中文摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-7页 |
一、前言 | 第7-16页 |
1. QTL | 第7页 |
·数量性状 | 第7页 |
·QTL与QTL作图 | 第7页 |
2 QTL作图的群体 | 第7-8页 |
3、QTL作图的常用方法 | 第8-11页 |
·单标记分析(SMA,single marker analysis) | 第8页 |
·单区间作图(IM,interval mapping) | 第8页 |
·复合区间作图(CIM,composite interval mappig) | 第8-9页 |
·多区间作图(MIM,multiple interval mapping) | 第9页 |
·基于混合线性模型的复合区间作图法(MCIM,mixed-model based composite intervalmapping) | 第9-10页 |
·完备复合区间作图(ICIM,Inclusive composite interval mapping) | 第10页 |
·Bayesian方法 | 第10-11页 |
4、QTL作图的常用软件 | 第11-12页 |
·QTL Cartograph | 第11页 |
·ICIMapping | 第11-12页 |
·QTLNetwork | 第12页 |
5、R | 第12-16页 |
·什么是R | 第12页 |
·R的特点与功能 | 第12-14页 |
·package(包) | 第14页 |
·R与QTL定位 | 第14-16页 |
二、材料与方法 | 第16-19页 |
三、结果与分析 | 第19-64页 |
1、表型数据分析 | 第19-20页 |
2、QTL定位分析 | 第20-64页 |
·R/qtl的结果比较 | 第20-29页 |
·R/qtlbim的结果比较 | 第29-31页 |
·MA方法结果比较 | 第31-40页 |
·IM方法结果比较 | 第40-51页 |
·CIM方法结果比较 | 第51-62页 |
·上位性QTL结果比较 | 第62-64页 |
四、小结与讨论 | 第64-68页 |
五、参考文献 | 第68-72页 |
附录1 自定义函数PEAKS | 第72-73页 |
致谢 | 第73-74页 |