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龙眼体胚发生过程中激素代谢和信号转导相关基因的克隆与表达

缩写词第1-15页
摘要第15-19页
Abstract第19-24页
第一章 引言第24-53页
 1 植物体胚发生的特点和意义第24页
 2 植物激素对体胚发生的诱导和调节研究进展第24-30页
   ·生长素对植物体胚的调节作用第25-26页
   ·细胞分裂素对植物体胚的调节作用第26页
   ·生长素与细胞分裂素对植物体胚的调节作用第26页
   ·脱落酸对植物体胚的调节作用第26-27页
   ·乙烯对植物体胚的调节作用第27-28页
   ·植物体胚发生过程中内源激素的变化第28-29页
   ·植物激素对体胚调控的机理第29-30页
 3 植物激素的代谢与信号转导研究进展第30-45页
   ·生长素的代谢与信号转导第30-33页
     ·生长素的合成第30-31页
     ·生长素的分解第31页
     ·生长素信号传导机制第31-33页
   ·细胞分裂素的代谢与信号转导第33-34页
     ·细胞分裂素的代谢第33-34页
     ·细胞分裂素的信号转导第34页
   ·赤霉素的代谢与信号转导第34-37页
     ·赤霉素的代谢第34-36页
     ·赤霉素的信号转导第36-37页
   ·脱落酸的代谢与信号转导第37-39页
     ·脱落酸的代谢第37-38页
     ·脱落酸的信号转导第38-39页
   ·乙烯的代谢与信号转导第39-41页
     ·乙烯的代谢第39-40页
     ·乙烯的信号转导第40-41页
   ·不同植物激素信号途径中的共性第41-42页
   ·五大类激素代谢和信号转导的相互联系第42-45页
 4 激素代谢与信号转导相关基因的研究进展第45-49页
   ·生长素受体TIR1/AFBs第45页
   ·生长素结合蛋白ABP1第45-46页
   ·生长素应答因子ARF第46页
   ·乙烯前体ACC合成酶第46-47页
   ·乙烯前体ACC氧化酶第47页
   ·乙烯受体ETR1和ERS1第47-49页
 5 生物信息学在基因克隆中的应用第49页
 6 实时荧光定量PCR在体胚上的应用第49-50页
 7 龙眼体胚发生研究进展第50-51页
 8 本研究的意义和主要内容第51-53页
第二章 龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因的克隆第53-88页
 第一节 龙眼胚性愈伤组织生长素受体基因(TIR1)的克隆第54-60页
  1 材料与方法第54-56页
   ·材料第54页
   ·方法第54-56页
     ·总RNA的提取及检测第54页
     ·cDNA第一链的合成第54页
     ·基因的保守区扩增第54页
     ·基因的3’RACE第54-55页
     ·基因的5’RACE第55页
     ·基因的开放阅读框(ORF)的扩增第55页
     ·目的片段PCR扩增的体系和程序第55-56页
     ·目的片段的回收、克隆和测序第56页
  2 结果与分析第56-59页
   ·龙眼胚性愈伤组织总RNA的质量第56页
   ·龙眼胚性愈伤组织TIR1的cDNA全长序列的获得第56-58页
   ·龙眼胚性愈伤组织TIR1的cDNA全长序列和推测的氨基酸序列第58-59页
  3 讨论第59-60页
   ·龙眼胚性愈伤组织TIR1进行5’RACE时产物的长度在400-800 bp范围内最佳第59页
   ·龙眼体胚是否存在除TIR1之外的TIR1/AFBs受体家族成员第59-60页
   ·在龙眼胚性愈伤组织TIR1的cDNA全长序列基础上值得进一步开展研究的方面第60页
 第二节 龙眼胚性愈伤组织生长素结合蛋白基因(ABP1)的克隆第60-64页
  1 材料与方法第60-62页
   ·材料第60页
   ·方法第60-62页
  2 结果与分析第62-64页
   ·龙眼胚性愈伤组织ABP1的cDNA全长序列的获得第62-63页
   ·龙眼胚性愈伤组织ABP1的cDNA全长序列和推测的氨基酸序列第63-64页
  3 讨论第64页
   ·选择在特征区内设计引物是龙眼胚性愈伤组织生长素结合蛋白基因ABP1同源克隆成功的关键点第64页
   ·生长素受体DL-TIR1与生长素结合蛋白DL-ABP1的相互联系第64页
 第三节 龙眼胚性愈伤组织生长素反应因子基因(ARF)的克隆第64-69页
  1 材料与方法第64-66页
   ·材料第65页
   ·方法第65-66页
  2 结果与分析第66-68页
   ·龙眼胚性愈伤组织ARF的cDNA全长序列的获得第66-67页
   ·龙眼胚性愈伤组织ARF的cDNA全长序列和推测的氨基酸序列第67-68页
  3 讨论第68-69页
   ·多次比对、多次引物设计以确保准确获得龙眼胚性愈伤组织生长素反应因子ARF的cDNA序列全长第69页
   ·今后开展ARF这类转录因子的若干研究方向第69页
