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R在QTL定位中的应用及其与其他QTL定位软件的比较

中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-7页
一、前言第7-16页
 1. QTL第7页
   ·数量性状第7页
   ·QTL与QTL作图第7页
 2 QTL作图的群体第7-8页
 3、QTL作图的常用方法第8-11页
   ·单标记分析(SMA,single marker analysis)第8页
   ·单区间作图(IM,interval mapping)第8页
   ·复合区间作图(CIM,composite interval mappig)第8-9页
   ·多区间作图(MIM,multiple interval mapping)第9页
   ·基于混合线性模型的复合区间作图法(MCIM,mixed-model based composite intervalmapping)第9-10页
   ·完备复合区间作图(ICIM,Inclusive composite interval mapping)第10页
   ·Bayesian方法第10-11页
 4、QTL作图的常用软件第11-12页
   ·QTL Cartograph第11页
   ·ICIMapping第11-12页
   ·QTLNetwork第12页
 5、R第12-16页
   ·什么是R第12页
   ·R的特点与功能第12-14页
   ·package(包)第14页
   ·R与QTL定位第14-16页
二、材料与方法第16-19页
三、结果与分析第19-64页
 1、表型数据分析第19-20页
 2、QTL定位分析第20-64页
   ·R/qtl的结果比较第20-29页
   ·R/qtlbim的结果比较第29-31页
   ·MA方法结果比较第31-40页
   ·IM方法结果比较第40-51页
   ·CIM方法结果比较第51-62页
   ·上位性QTL结果比较第62-64页
四、小结与讨论第64-68页
五、参考文献第68-72页
附录1 自定义函数PEAKS第72-73页
致谢第73-74页

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