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真菌免疫调节蛋白表达调控研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-11页
目录第11-16页
部分缩略词表第16-18页
第一章 绪论第18-30页
   ·真菌免疫调节蛋白( FIPs)结构及功能第18-19页
   ·真菌生长及蛋白表达的影响因素第19-23页
     ·碳源和氮源第19页
     ·pH第19-20页
     ·诱导剂第20-23页
       ·甲基茉莉酸第22-23页
       ·水杨酸第23页
   ·真核基因表达调控的检测方法第23-28页
     ·转录水平检测方法第24-28页
       ·RT- PCR第24-25页
       ·实时荧光定量 P CR 技术第25-26页
       ·Northernblotting第26-27页
       ·基因芯片第27-28页
     ·翻译水平检测方法第28页
       ·ELISA第28页
       ·Western blotting第28页
   ·黑灵芝及其研究现状第28-30页
第二章 真菌免疫调节蛋白基因的克隆第30-45页
   ·材料与方法第30页
     ·材料与菌株第30页
   ·试剂与培养基第30-31页
     ·试剂盒第30页
     ·相关试剂第30-31页
     ·其他试剂第31页
   ·主要仪器和设备第31-32页
   ·实验方法第32-37页
     ·真菌免疫调节蛋白基因克隆第32-34页
       ·基因组 DN A 提取第32-33页
       ·真菌免疫调节蛋白基因克隆第33-34页
     ·克隆载体构建第34-37页
       ·目的基因纯化第34-35页
       ·目的基因与克隆载体连接第35页
       ·大肠杆菌 DH5α感受态细胞的制备第35-36页
       ·转化大肠杆菌 DH5α感受态细胞第36页
       ·菌落 PC R 检测第36页
       ·测序第36页
       ·黑灵芝 FIP 基因的生物信息学分析第36-37页
   ·结果与分析第37-43页
     ·FIP-gas基因的克隆第37-39页
     ·FIP-gas和其他 FIPs 的同源性分析第39-40页
     ·FIP-gas的结构分析第40-42页
     ·分子系统进化树第42-43页
   ·讨论第43-45页
第三章 真菌免疫调节蛋白基因启动子的克隆、表达调控元件的预测和鉴定第45-67页
   ·材料与试剂第45-48页
     ·材料第45页
     ·试剂第45-47页
       ·试剂盒第45-46页
       ·试剂第46-47页
       ·培养基第47页
       ·拟南芥培养土壤基质第47页
     ·设备和仪器第47-48页
   ·实验方法第48-59页
     ·真菌免疫调节蛋白基因启动子的克隆第48-52页
       ·提取黑灵芝及赤芝基因组 DN A第48页
       ·黑芝及赤芝基因组 DN A 的酶切第48-49页
       ·黑芝及赤芝基因组 D NA 酶切产物纯化第49页
       ·黑芝及赤芝基因组 DN A 酶切产物连接至 Genome Walker 接头第49-50页
       ·PCR 扩增第50页
       ·胶回收第50-51页
       ·目的基因片段与克隆载体连接第51页
       ·大肠杆菌 DH5α感受态细胞的制备制备方法参照 2.4.2.3第51页
       ·连接产物转化大肠杆菌 DH5α感受态细胞转化方法参照 2.4.2.4第51-52页
       ·菌落 PCR 检测第52页
       ·测序第52页
       ·启动子序列順式作用元件的预测第52页
     ·植物表达载体的构建第52-56页
       ·引入酶切位点第53-54页
       ·PCR 产物纯化第54页
       ·连接目的基因与克隆载体第54页
       ·转化 DH5α感受态细胞第54页
       ·菌落 PCR 检测第54页
       ·质粒抽提第54-55页
       ·质粒双酶切第55页
       ·目的基因纯化第55页
       ·目的基因与植物表达载体连接第55-56页
     ·连接产物转入大肠杆菌 DH5α感受态细胞第56页
       ·菌落 PCR 检测第56页
     ·测序第56页
     ·质粒抽提第56页
     ·根癌农杆菌 EHA 05 感受态细胞的制备第56-57页
     ·根癌农杆菌转化子的获得第57页
     ·根癌农杆菌转化子的 PCR 检测第57-58页
     ·浸花法转化拟南芥以及阳性转化苗的筛选第58-59页
       ·浸花法转化拟南芥第58页
       ·拟南芥阳性转化苗的筛选第58-59页
   ·实验结果第59-65页
     ·黑灵芝及赤芝真菌免疫调节蛋白基因启动子的克隆第59-63页
       ·基因组 DNA 酶切第59-60页
       ·真菌免疫调节蛋白基因启动子的克隆第60-61页
       ·真菌免疫调节蛋白基因启动子序列分析第61-63页
     ·植物表达载体的构建第63-64页
     ·转基因拟南芥阳性苗的筛选第64-65页
   ·讨论第65-67页
第四章 真菌免疫调节蛋白基因的诱导表达调控第67-80页
   ·材料与试剂第67-69页
     ·材料第67页
     ·仪器第67-68页
     ·试剂第68页
     ·培养基第68-69页
   ·实验方法第69-74页
     ·菌种活化第69页
     ·灵芝预培养第69页
     ·制备生长曲线第69-70页
     ·不同诱导因子诱导培养黑灵芝和赤芝的菌丝体第70页
     ·菌丝收集第70-71页
     ·转录水平检测第71-74页
       ·提取 RNA第71-72页
       ·RNA 纯度与浓度检测第72页
       ·灵芝总 RNA 反转成 cDNA第72-73页
       ·实时荧光定量 PCR第73-74页
       ·数据处理第74页
   ·结果与分析第74-79页
     ·生长曲线第74页
     ·SA 和 MeJA 诱导后 RNA第74-75页
     ·FIP 表达分析第75-79页
       ·MeJA 处理第75-76页
       ·SA 处理第76-78页
       ·pH 处理第78-79页
   ·小结与讨论第79-80页
第五章 总结和展望第80-83页
   ·总结第80-81页
     ·黑灵芝真菌免疫调节蛋白克隆及其生物信息学分析第80页
     ·黑灵芝和赤芝 FIP 基因启动子克隆和分析第80-81页
     ·真菌免疫调节蛋白基因表达调控研究第81页
   ·创新点第81页
   ·后续工作展望第81-83页
     ·启动子活性的进一步分析第81-82页
     ·环境因子对真菌免疫调节蛋白基因的影响第82-83页
参考文献第83-93页
附录 实验涉及的试剂和培养基配方第93-94页
致谢第94-95页
攻读学位期间发表的学术论文和申请的专利第95页

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