 第四节 龙眼胚性愈伤组织ACC合成酶基因(ACS)的克隆第69-74页
  1 材料与方法第70-71页
   ·材料第70页
   ·方法第70-71页
  2 结果与分析第71-73页
   ·龙眼胚性愈伤组织ACS的cDNA全长序列的获得第71-72页
   ·龙眼胚性愈伤组织ACS的cDNA全长序列和推测的氨基酸序列第72-73页
  3 讨论第73-74页
   ·不同植物的ACS序列同源性低增加了DL-ACS基因cDNA全长序列获得难度第73-74页
   ·今后龙眼ACS基因的若干研究方向第74页
 第五节 龙眼胚性愈伤组织ACC氧化酶基因(ACO)的克隆第74-80页
  1 材料与方法第74-76页
   ·材料第74-75页
   ·方法第75-76页
  2 结果与分析第76-78页
   ·龙眼胚性愈伤组织ACO基因的cDNA和DNA全长序列的获得第76-77页
   ·龙眼胚性愈伤组织ACO基因的序列分析第77-78页
  3 讨论第78-80页
   ·ACO基因的克隆是较适合采用同源克隆的方法第79页
   ·ACO基因反馈调节研究中值得关注的方面第79页
   ·ACO基因在龙眼分子生物学研究上的价值第79-80页
 第六节 龙眼胚性愈伤组织两个乙烯受体基因的克隆第80-88页
  1 材料与方法第80-82页
   ·材料第80页
   ·方法第80-82页
     ·龙眼胚性愈伤组织DNA和RNA的提取以及cDNA第一链的合成第80页
     ·引物的设计合成第80-81页
     ·基因的5’端编码区序列的扩增第81页
     ·龙眼愈伤组织ERS1基因DNA序列的克隆第81页
     ·目的片段PCR扩增的体系和程序第81-82页
  2 结果与分析第82-87页
   ·龙眼胚性愈伤组织ETR1和ERS1基因cDNA全长序列、ERS1基因DNA序列的获得第82-84页
   ·龙眼胚性愈伤组织ETR1的cDNA全长序列及推测的氨基酸序列第84-85页
   ·龙眼胚性愈伤组织ERS1基因的序列分析第85-87页
  3 讨论第87-88页
   ·多次比对进行特异性引物设计确保DL-ETR1和DL-ERS1 cDNA序列的准确性第87页
   ·开展不同类型龙眼体胚乙烯受体研究的若干方面第87-88页
第三章 龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因的生物信息学分析第88-181页
 第一节 龙眼胚性愈伤组织生长素受体基因(TIR1)的生物信息学分析第88-102页
  1 材料与方法第88-90页
   ·材料第88页
   ·方法第88-90页
     ·蛋白质基本理化性质预测与分析第88页
     ·亲疏水特性预测与分析第88-89页
     ·氨基酸序列的分子系统进化分析第89页
     ·蛋白质二级结构预测第89页
     ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第89页
     ·三维结构的预测和分析第89页
     ·亚细胞定位预测与分析第89页
     ·信号肽的预测和分析第89-90页
     ·跨膜结构预测与分析第90页
     ·蛋白质家族及保守结构域的预测和分析第90页
     ·磷酸化位点预测与分析第90页
     ·功能位点预测和分析第90页
     ·基因功能的预测与分析第90页
  2 结果与分析第90-100页
   ·蛋白质基本理化性质第91-92页
   ·亲疏水特性预测与分析第92页
   ·氨基酸序列的分子系统进化分析第92-94页
   ·蛋白质二级结构预测第94页
   ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第94-95页
   ·三维结构的预测和分析第95页
   ·亚细胞定位预测与分析第95-96页
   ·信号肽的预测和分析第96-97页
   ·跨膜结构预测与分析第97-98页
   ·蛋白质家族及保守结构域的预测分析第98页
   ·磷酸化位点预测与分析第98-99页
   ·功能点预测和分析第99-100页
   ·基因功能的预测与分析第100页
  3 讨论第100-102页
   ·F-box结构域对生长素介导的SCF~(DL-TIR1)-ux/IAA结合Aux/IAA蛋白降解是至关重要的第100-101页
   ·DL-TIR1蛋白与拟南芥中TIR1/AFBs生长素受体成员的相互关系第101页
   ·预测DL-TIR1在龙眼体胚中的作用第101-102页
 第二节 龙眼胚性愈伤组织生长素结合蛋白基因(ABP1)的生物信息学分析第102-115页
  1 材料与方法第102页
  2 结果与分析第102-113页
   ·蛋白质基本理化性质第102-104页
   ·亲疏水特性预测与分析第104页
   ·氨基酸序列的分子系统进化分析第104-106页
   ·蛋白质二级结构预测第106-107页
   ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第107页
