| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第13-40页 |
| ·牡丹根腐病的发生现状 | 第13页 |
| ·牡丹根腐病的病原菌—茄病镰刀菌的生物学特征 | 第13-14页 |
| ·发病原因及规律 | 第14页 |
| ·牡丹根腐病病害症状 | 第14-15页 |
| ·牡丹根腐病的防治 | 第15-27页 |
| ·农业防治 | 第15页 |
| ·化学药剂防治 | 第15-16页 |
| ·生物防治 | 第16页 |
| ·PGPR 菌株防治牡丹根腐病 | 第16-27页 |
| ·PGPR 的概念 | 第16-17页 |
| ·PGPR 的种类 | 第17-23页 |
| ·PGPR 的生防机制 | 第23-27页 |
| ·微生物多样性 | 第27-37页 |
| ·微生物多样性研究方法 | 第28-30页 |
| ·传统的微生物纯培养方法 | 第28-29页 |
| ·BIOLOG 微平板方法 | 第29页 |
| ·磷脂脂肪酸分析法 | 第29-30页 |
| ·分子生物学方法 | 第30-37页 |
| ·rDNA 克隆文库分析 | 第32-33页 |
| ·限制性片段长度多态性分析（RFLP） | 第33页 |
| ·扩增 rDNA 限制性酶切片段分析（ARDRA） | 第33-34页 |
| ·单链构象多态性分析（SSCP） | 第34页 |
| ·末端限制性片段长度多态性分析（T-RFLP） | 第34-35页 |
| ·变性梯度凝胶电泳技术（DGGE） | 第35-37页 |
| ·本研究的立项背景、研究内容与技术路线 | 第37-40页 |
| ·本研究的立题背景和研究意义 | 第37-38页 |
| ·研究内容 | 第38-39页 |
| ·技术路线 | 第39-40页 |
| 2 材料与方法 | 第40-51页 |
| ·材料 | 第40-44页 |
| ·根际土样 | 第40页 |
| ·病原菌 | 第40页 |
| ·培养基 | 第40页 |
| ·生化试剂 | 第40页 |
| ·主要溶液的配置 | 第40-42页 |
| ·DNA 提取试剂 | 第42页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳试剂 | 第42页 |
| ·菌株和载体 | 第42-43页 |
| ·引物 | 第43页 |
| ·分析软件 | 第43页 |
| ·主要仪器 | 第43-44页 |
| ·方法 | 第44-51页 |
| ·样品的采集 | 第44页 |
| ·根际土壤总 DNA 的提取 | 第44页 |
| ·根际土壤宏基因组 DNA 的检测和纯化 | 第44页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第44-45页 |
| ·用于 T-RFLP 的 PCR | 第44-45页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第45页 |
| ·PCR 产物的限制性内切酶酶切 | 第45页 |
| ·酶切产物的基因扫描 | 第45页 |
| ·牡丹根际土壤细菌的 DGGE 分析 | 第45-46页 |
| ·用于 DGGE 的 PCR 扩增 | 第45-46页 |
| ·DGGE 电泳分析 | 第46页 |
| ·DGGE 条带的切割和 DNA 回收测序 | 第46页 |
| ·PCR 产物切胶回收 | 第46页 |
| ·牡丹根际土壤真菌 DGGE 分析 | 第46页 |
| ·回收 DNA 条带连接载体测序 | 第46-47页 |
| ·连接反应 | 第46-47页 |
| ·感受态细胞 E. coli DH5α的制备 | 第47页 |
| ·转化 | 第47页 |
| ·牡丹根际细菌的分离 | 第47-48页 |
| ·样品的系列稀释 | 第47页 |
| ·平板涂布 | 第47-48页 |
| ·分离物的挑取 | 第48页 |
| ·牡丹根际根腐病拮抗菌的筛选 | 第48页 |
| ·拮抗分离物的初筛 | 第48页 |
| ·拮抗分离物的复筛 | 第48页 |
| ·菌种保藏 | 第48页 |
| ·拮抗菌的鉴定 | 第48-51页 |
| ·拮抗菌的基因组 DNA 的提取 | 第48-49页 |
| ·拮抗菌的基因组和 16S rDNA 琼脂糖凝胶电泳 | 第49页 |
| ·拮抗菌的 16S rDNA 序列 PCR 扩增 | 第49-50页 |
| ·拮抗菌的 PCR 产物纯化 | 第50页 |
| ·拮抗菌的 PCR 产物浓度的确定 | 第50页 |
| ·拮抗菌的 16S rDNA 序列测定及分析 | 第50-51页 |
| 3 结果与分析 | 第51-65页 |
| ·根际土壤细菌群落的 T-RFLP 分析 | 第51-54页 |
| ·用于 T-RFLP 的细菌 16S rDNA 扩增 | 第51页 |
| ·Hae Ⅲ酶切得到的 T-RF 图谱 | 第51-52页 |
| ·样品的 T-RFLP 图谱分析 | 第52页 |
| ·多样性指数分析 | 第52-53页 |
| ·基于 T-RFLP 的主成分分析 | 第53-54页 |
| ·根际土壤细菌群落的 DGGE 分析 | 第54-57页 |
| ·用于 DGGE 的 PCR 扩增 | 第54页 |
| ·基于 DGGE 的根际土壤中细菌 16S rDNA 多态性分析 | 第54-55页 |
| ·多样性指数分析 | 第55-56页 |
| ·基于 DGGE 的细菌种群结构相似性戴斯系数矩阵分析 | 第56页 |
| ·基于 DGGE 的细菌主成分分析 | 第56-57页 |
| ·DGGE 细菌条带测序 | 第57页 |
| ·基于 DGGE 的不同生长年限牡丹根际真菌种群结构多样性分析 | 第57-60页 |
| ·不同种植年限牡丹根际真菌 DGGE 图谱分析 | 第57-58页 |
| ·多样性指数分析 | 第58-59页 |
| ·基于 DGGE 的真菌种群结构戴斯系数矩阵分析 | 第59页 |
| ·基于 DGGE 的真菌主成分分析 | 第59-60页 |
| ·牡丹根际拮抗菌的筛选 | 第60页 |
| ·拮抗菌的鉴定 | 第60-65页 |
| ·放线菌 MD64 的形态学以及生理生化特征 | 第60页 |
| ·拮抗细菌的形态学及生理生化特征 | 第60-62页 |
| ·拮抗菌的 16S rDNA 序列分析 | 第62-65页 |
| 4 讨论 | 第65-68页 |
| ·不同种植年限牡丹根际土壤微生物种群结构的分析 | 第65-66页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第65页 |
| ·DGGE 分析 | 第65-66页 |
| ·牡丹根腐病根际拮抗菌的筛选与鉴定 | 第66-68页 |
| 5 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第81页 |
