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拮抗细菌L5的鉴定及其生防相关因子初步分析

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
文献综述第8-22页
 一、番茄灰霉病的危害与防治第8-9页
 二、植物病害生物防治研究进展第9-20页
  (一) 植物病害生防菌种类第9-11页
  (二) 生防菌的作用机理第11-20页
   1. 抗生作用第11-16页
   2. 竞争作用第16-18页
   3. 诱导抗病性第18-19页
   4. 溶菌作用第19-20页
  (三) 植物天然提取物及挥发物防治植物病害第20页
 三、研究目的和意义第20-21页
 四、研究内容第21-22页
材料与方法第22-39页
 一、供试菌株第22页
  (一) 生防细菌第22页
  (二) 植物病原真菌第22页
  (三) 大肠杆菌第22页
  (四) 供试番茄第22页
 二、培养基第22-23页
  (一) LB培养基第22页
  (二) NA培养基第22页
  (三) 胶体几丁质培养基第22-23页
  (四) 纤维素酶检测培养基第23页
  (五) 葡聚糖酶检测培养基第23页
  (六) KB培养基第23页
  (七) PDA(PSA)培养基第23页
 三、主要试剂和仪器第23-24页
  (一) 主要试剂第23页
  (二) 主要仪器第23-24页
 四、常用溶液第24-25页
  (一) 提取基因组DNA所需溶液第24-25页
  (二) 核酸电泳缓冲液第25页
  (三) 提取质粒DNA的碱裂解缓冲液第25页
  (四) 制备大肠杆菌感受态细胞溶液第25页
 五、生防细菌L5的分离及抑菌效果测定第25-27页
  (一) 拮抗细菌的分离方法第25-26页
   1. 采用稀释法分离根围土壤细菌第25-26页
  (二) 对病原真菌的拮抗作用测定方法第26页
  (三) 对番茄灰霉病菌的抑制作用第26-27页
   1. 分生孢子萌发抑制试验第26页
   2. 叶片病害防治试验第26-27页
   3. 果实病害防治试验第27页
 六、菌株L5生防相关因子的检测第27-30页
  (一) 硝吡咯菌素(PRN)保守区的PCR检测第27-28页
   1. PCR扩增引物第27-28页
   2. PCR扩增反应体系及程序第28页
   3. PCR产物检测第28页
  (二) 抗生素硝吡咯菌素的薄层层析(TLC)鉴定第28页
  (三) 氢氰酸的检测第28-29页
  (四) 嗜铁素的检测第29页
  (五) 蛋白酶的检测第29页
  (六) 几丁质酶的检测第29-30页
  (七) 纤维素酶的检测第30页
  (八) 葡聚糖酶的检测第30页
 七、菌株L5的鉴定第30-33页
  (一) 菌株L5基因组的大量提取第30-31页
  (二) 基因组DNA纯度和浓度的测定第31页
  (三) 16S rDNA和16S-23S rDNA间区的克隆及检测第31-32页
   1. PCR扩增引物第31-32页
   2. PCR扩增反应体系及程序第32页
   3. PCR产物检测第32页
  (四) 序列同源性比对第32页
  (五) 系统进化树的构建第32页
  (六) 生理生化性状分析第32-33页
 八、菌株L5中硝吡咯菌素合成基因簇(prnABCD)的克隆与分析第33-37页
  (一) 质粒的小量提取第33页
  (二) Ecoli DH5α感受态细胞的小量制备第33-34页
  (三) 质粒的热击转化第34页
  (四) L5中硝吡咯菌素合成基因簇(prnABCD)的克隆第34-37页
   1. 部分prnABCD合成基因簇的克隆第34-35页
   2. prnA基因部分片段克隆第35-37页
 九、L5中硝吡咯菌素合成基因簇(prnABCD)的生物信息学分析第37-39页
  (一) 序列相似性比对第38页
  (二) ORF查找第38页
  (三) 蛋白质结构预测第38页
  (四) 蛋白质性质与功能分析第38-39页
结果与分析第39-58页
 一、生防细菌L5的分离及抑菌效果测定第39-43页
  (一) 平板初步筛选结果第39页
  (二) 拮抗细菌L5抑菌谱测定第39-40页
  (三) 拮抗细菌L5对番茄灰霉病菌的抑制作用第40-43页
   1、孢子萌发抑制试验第40-41页
   2. 叶片接种实验第41-42页
   3. 果实接种实验第42-43页
 二、菌株L5生防相关性状的测定第43-46页
  (一) 抗生素硝吡咯菌素(PRN)保守区的PCR检测第43-44页
  (二) 抗生素硝吡咯菌素的薄层层析(TLC)鉴定第44-45页
  (三) 氢氰酸的检测第45页
  (四) 嗜铁素的检测第45-46页
  (五) 蛋白酶的检测第46页
  (六) 几丁质酶的检测第46页
  (七) 纤维素酶的检测第46页
  (八) 葡聚糖酶的检测第46页
 三、菌株L5的鉴定第46-51页
  (一) 基因组DNA纯度和浓度的测定第46-47页
  (二) 分子生物学方法鉴定第47-49页
  (三) 生理生化性状分析第49-51页
 四、菌株L5中硝吡咯菌素合成基因簇(prnABCD)的克隆与分析第51-58页
  (一) 硝吡咯菌素合成基因簇的PCR扩增结果图第51-52页
  (二) prnA基因部分片段扩增结果图第52页
  (三) 用所克隆的prnA、prnC部分序列构建的系统发育进化树第52-53页
  (四) 蛋白质一级结构预测第53-54页
  (五) 蛋白质二级结构预测第54-58页
讨论第58-61页
参考文献第61-72页
附录一第72-75页
附录二第75页
附录三第75-77页
致谢第77-78页
攻读学位期间发表的学术论文第78-79页

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