   ·三维结构的预测和分析第107-108页
   ·亚细胞定位预测与分析第108页
   ·信号肽的预测和分析第108-110页
   ·跨膜结构预测与分析第110页
   ·蛋白质家族及保守结构域的预测分析第110-111页
   ·磷酸化位点预测与分析第111-112页
   ·功能点预测和分析第112页
   ·基因功能的预测与分析第112-113页
  3 讨论第113-115页
   ·DL-ABP1很有可能是属内质网型生长素结合蛋白第113-114页
   ·DL-ABP1包含典型的ABP1结构和功能位点第114页
   ·预测DL-ABP1在龙眼体胚中的作用第114-115页
 第三节 龙眼胚性愈伤组织生长素应答因子基因(ARF)的生物信息学分析第115-129页
  1 材料与方法第115页
  2 结果与分析第115-127页
   ·蛋白质基本理化性质第115-117页
   ·亲疏水特性预测与分析第117页
   ·氨基酸序列的分子系统进化分析第117-119页
   ·蛋白质二级结构预测第119-120页
   ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第120-121页
   ·三维结构的预测和分析第121-122页
   ·亚细胞定位预测与分析第122页
   ·信号肽的预测和分析第122-123页
   ·跨膜结构预测与分析第123-124页
   ·蛋白质家族及保守结构域的预测分析第124-125页
   ·磷酸化位点预测与分析第125-126页
   ·功能点预测和分析第126-127页
   ·基因功能的预测与分析第127页
  3 讨论第127-129页
   ·DL-ARF可能属于转录抑制因子第127-128页
   ·DL-ARF生物信息学预测结果包含有典型ARF的结构特点及功能第128页
   ·预测DL-ARF在龙眼体胚中的作用第128-129页
 第四节 龙眼胚性愈伤组织ACC合酶基因(ACS)的生物信息学分析第129-141页
  1 材料与方法第129页
  2 结果与分析第129-140页
   ·蛋白质基本理化性质第129-131页
   ·亲疏水特性预测与分析第131页
   ·氨基酸序列的分子系统进化分析第131-133页
   ·蛋白质二级结构预测第133-134页
   ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第134-135页
   ·三维结构的预测和分析第135-136页
   ·亚细胞定位预测与分析第136页
   ·信号肽的预测和分析第136-137页
   ·跨膜结构预测与分析第137-138页
   ·蛋白质家族及保守结构域的预测分析第138-139页
   ·磷酸化位点预测与分析第139页
   ·功能点预测和分析第139-140页
   ·基因功能的预测与分析第140页
  3 讨论第140-141页
   ·DL-ACS可能响应龙眼体胚基础乙烯的合成第141页
   ·DL-ACS符合ACS的结构和功能第141页
 第五节 龙眼胚性愈伤组织ACC氧化酶基因(ACO)的生物信息学分析第141-153页
  1 材料与方法第142页
  2 结果与分析第142-151页
   ·蛋白质基本理化性质第142-143页
   ·亲疏水特性预测与分析第143-144页
   ·氨基酸序列的分子系统进化分析第144-146页
   ·蛋白质二级结构预测第146-147页
   ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第147页
   ·三维结构的预测和分析第147页
   ·亚细胞定位预测与分析第147-148页
   ·信号肽的预测和分析第148-149页
   ·跨膜结构预测与分析第149页
   ·蛋白质家族及保守结构域的预测分析第149-150页
   ·磷酸化位点预测与分析第150页
   ·功能点预测和分析第150-151页
   ·基因功能的预测与分析第151页
  3 讨论第151-153页
   ·DL-ACO可能响应龙眼体胚基础乙烯的生成第151-152页
   ·DL-ACO预测结果符合已报道ACO的结构和功能第152-153页
 第六节 龙眼胚性愈伤组织乙烯受体基因(ETR1)的生物信息学分析第153-167页
  1 材料与方法第153页
  2 结果与分析第153-166页
   ·蛋白质基本理化性质第153-155页
   ·亲疏水特性预测与分析第155页
   ·氨基酸序列的分子系统进化分析第155-157页
   ·蛋白质二级结构预测第157-158页
   ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第158-159页
   ·三维结构的预测和分析第159页
   ·亚细胞定位预测与分析第159-160页
   ·信号肽的预测和分析第160-161页
   ·跨膜结构预测与分析第161-162页
   ·蛋白质家族及保守结构域的预测分析第162-163页
