| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-11页 |
| 前言 | 第11-13页 |
| 第一章 遗传连锁图谱的构建及在鱼类中的研究进展 | 第13-27页 |
| 1 遗传连锁图谱构建的理论基础 | 第13-15页 |
| ·染色体遗传理论 | 第13页 |
| ·基因连锁与交换定律 | 第13-14页 |
| ·遗传连锁图谱构建的统计学原理 | 第14-15页 |
| ·两点测验 | 第14页 |
| ·三点测验 | 第14-15页 |
| ·交换干扰与作图函数 | 第15页 |
| 2 遗传标记的分类和特点 | 第15-20页 |
| ·形态学标记 | 第16-17页 |
| ·细胞学标记 | 第17页 |
| ·生物化学标记 | 第17页 |
| ·分子标记 | 第17-20页 |
| ·RFLP | 第17-18页 |
| ·RAPD | 第18页 |
| ·AFLP | 第18页 |
| ·SSR | 第18-19页 |
| ·SNP | 第19-20页 |
| 3 开发微卫星标记的方法 | 第20-22页 |
| ·传统法 | 第20页 |
| ·富集法 | 第20-21页 |
| ·引物延伸法 | 第20-21页 |
| ·滤膜及磁珠富集法 | 第21页 |
| ·省略筛库法 | 第21-22页 |
| ·基因组文库末端测序法 | 第22页 |
| ·文献，数据库搜寻及跨种扩增法 | 第22页 |
| 4 遗传作图群体的选择 | 第22-24页 |
| ·亲本的选择 | 第22页 |
| ·分离群体类型的选择 | 第22-23页 |
| ·F1 和 F2 群体 | 第23页 |
| ·BC1 群体 | 第23页 |
| ·RIL 群体 | 第23页 |
| ·DH 群体 | 第23页 |
| ·作图群体大小的选择 | 第23-24页 |
| 5 遗传作图的软件 | 第24页 |
| 6 鱼类遗传连锁图谱研究进展 | 第24-27页 |
| ·斑马鱼 | 第24-25页 |
| ·青鳉 | 第25页 |
| ·罗非鱼 | 第25页 |
| ·虹鳟 | 第25-26页 |
| ·沟鲶 | 第26页 |
| ·鲤 | 第26-27页 |
| 第二章 物理图谱的构建及在鱼类中的研究进展 | 第27-38页 |
| 1 物理图谱构建的基本原理 | 第27页 |
| ·物理图谱本质是路标和克隆的顺序排列 | 第27页 |
| ·低分辨率物理图谱是高分辨率物理图谱的基础 | 第27页 |
| ·物理图谱的连续性 | 第27页 |
| 2 物理图谱构建的重要工具—克隆载体 | 第27-31页 |
| ·质粒克隆载体 | 第28页 |
| ·柯斯质粒克隆载体 | 第28页 |
| ·YAC 克隆载体 | 第28-29页 |
| ·BAC 克隆载体 | 第29页 |
| ·其他克隆载体 | 第29-31页 |
| ·PAC 克隆载体 | 第29-30页 |
| ·BIBAC 克隆载体 | 第30页 |
| ·PBC 克隆载体 | 第30页 |
| ·TAC 克隆载体 | 第30-31页 |
| 3 物理图谱作图技术 | 第31-36页 |
| ·传统物理作图技术[146] | 第31-32页 |
| ·玉米染色体节状物作图 | 第31页 |
| ·缺失体/非整倍体/替换系作图 | 第31页 |
| ·果蝇的多线染色体 | 第31-32页 |
| ·染色体带型分析 | 第32页 |
| ·辐射杂交作图 | 第32页 |
| ·限制性作图 | 第32-33页 |
| ·基于大片段插入克隆文库作图 | 第33-35页 |
| ·染色体步移法 | 第33页 |
| ·分子标记法 | 第33页 |
| ·克隆指纹法 | 第33-35页 |
| ·荧光原位杂交作图 | 第35页 |
| ·序列标签位点作图 | 第35-36页 |
| 4 物理图谱的组装 | 第36页 |
| 5 鱼类物理图谱研究进展 | 第36-38页 |
| ·斑马鱼 | 第36页 |
| ·青鳉 | 第36页 |
| ·罗非鱼 | 第36-37页 |
| ·虹鳟 | 第37页 |
| ·沟鲶 | 第37页 |
| ·鲤 | 第37-38页 |
| 第三章 鲤遗传连锁图谱与物理图谱的整合及鲤与斑马鱼的比较作图 | 第38-62页 |
| 第一节 鲤遗传连锁图谱与物理图谱的整合 | 第38-57页 |
| ·引言 | 第38-40页 |
| ·图谱整合的目的 | 第38-40页 |
| ·图谱整合的策略 | 第40页 |
| ·实验材料 | 第40-41页 |
| ·实验用鱼 | 第40页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第40-41页 |
| ·主要生物学软件、网站 | 第41页 |
| ·实验方法 | 第41-46页 |
| ·基因组 DNA 提取 | 第41-42页 |
| ·BAC-anchored 微卫星引物设计 | 第42-43页 |
| ·筛选多态的 BAC-anchored 微卫星引物 | 第43-44页 |
| ·BAC-anchored 微卫星分型 | 第44-45页 |
| ·其他来源的多态引物 | 第45-46页 |
| ·遗传连锁图谱的构建 | 第46页 |
| ·整合图谱的构建 | 第46页 |
| ·结果与分析 | 第46-56页 |
| ·BAC-anchored 微卫星的开发及多态结果 | 第46-47页 |
| ·微卫星分型结果 | 第47-48页 |
| ·遗传连锁图谱构建结果 | 第48页 |
| ·整合图谱的构建结果 | 第48-56页 |
| ·讨论 | 第56-57页 |
| 第二节 鲤与斑马鱼的比较作图 | 第57-62页 |
| ·引言 | 第57-58页 |
| ·分析方法 | 第58页 |
| ·结果与分析 | 第58-61页 |
| ·讨论 | 第61-62页 |
| 结论 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-75页 |
| 攻读学位期间发表的论文目录 | 第75-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 附录 | 第79-99页 |
| 附录 1 新开发的 629 对微卫星引物信息 | 第79-97页 |
| 附录 2 同一 contig 上标记间的遗传距离与物理距离的汇总 | 第97-99页 |
| 附录 3 13 个 Duplication Markers 信息 | 第99页 |
