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几种赤潮微藻的形态和系统进化分析及荧光原位杂交检测

摘要第1-11页
Abstract第11-14页
第一章 文献综述第14-48页
 第1 节赤潮概述第14-21页
     ·赤潮的定义第14页
     ·赤潮生物种类第14-15页
     ·赤潮藻的分型第15-16页
     ·赤潮的危害第16-17页
     ·中国赤潮发生的概况第17-18页
     ·中国赤潮发生的特点第18-20页
     ·中国赤潮研究的概况第20-21页
 第2节 赤潮藻的分子系统学研究及分子标记技术第21-34页
     ·核糖体rRNA 基因和转录间隔区第21-27页
     ·其它基因作为系统进化分析的分子标记第27-29页
     ·多个基因区作为分子标识作系统进化分析第29-30页
     ·分子标记(molecular markers)第30-34页
 第3节 赤潮藻的分子生物学检测技术第34-48页
     ·基于核酸提取的分子生物学检测技术第34-40页
     ·全细胞杂交(whole cell hybridization) 技术第40-44页
     ·酶联免疫吸附分析技术(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)第44-45页
     ·分子生物学检测的辅助设备第45页
     ·分子生物学检测技术的应用第45-47页
     ·小结与展望第47-48页
第二章 中国海域几株中肋骨条藻类似硅藻的形态及系统进化分析第48-84页
   ·前言第48-49页
   ·材料与方法第49-60页
     ·实验藻种及培养条件第49-51页
     ·LM 观察第51页
     ·SEM 观察第51页
     ·细胞测量学与数据统计第51-52页
     ·细胞总DNA 的提取和质量检测第52-53页
     ·ITS (含5.8S rDNA) 和LSU D1-D2 rDNA 序列的PCR 扩增第53页
     ·扩增DNA 的纯化回收第53-54页
     ·扩增DNA 的T-A 克隆第54-57页
     ·序列分析第57-60页
   ·结果第60-76页
     ·形态学观察结果第60-70页
     ·DNA 的分离第70-71页
     ·PCR 及测序第71-72页
     ·系统发育分析第72-73页
     ·骨条藻间的遗传距离第73-76页
   ·讨论第76-84页
     ·骨条藻种的划分的形态学标准第76-77页
     ·骨条藻种的鉴定及形态学比较第77-79页
     ·用ITS 和LSU D1-D2 rDNA 对骨条藻种的鉴定第79-81页
     ·骨条藻的地理分布与进化关系第81-82页
     ·骨条藻种的多样性第82-84页
第三章 一株裸甲藻类似种的形态学观察及rDNA 和ITS 序列分析第84-94页
   ·前言第84-85页
   ·材料与方法第85-86页
     ·实验藻种及培养条件第85页
     ·LM 观察第85页
     ·SEM 观察第85页
     ·细胞总DNA 的提取和质量检测第85页
     ·ITS (含5.8S rDNA)和LSU D1-D2 rDNA 序列(以下简称LSU 序列) 的PCR 扩增第85页
     ·扩增DNA 的纯化回收、克隆和测序第85页
     ·序列分析第85-86页
   ·结果第86-92页
     ·形态学观察结果第86-89页
     ·DNA 的分离第89页
     ·PCR 及测序第89页
     ·序列分析第89-90页
     ·系统树分析第90-92页
   ·讨论第92-94页
第四章 赤潮异湾藻的全细胞FISH 检测第94-113页
   ·前言第94-96页
   ·材料与方法第96-101页
     ·实验藻种及培养条件第96页
     ·细胞总DNA 的提取和质量检测第96页
     ·LSU 和ITS 序列的PCR 扩增第96页
     ·扩增DNA 的纯化回收、克隆与测序第96页
     ·序列分析第96页
     ·寡核甘酸探针的设计第96-98页
     ·赤潮异湾藻的固定测试第98-99页
     ·荧光原位杂交第99-100页
     ·探针的交叉反应测试第100页
     ·细胞周期内荧光信号和FISH 检测率的比较第100-101页
     ·图像采集及分析第101页
     ·数理统计方法第101页
   ·结果与讨论第101-113页
     ·杂交流程的建立和优化第101-105页
     ·用优化的杂交流程对赤潮异湾藻进行特异性的检测第105-108页
     ·赤潮异湾藻的不同生长阶段对FISH 检测的影响第108-109页
     ·建立的FISH 与其它检测赤潮异湾藻的方法的比较第109-111页
     ·FISH 的应用前景第111-113页
第五章 海洋原甲藻的全细胞FISH 检测第113-121页
   ·前言第113页
   ·材料与方法第113-117页
     ·实验藻种及培养条件第113-114页
     ·细胞总DNA 的提取和质量检测第114页
     ·LSU D1-D2 rDNA 序列(以下简称LSU 序列)和ITS 序列(含ITS1、ITS2 和5.8S rDNA,以下同)的PCR 扩增第114-115页
     ·扩增DNA 的纯化回收与测序第115页
     ·序列分析第115页
     ·寡核甘酸探针的设计第115-116页
     ·全细胞荧光原位杂交第116页
     ·探针的特异性测试第116页
     ·图像采集及分析第116-117页
   ·结果与讨论第117-121页
     ·原位杂交方法第117页
     ·探针的特异性第117-121页
第六章 小结第121-123页
   ·主要研究结果或结论第121页
   ·研究的不足第121-122页
   ·下一步需要做的工作第122-123页
参考文献第123-149页
在读博士期间论文发表情况第149-151页
致谢第151页

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