   ·磷酸化位点预测与分析第163-164页
   ·功能点预测和分析第164-165页
   ·基因功能的预测与分析第165-166页
  3 讨论第166-167页
   ·DL-ETR1可能在龙眼乙烯受体家族中占有突出的功能地位第166-167页
   ·DL-ETR1中的Cys65可能与乙烯敏感性有关第167页
 第七节 龙眼胚性愈伤组织乙烯受体基因(ERS1)的生物信息学分析第167-181页
  1 材料与方法第167-168页
  2 结果与分析第168-179页
   ·蛋白质基本理化性质第168-169页
   ·亲疏水特性预测与分析第169页
   ·氨基酸序列的分子系统进化分析第169-172页
   ·蛋白质二级结构预测第172页
   ·蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第172-173页
   ·三维结构的预测和分析第173页
   ·亚细胞定位预测与分析第173-174页
   ·信号肽的预测和分析第174-175页
   ·跨膜结构预测与分析第175-176页
   ·蛋白质家族及保守结构域的预测分析第176-177页
   ·磷酸化位点预测与分析第177页
   ·功能点预测和分析第177-178页
   ·基因功能的预测与分析第178-179页
  3 讨论第179-181页
   ·DL-ERS1预测结果符合已报道典型ERS1结构和功能第179页
   ·DL-ERS1与同源物DL-ETR1在结构功能上的异同点第179-181页
第四章 龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因的定量表达分析第181-198页
 1 材料与方法第181-183页
   ·材料第181-182页
   ·方法第182-183页
     ·总RNA的提取及质量检测第182页
     ·两步法qRT-PCR第182-183页
 2 结果与分析第183-189页
   ·目的基因荧光定量PCR引物的特异性和扩增效率分析第183-184页
   ·龙眼体胚发生过程的8个不同阶段目的基因的差异表达分析第184-189页
     ·龙眼体胚发生过程生长素相关基因的表达分析第184-186页
     ·龙眼体胚发生过程乙烯相关基因的表达分析第186-189页
 3 讨论第189-198页
   ·龙眼体胚发生过程中生长素相关基因的差异表达第189-192页
     ·龙眼体胚发生过程中生长素相关基因表达量动态变化的相互联系第189-190页
     ·DL-TIR1表达的时空差异性与龙眼体胚外源2,4-D以及内源IAA的联系第190-191页
     ·龙眼体胚除TIR1外可能还有其它生长素受体成员吗第191-192页
   ·龙眼体胚发生过程中乙烯相关基因的差异表达第192-196页
     ·龙眼体胚发生过程中乙烯合成相关基因表达量动态变化的相互联系第192-193页
     ·DL-ACS,DL-ACO,乙烯受体基因的转录水平是否能够反应乙烯生成量的分析第193页
     ·ACO在龙眼体胚发生过程乙烯代谢中的作用第193-194页
     ·龙眼体胚发生发育过程中DL-ERS1和DL-ETRl不同的表达模式第194-196页
   ·龙眼体胚发生过程中生长素相关基因、乙烯相关基因、龙眼体胚内源IAA的相互联系第196-198页
     ·DL-TIR1与DL-ACS表达量的相互关系第196-197页
     ·DL-ACO表达的时空差异性与龙眼体胚内源IAA的联系第197页
     ·DL-ARF与DL-ACO表达量的相互关系第197-198页
第五章 小结第198-203页
 1 龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因的克隆第198-199页
 2 龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因的生物信息学分析第199-201页
 3 龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因的定量表达分析第201-203页
   ·龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因的表达情况第201页
   ·龙眼体胚发生过程中激素代谢与信号转导相关基因表达量相互之间的联系第201-202页
   ·龙眼体胚中可能存在生长素和乙烯的整合介导了体胚的生长和发育第202-203页
参考文献第203-214页
附录1第214-218页
附录2第218-221页
附录3第221-223页
附录4第223-226页
附录5第226-229页
附录6第229-231页
附录7第231-233页
附录8第233-236页
附录9第236-239页
附录10第239-242页
附录11第242-246页
致谢第246页

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