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桃潜隐花叶类病毒分子变异的研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略词表第13-15页
第一章 文献综述第15-27页
 1 植物病原类病毒研究进展第15-20页
   ·类病毒的发现及其结构特征第15-16页
   ·类病毒的分类第16-18页
   ·类病毒的复制第18页
   ·类病毒致病机制研究第18-20页
 2 PLMVd的研究进展第20-26页
   ·PLMVd的生物学特性第20-21页
   ·PLMVd的分类地位和二级结构特性第21-22页
   ·PLMVd的复制第22-23页
   ·PLMVd的遗传变异第23-24页
   ·PLMVd致病机制的探索第24-25页
   ·PLMVd的检测和防治第25-26页
 3 研究的目的和意义第26-27页
第二章 桃潜隐花叶类病毒检测技术的建立第27-41页
 1 材料和方法第28-35页
   ·试验材料第28-30页
     ·样品的采集第28页
     ·引物设计与合成第28页
     ·相关试剂第28-30页
   ·类病毒环状RNA提取第30-31页
     ·类病毒环状RNA提取的基本方法第30页
     ·提取的类病毒环状RNA的纯化第30-31页
   ·RT-PCR扩增第31-32页
     ·RT反应合成cDNA第一链第31页
     ·PCR反应第31页
     ·PCR产物的电泳检测第31-32页
   ·核酸探针标记第32-33页
     ·模板cDNA扩增第32页
     ·目标cDNA的纯化第32页
     ·探针标记第32-33页
   ·分子杂交第33-34页
     ·RNA斑点印迹杂交第33页
     ·DNA斑点印迹杂交第33页
     ·组织印迹杂交第33-34页
     ·杂交结果的检测第34页
   ·聚丙烯酰胺凝胶双向电泳第34-35页
 2 结果与分析第35-39页
   ·PLMVd RT-PCR检测结果第35-37页
   ·PLMVd核酸杂交方法检测结果第37-38页
     ·三种不同的核酸杂交方法检测PLMVd的结果第37-38页
     ·组织印迹杂交检测PLMVd在桃树不同部位的分布结果第38页
   ·PLMVd聚丙烯酰胺凝胶双向电泳检测结果第38-39页
 3 讨论第39-41页
第三章 桃潜隐花叶类病毒中国分离物的克隆与序列分析第41-53页
 1 材料与方法第41-45页
   ·材料第41-43页
     ·样品的采集第41页
     ·引物设计与合成第41页
     ·相关试剂第41-43页
   ·核酸提取第43页
   ·RT-PCR扩增第43页
   ·PCR产物回收第43页
   ·cDNA的克隆第43-45页
     ·克隆载体的构建第43页
     ·转化用大肠杆菌感受态的制备第43-44页
     ·连接产物转化第44页
     ·质粒的提取第44-45页
     ·质粒的酶切鉴定第45页
   ·序列测定第45页
   ·序列比较分析和二级结构分析第45页
 2 结果分析第45-52页
   ·PLMVd的RT-PCR结果分析第45-46页
   ·PLMVd RT-PCR产物的克隆酶切鉴定结果第46-47页
   ·PLMVd的序列测定第47-52页
     ·PLMVd-P3序列测定及与已报到序列相似性分析第47页
     ·中国分离物不同分子变种序列测定及分子特性分析第47-52页
 3 讨论第52-53页
第四章 单链构象多态性分析技术改进第53-65页
 1 材料第54-56页
   ·供试分子第54页
   ·PCR引物第54页
   ·凝胶电泳相关试剂第54-56页
 2 方法第56-58页
   ·PCR扩增第56-57页
   ·非变性聚丙烯凝胶配置第57页
   ·SSCP分析第57-58页
 3 结果与分析第58-63页
   ·不同条件下的SSCP分析结果比较第58-60页
   ·不同条件下的SSCP分析灵敏性比较第60-63页
 4 讨论第63-65页
第五章 桃潜隐花叶类病毒的分子变异分析第65-83页
 1 材料与方法第66-68页
   ·毒源材料第66-67页
   ·核酸提取第67页
   ·RT-PCR扩增和PCR产物回收第67页
   ·cDNA的克隆第67页
   ·cDNA克隆的PCR鉴定及目标DNA的扩增第67页
   ·SSCP分析第67-68页
   ·序列测定、对比分析和二级结构预测第68页
 2 结果与分析第68-81页
   ·各分离物RT-PCR结果第68-69页
   ·各分离物RT-PCR产物的SSCP分析结果第69页
   ·不同克隆PCR分析结果第69-70页
   ·各分离物的群体结构分析第70-73页
   ·分离物内部的遗传变异分析第73-77页
   ·分离物间的遗传变异分析第77-79页
   ·与生物学相关的遗传变异特点分析第79页
   ·二级结构分析第79-81页
 3 讨论第81-83页
第六章 桃潜隐花叶类病毒的单链正负极性鉴定第83-87页
 1 材料第83-84页
   ·供试材料第83页
   ·PCR引物第83-84页
 2 方法第84-85页
   ·PCR扩增第84-85页
   ·SSCP分析第85页
 3 结果与分析第85-86页
 4 讨论第86-87页
参考文献第87-102页
附录第102-103页
致谢第103页

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