江段amoA基因多样性分析 | 第73-74页 |
| ·大运河镇江段amoA基因系统发育分析 | 第74-78页 |
| ·大运河镇江段AOA和AOB群落结构与环境因子相关性分析 | 第78页 |
| ·大运河镇江段AOA和AOB群落结构聚类分析 | 第78-79页 |
| ·小结 | 第79-80页 |
| 4. 古运河AOA和AOB群落结构及对环境因子的响应 | 第80-95页 |
| ·古运河水样理化参数 | 第80-82页 |
| ·古运河水样amoA基因克隆文库构建 | 第82-85页 |
| ·古运河水样amoA基因定量分析 | 第85-86页 |
| ·古运河水样amoA基因多样性分析 | 第86页 |
| ·古运河水样amoA基因系统发育分析 | 第86-92页 |
| ·古运河水样AOA和AOB群落结构与环境因子相关性分析 | 第92-93页 |
| ·古运河AOA和AOB群落结构聚类分析 | 第93-94页 |
| ·小结 | 第94-95页 |
| 5. 本章小结 | 第95-97页 |
| 第四章 仿生植物附着氨氧化微生物群落结构及其对环境因子的响应 | 第97-116页 |
| 1. 引言 | 第97-98页 |
| 2. 结果和讨论 | 第98-114页 |
| ·仿生植物理化参数 | 第98-99页 |
| ·仿生植物样品的形态观察 | 第99-102页 |
| ·仿生植物amoA基因RFLP分析 | 第102-104页 |
| ·仿生植物amoA基因定量分析 | 第104-106页 |
| ·仿生植物amoA基因多样性分析 | 第106-108页 |
| ·仿生植物amoA基因系统发育分析 | 第108-112页 |
| ·仿生植物AOA和AOB的群落结构与环境因子相关性分析 | 第112-113页 |
| ·仿生植物AOA和AOB群落结构聚类分析 | 第113-114页 |
| 3. 本章小结 | 第114-116页 |
| 第五章 室内控制单环境因子对仿生植物附着氨氧化微生物群落结构的影响 | 第116-143页 |
| 1. 引言 | 第116-117页 |
| 2. 克隆文库构建 | 第117-119页 |
| 3. 温度对AOA和AOB生态分布的影响 | 第119-127页 |
| ·温度对amoA基因丰度的影响 | 第120-122页 |
| ·温度对AOA和AOB群落结构的影响 | 第122-127页 |
| 4. pH对AOA和AOB生态分布的影响 | 第127-133页 |
| ·pH对AOB的影响 | 第128-129页 |
| ·pH对AOA的amoA基因丰度的影响 | 第129-130页 |
| ·pH对AOA群落结构的影响 | 第130-133页 |
| 5. 氨氮浓度对AOA和AOB生态分布的影响 | 第133-142页 |
| ·氨氮浓度对amoA基因丰度的影响 | 第133-135页 |
| ·氨氮浓度对AOA和AOB群落结构的影响 | 第135-142页 |
| 6. 本章小结 | 第142-143页 |
| 第六章 结论与展望 | 第143-146页 |
| 1. 主要结论 | 第143-144页 |
| 2. 本论文创新点 | 第144页 |
| 3. 不足与展望 | 第144-146页 |
| 参考文献 | 第146-160页 |
| 致谢 | 第160-161页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第161页 |
