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高温胁迫下水稻幼穗基因表达谱和高温诱导型启动子分析

Abstract第1-6页
摘要第6-12页
Chapter 1 Introduction第12-32页
 1 Abiotic stresses第12-19页
 2 Abiotic stress-inducible genes第19-20页
 3 Role of transcription factors in heat stress responses第20-21页
 4 cis-acting regulatory elements第21-22页
 5 Heat shock proteins/molecular chaperones第22页
 6 Promoters第22-23页
 7 Promoters in Transgenic rice第23-25页
 8 Reporter Gene第25-26页
 9 DNA Microarray Technology第26-27页
 10 Transcript Profiling and the response mechanisms under heat stress第27-31页
 11 The Objective of this research第31-32页
Chapter 2 Microarray data uncover the genome-wide response to heat in rice post-meiosispanicle第32-62页
 1 Materials and methods第32-37页
     ·Plant materials and heat treatments第32-33页
     ·RNA isolation and Purification for cDNA Microarray第33-34页
     ·Microarray Hybridization, Signal Scanning and Normalization第34-36页
     ·Data Filtering, Clustering and Functional Classification第36-37页
     ·qRT-PCR Analysis第37页
 2 Result第37-59页
     ·Replicate analysis and quantitative real-time PCR (qRT-PCR) confirmation第37-40页
     ·Expression pattern of deferentially expressed genes during heat treatment第40-41页
     ·Functional identification of the heat-responsive (HR) genes第41-43页
     ·Cellular response第43-50页
     ·Regulation-related genes第50-58页
     ·Metabolism-related genes第58-59页
 3 Discussion第59-62页
Chapter 3 Expression Analysis of Six Heat Stress-inducible Genes in Rice第62-73页
 1 Materials and methods第62-66页
     ·Identification of candidate stress inducible genes from microarray data第62页
     ·Plants Materials, Growth Condition第62-63页
     ·RNA Isolation and quantitative RT-PCR analysis第63-66页
 2 Result第66-71页
     ·Expression of six selected rice genes under abiotic stresses as revealed by Microarray data第66-68页
     ·Expression pattern of the six selected genes in different tissues第68页
     ·Expression patterns of the six genes under abiotic stresses and the ABA treatment validated by quantitative RT-PCR第68-71页
 3 Discussion第71-73页
Chapter 4 Expression Analysis of Abiotic Stress-inducible Promoters in Rice第73-83页
 1 Materials and methods第73-77页
     ·Bioinformatics analysis of the promoters of three inducible genes第73页
     ·Plasmid construction for the three stress-inducible promoters第73-74页
     ·Plant Transformation第74-75页
     ·Polymerase chain reaction (PCR) screening on transgenic rice第75页
     ·Heat and Drought treatments on transgenic rice lines第75页
     ·GUS gene expression analysis by qRT-PCR第75-76页
     ·Histochemical GUS Staining第76页
     ·Quantitative GUS activity assay第76-77页
 2 Result第77-82页
     ·Bioinformatics analysis on the promoters of three stress-inducible genes第77页
     ·Confirmation of the stress-inducible promoter:GUS recombinants through PCR第77-78页
     ·Confirmation of the T2 transgenics through PCR第78-79页
     ·Expression of GUS gene driven by the three stress-inducible promoters in transgenic rice第79-82页
 3 Discussion第82-83页
Chapter 5 Conclusion, Innovation and Future Research第83-86页
 1 Conclusion第83-84页
 2 Innovation第84-85页
 3 Future Research第85-86页
References第86-103页
Acknowledgments第103-104页
About the Author第104页

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