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盾壳霉T-DNA插入体库的构建及两个分生孢子形成相关基因的克隆

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-18页
第一章 文献综述第18-44页
 1.核盘菌重寄生真菌盾壳霉的研究进展第18-27页
   ·核盘菌及作物菌核病第18-20页
   ·盾壳霉的分类及分布和多样性第20-21页
   ·盾壳霉的生物学特性第21页
   ·盾壳霉与寄主的互作第21-22页
   ·盾壳霉的寄生生态学特性第22-23页
   ·盾壳霉控制作物菌核病应用及规模化生产第23-26页
     ·盾壳霉在作物菌核病防治中的应用第23-25页
     ·盾壳霉的规模化生产第25-26页
   ·盾壳霉的分子生物学研究第26-27页
 2 真菌孢子形成机理的研究第27-31页
   ·孢子形成与作物真菌病害第27页
   ·孢子形成与生防真菌的应用第27-28页
   ·环境对真菌孢子形成的影响第28-29页
   ·孢子形成的分子机理第29-31页
 3.真菌遗传转化研究进展第31-37页
   ·真菌遗传转化研究手段及特点第31-33页
     ·PEG介导的遗传转化第31-32页
     ·限制性内切酶介导的遗传转化第32页
       ·农杆菌介导的遗传转化第32-33页
   ·农杆菌介导转化的基本原理及其应用第33-37页
     ·农杆菌转化系统的发展第33-34页
     ·农杆菌介导转化的基本原理第34-35页
     ·农杆菌介导转化法(ATMT)在真菌转化中的应用第35-37页
 4 基因功能分析的策略第37-40页
   ·基因敲除策略在基因功能研究中的应用第38页
   ·RNAi技术在基因功能研究中的应用第38-40页
 5 本研究的立题依据和目的与意义第40-44页
第二章 农杆菌介导高效转化盾壳霉及克隆相关基因技术平台的建立第44-66页
 1 材料第45-46页
   ·菌株及载体第45-46页
   ·抗生素第46页
   ·酶、试剂盒及其它试剂第46页
   ·其它试剂和培养基配制见附录1第46页
   ·DNA分子量标记第46页
 2 方法第46-56页
   ·农杆菌介导转化体系的优化第46-47页
     ·农杆菌介导的转化第46-47页
     ·用于转化的盾壳霉孢子最佳成熟度的筛选第47页
     ·用于转化的盾壳霉最佳孢子浓度的筛选第47页
     ·农杆菌菌液与盾壳霉孢子共培养时间对转化效率的影响第47页
   ·TAIL-PCR技术与相关基因的克隆第47-49页
   ·结合Southern杂交技术克隆相关基因第49-52页
     ·Southern杂交分析第49-51页
     ·反向PCR(Inverse-PCR)技术的应用第51-52页
   ·cDNA文库的建立与相关基因的克隆第52-56页
     ·盾壳霉ZS-1的培养第52页
     ·RNA的提取和纯化第52页
     ·cDNA文库的构建及文库质量的检测第52页
     ·文库cDNA第一链合成第52页
     ·文库cDNA第二链的合成及电泳检测第52页
     ·蛋白酶K的降解第52-53页
     ·Sfil酶的消化第53页
     ·合适cDNA片段的收集和电泳检测第53页
     ·cDNA的连接和噬菌体蛋白包装第53-54页
     ·滴度未扩增文库第54页
       ·大肠杆菌XL1-Blue株系的活化第54页
       ·未扩增文库的滴度检测第54页
     ·文库扩增第54-55页
     ·文库质量的检测第55-56页
       ·文库重组克隆百分比第55页
       ·扩增文库滴度检测第55-56页
     ·cDNA文库的应用第56页
 3 结果与分析第56-64页
   ·农杆菌介导转化体系的优化第56-59页
     ·用于转化的盾壳霉孢子最佳成熟度的筛选第56-57页
     ·用于转化的盾壳霉最佳孢子浓度的筛选第57-58页
     ·农杆菌菌液与盾壳霉孢子共培养时间对转化效率的影响第58-59页
   ·TAIL—PCR技术与相关基因的克隆第59-60页
