| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| ·杂草稻的介绍 | 第11-15页 |
| ·杂草稻的分布和一般特征特性 | 第11页 |
| ·杂草稻的起源 | 第11-12页 |
| ·杂草稻的进化和分类 | 第12-13页 |
| ·杂草稻的传播途径 | 第13-14页 |
| ·杂草稻的研究现状和利用前景 | 第14-15页 |
| ·国内对杂草稻的研究 | 第14-15页 |
| ·国外对杂草稻的研究 | 第15页 |
| ·核核糖体 DNA 在植物系统发育研究中的应用与进展 | 第15-18页 |
| ·nrDNA 的基本结构和特点 | 第15-16页 |
| ·nrDNA 的系统学应用 | 第16-18页 |
| ·ITS 序列的特点和应用 | 第16-17页 |
| ·其它非编码区的应用 | 第17页 |
| ·编码区序列的应用 | 第17-18页 |
| ·5S 核糖体 RNA 基因的利用 | 第18页 |
| ·PCR 技术 | 第18-20页 |
| ·PCR 技术的基本原理 | 第18-19页 |
| ·PCR 反应的步骤 | 第19-20页 |
| ·常规程序 | 第19页 |
| ·复性（退火）和延伸温度 | 第19页 |
| ·反应时间 | 第19-20页 |
| ·循环次数 | 第20页 |
| ·本实验研究的意义和前景 | 第20-21页 |
| 第二章 材料与方法 | 第21-28页 |
| ·实验材料和试剂 | 第21-22页 |
| ·材料来源 | 第21页 |
| ·分子生物学或生化试剂 | 第21页 |
| ·试剂的配制 | 第21-22页 |
| ·杂草稻 DNA 的提取（改进的 CTAB 法） | 第22页 |
| ·nrDNAITS 的 PCR 扩增 | 第22-23页 |
| ·nrDNA ITS 引物的设计 | 第22-23页 |
| ·nrDNA ITS PCR 反应条件 | 第23页 |
| ·nrDNA ITS PCR 条件的优化 | 第23页 |
| ·凝胶电泳的制备和 PCR 的检测 | 第23页 |
| ·PCR 扩增产物的直接测序 | 第23-24页 |
| ·nrDNAITS 的克隆测序 | 第24-27页 |
| ·DNA 片段的回收 | 第24页 |
| ·回收片段的连接 | 第24-25页 |
| ·大肠杆菌（Ecoli）感受态细胞的制备 | 第25页 |
| ·连接子的转化 | 第25-26页 |
| ·重组子的筛选、鉴定 | 第26页 |
| ·质粒的提取和检测 | 第26-27页 |
| ·序列的生物信息学分析 | 第27-28页 |
| 第三章 实验结果与讨论 | 第28-39页 |
| ·杂草稻 nrDNAITS 序列的 PCR 条件优化 | 第28-31页 |
| ·退火温度对 PCR 体系的影响 | 第28页 |
| ·模板 DNA 浓度对 PCR 体系的影响 | 第28-29页 |
| ·dNTP 浓度对的 PCR 影响 | 第29页 |
| ·引物浓度对的 PCR 影响 | 第29-30页 |
| ·Taq DNA 聚合酶浓度对的 PCR 影响 | 第30页 |
| ·最优的 PCR 反应体系 | 第30-31页 |
| ·杂草稻 nrDNA ITS 序列的直接测序 | 第31-32页 |
| ·nrDNA ITS 的克隆和测序 | 第32-35页 |
| ·片段的回收与克隆 | 第32-34页 |
| ·阳性克隆的质粒提取和检测 | 第34页 |
| ·序列测定和分析 | 第34-35页 |
| ·序列结果的系统学信息分析 | 第35-37页 |
| ·克隆测序和直接测序的比较 | 第37-39页 |
| 第四章 结论 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
| 附录 A | 第45-48页 |