| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 前言 | 第9-19页 |
| ·湖泊沉积物简介 | 第9-10页 |
| ·湖泊沉积物中微生物类群组成 | 第10-12页 |
| ·湖泊沉积物中细菌类群组成 | 第10-11页 |
| ·湖泊沉积物中古菌类群组成 | 第11-12页 |
| ·湖泊沉积物中真菌类群组成 | 第12页 |
| ·湖泊沉积物中微生物群落结构的垂直分布 | 第12-14页 |
| ·湖泊沉积物中微生物在地球化学循环中的作用 | 第14-15页 |
| ·湖泊沉积物中微生物类群多样性的研究方法 | 第15-17页 |
| ·基于微生物纯培养的方法 | 第15-16页 |
| ·分子生物学的研究方法 | 第16-17页 |
| ·洪湖研究概况 | 第17-18页 |
| ·研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-31页 |
| ·实验材料 | 第19-21页 |
| ·样品的采集与处理 | 第19页 |
| ·主要的仪器和设备 | 第19-20页 |
| ·主要试剂与溶液 | 第20-21页 |
| ·所用试剂及生产公司 | 第20页 |
| ·培养基及溶液配置 | 第20-21页 |
| ·引物及序列 | 第21页 |
| ·实验方法 | 第21-31页 |
| ·样品理化性质的测定 | 第21-22页 |
| ·含水量的测定 | 第21-22页 |
| ·pH值的测定 | 第22页 |
| ·总碳、总有机碳、总氮和总磷的测定 | 第22页 |
| ·样品总DNA和总RNA的提取 | 第22-24页 |
| ·样品总DNA的提取 | 第22-23页 |
| ·样品总RNA的提取及cDNA的合成 | 第23-24页 |
| ·细菌16S rDNA与反转录16S rRNA的巢氏PCR | 第24-25页 |
| ·16S rDNA的巢氏PCR | 第24页 |
| ·反转录16S rRNA的巢氏PCR | 第24-25页 |
| ·古菌16S rDNA与反转录16S rRNA的巢氏PCR | 第25-26页 |
| ·16S rDNA的巢氏PCR | 第25-26页 |
| ·反转录16S rRNA的巢氏PCR | 第26页 |
| ·真菌rDNA内转录间隔区(ITS)的巢氏PCR | 第26-27页 |
| ·PCR产物纯化 | 第27页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第27-29页 |
| ·DGGE条带的回收与测序 | 第29-30页 |
| ·DGGE条带切胶回收与扩增 | 第29页 |
| ·PCR产物与载体的连接 | 第29页 |
| ·转化 | 第29页 |
| ·阳性克隆子的验证 | 第29-30页 |
| ·测序 | 第30页 |
| ·DGGE条带的系统发育分析 | 第30-31页 |
| 第三章 结果与分析 | 第31-48页 |
| ·样品主要理化性质 | 第31页 |
| ·总DNA和总RNA的提取及PCR扩增 | 第31-34页 |
| ·细菌16S rDNA与反转录16S rRNA的巢氏PCR | 第31-32页 |
| ·古菌16S rDNA与反转录16S rRNA的巢氏PCR | 第32-33页 |
| ·真菌rDNA内转录间隔区ITS的巢氏PCR | 第33-34页 |
| ·细菌群落结构的垂直变化及DGGE条带的系统发育分析 | 第34-40页 |
| ·DGGE图谱及回收条带的系统发育分析 | 第34-36页 |
| ·多样性指数和DGGE图谱的聚类分析 | 第36-40页 |
| ·古菌群落结构的垂直变化及DGGE条带的系统发育分析 | 第40-44页 |
| ·DGGE图谱及回收条带的系统发育分析 | 第40-41页 |
| ·多样性指数和DGGE图谱的聚类分析 | 第41-44页 |
| ·真菌群落结构的垂直变化及DGGE条带的系统发育分析 | 第44-48页 |
| ·DGGE图谱及回收条带的系统发育分析 | 第44-45页 |
| ·多样性指数及DGGE图谱的聚类分析 | 第45-48页 |
| 第四章 讨论 | 第48-54页 |
| ·沉积物中微生物群落结构的垂直分布 | 第48-50页 |
| ·细菌和古菌群落结构的垂直分布 | 第48-49页 |
| ·真菌群落结构的垂直分布 | 第49-50页 |
| ·微生物群落结构与沉积物主要理化性质的关系 | 第50-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读硕士学位期间已发表及整理的文章 | 第63页 |