   ·结合Southern杂交技术克隆相关基因第60-62页
   ·cDNA文库的建立与相关基因的克隆第62-64页
     ·盾壳霉ZS-1菌株总RNA的提取第62-63页
     ·文库质量的检测第63页
     ·cDNA文库的应用第63-64页
 4.结论与讨论第64-66页
第三章 盾壳霉T-DNA插入体库的建立及部分产孢相关突变体的筛选及初步研究第66-80页
 1 材料与方法第67-70页
   ·材料第67-68页
     ·菌株第67页
     ·培养基的配置第67-68页
     ·酶、载体、试剂盒及其它试剂第68页
   ·方法第68-70页
     ·T-DNA标记插入体库的构建第68页
     ·产孢缺陷型突变体的筛选第68页
     ·产孢缺陷型突变体生长速度测定第68页
     ·产孢缺陷型突变体寄生菌核致腐能力的比较第68-69页
     ·产孢缺陷型突变体产抗生物质(抗真菌物质和抗细菌物质)的测定第69页
     ·产孢缺陷型突变体T-DNA的插入拷贝数的分析第69页
     ·TAIL-PCR扩增产孢缺陷型突变体代表性菌株T-DNA侧端基因组DNA第69-70页
 2.结果与分析第70-78页
   ·产孢缺陷型突变体的筛选及分类第70-73页
   ·部分产孢缺陷型突变体的生长速度的测定结果第73页
   ·产孢缺陷型突变体寄生致腐菌核能力的比较第73-74页
   ·产孢缺陷型突变体产生抗生素的测定结果第74-76页
   ·部分产孢缺陷型突变体T-DNA的插入拷贝数的分析第76-77页
   ·部分产孢缺陷型突变体的TAIL—PCR扩增T-DNA标记两端基因组DNA序列及分析结果第77-78页
 3.结论与讨论第78-80页
第四章:精氨酸通过一氧化氮调控盾壳霉分生孢子形成途径研究第80-116页
 1 材料与方法第81-89页
   ·材料第81-83页
     ·菌株及培养基第81-82页
     ·酶、试剂盒及其它试剂第82页
     ·引物第82-83页
   ·方法第83-89页
     ·ZS-1T2029的基本生物学特性研究第83页
     ·突变体ZS-1T2029及其ZS-1菌株菌落形成过程的观察第83页
     ·ZS-1T2029 T-DNA插入位点数分析第83页
     ·T-DNA侧端DNA序列的获得和序列分析第83-84页
       ·TAIL-PCR获得T-DNA侧端DNA序列第84页
       ·目的片段的回收及纯化第84页
       ·回收片段的连接与转化第84页
       ·重组质粒的鉴定和序列分析第84页
     ·CMCPS1全长cDNA的克隆第84-86页
       ·5'端序列的获得第85页
       ·3'端序列的获得第85页
       ·全长cDNA序列的拼接第85-86页
     ·CMCPS1基因拷贝数的验证第86页
     ·CMCPS1基因在出发菌株ZS-1中表达情况分析第86页
     ·精氨酸、瓜氨酸对突变体ZS-1T2029孢子形成的互补作用第86-87页
     ·CMCPS1基因功能的验证第87-88页
       ·RNAi特异性沉默CMCPS1载体的构建及转化第87-88页
       ·RNAi特异沉默CMCPS1转化子分析第88页
     ·多胺对突变体ZS-1T2029产孢的影响第88页
     ·一氧化氮供体硝普钠对突变体ZS-1T2029产孢的影响第88-89页
     ·一氧化氮合成酶抑制剂L-NAME对ZS-1菌株产孢的影响第89页
     ·ZS-1菌株和突变体ZS-1T2029中一氯化氮产量的检测第89页
 2.结果与分析第89-113页
   ·ZS-1T2029菌株的生物学特性第89-92页
   ·产孢缺陷型突变体ZS-1T2029及其ZS-1菌株孢子形成过程的比较第92-95页
   ·突变体ZS-1T2029中T-DNA为单位点插入第95页
   ·氨甲酰磷酸合成酶基因的获得和序列分析第95-96页
   ·TAIL-PCR扩增DNA的序列分析及T-DNA标记插入破坏CMCPS1基因位点预测第96-98页
   ·CMCPS1全长cDNA的获得第98-104页
   ·CMCPS1基因在盾壳霉ZS-1菌株中拷贝数及表达分析第104-105页
   ·精氨酸、瓜氨酸恢复产孢缺陷型突变体ZS-1T2029产孢第105-107页
   ·CMCPS1基因功能的验证第107-109页
   ·一氧化氮供体硝普钠对突变体ZS-1T2029产孢的影响第109页
   ·一氧化氮合成酶抑制剂L-NAME对ZS-1菌株产孢的影响第109-110页
   ·盾壳霉产生一氧化氮的检测第110-113页
 3 结论和讨论第113-116页
   ·结论第113页
   ·讨论第113-116页
第五章:盾壳霉产孢相关基因磷酸核糖酰胺转移酶CMAMPRS1基因的克隆第116-135页
 1 材料与方法第117-120页
   ·材料第117-118页
     ·菌株及培养基第117页
     ·试剂、药品第117页
     ·引物第117-118页
   ·方法第118-120页
     ·ZS-1T21882的基本生物学特性研究第118页
     ·突变体ZS-1T21882及其ZS-1菌株孢子形成过程的观察第118页
     ·ZS-1T21882 T-DNA插入位点数分析第118页
     ·T-DNA侧端DNA序列的获得和序列分析第118页
     ·磷酸核糖酰胺转移酶(CMAMPRS1)基因全长cDNA的克隆第118-119页
       ·5'端序列的获得第119页
       ·3'端序列的获得第119页
       ·全长cDNA序列的拼接第119页
     ·CMAMPRS1基因拷贝数的验证第119-120页
     ·CMAMPRS1基因在出发菌株ZS-1中表达情况分析第120页
     ·次黄嘌呤(hypoxanthine,IMP),AMP、GMP、cAMP对突变体ZS-1T21882孢子形成的互补作用第120页
 2.结果与分析第120-133页
   ·ZS-1T21882菌株的生物学特性第120-122页
   ·突变体ZS-1T21882及其ZS-1菌株孢子形成过程的观察第122-124页
   ·突变体ZS-1T21882中T-DNA为单位点插入第124-125页
   ·谷氨酰胺磷酸核糖焦磷酸转酰胺酶基因的获得和序列分析第125页
   ·TAIL-PCR扩增DNA的序列分析及T-DNA标记插入破坏CMAMPRS1基因第125-129页
   ·CMAMPRS1基因在盾壳霉ZS-1菌株中拷贝数的分析第129-130页
   ·CMAMPRS1基因在盾壳霉ZS-1菌株的表达分析第130-131页
   ·次黄嘌呤(hyphxanthine,IMP),AMP、GMP、cAMP对产孢缺陷型突变体ZS-1T21882孢子的恢复第131-133页
 3 结论和讨论第133-135页
   ·结论第133-134页
   ·讨论第134-135页
第六章 其它几大类突变体的筛选及研究第135-144页
 1 材料与方法第136-137页
   ·材料第136页
     ·菌株第136页
     ·培养基的配置第136页
     ·酶、载体、试剂盒及其它试剂第136页
   ·方法第136-137页
     ·产生抗真菌物质能力加强突变体的筛选第136页
     ·产生抗细菌物质能力丧失突变体的筛选第136-137页
     ·不寄生菌核的突变体第137页
     ·产色素变化突变体的筛选第137页
     ·高pH值敏感的突变体筛选第137页
 2.结果与分析第137-142页
   ·产生抗真菌物质能力加强突变体的筛选第137-138页
   ·产生抗细菌物质能力丧失突变体的筛选第138-139页
   ·不寄生菌核的突变体的筛选第139-140页
   ·产色素变化突变体的筛选第140-141页
   ·高pH值敏感的突变体筛选第141-142页
 3.结论与讨论第142-144页
   ·结论第142页
   ·讨论第142-144页
结论与展望第144-147页
参考文献第147-170页
致谢第170-171页
附录1 各种溶液、培养基、试剂及所用药品的配方第171-176页
附录2 产孢缺陷型突变体的筛选结果及分类第176-180页
附录3 已发表的相关文章第180-181页

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