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采用位置候选与比较基因组法分离、鉴定猪三个脂肪沉积相关基因

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1 文献综述第11-26页
   ·猪体内脂肪沉积的QTL定位研究现状第11-13页
   ·与脂肪沉积相关的候选基因第13-16页
   ·根据EST分离基因第16-19页
     ·EST简介及其应用第16-18页
     ·db EST的电子克隆技术第18页
     ·EST筛选和克隆新基因第18-19页
   ·比较基因组学在分离新基因中的应用第19-20页
   ·位置克隆在分离新基因中的应用第20-23页
     ·基因图谱第20-21页
     ·基因定位第21-23页
       ·体细胞杂种板(SCHP)用于染色体区域定位第21页
       ·辐射杂种板(RH)用于染色体精细定位第21-23页
   ·三个拟分离基因的研究现状第23-26页
     ·烯酰—CoA异构酶简介第23页
     ·WNT10B基因第23-24页
     ·DKK1基因第24-26页
2 研究的目的和意义第26-27页
3 材料与方法第27-38页
   ·材料第27-30页
     ·样品第27-28页
       ·DNA样品第27-28页
       ·组织样品第28页
     ·主要仪器设备第28页
     ·主要试剂及配制第28-29页
       ·主要试剂第28页
       ·主要试剂配制第28-29页
     ·主要分子生物学软件和统计软件第29页
     ·常用的分子生物学数据库第29-30页
   ·方法第30-38页
     ·猪PECI、WNT10B和DKK1基因的分离第30-33页
       ·猪EST信息筛选和引物设计第30页
       ·总RNA的提取和检测第30-31页
       ·总RNA的无RNase的DNase-Ⅰ处理及其纯化第31页
       ·RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction)第31-32页
       ·PCR扩增条件第32页
       ·PCR产物的纯化、克隆和测序第32-33页
       ·DNA序列同源性检索鉴定第33页
     ·基因定位的SCHP和RH法第33-35页
       ·引物设计第33-34页
       ·PCR扩增分型方法第34页
       ·数据分析方法第34-35页
       ·采用5’-RACE和电脑克隆的方法获取PECI基因的全长cDNA及序列分析第35页
       ·采用EST信息进行DKK1基因在全基因组中扩增第35页
     ·PCR-RFLP方法检测猪PECI和WNT10B基因的多态性和遗传组成第35-36页
       ·PCR扩增引物第35页
       ·酶切条件第35-36页
       ·基因分型第36页
     ·PECI和WNT10B基因多态位点遗传组成的检测方法第36页
     ·多态标记与性状的关联分析方法第36页
     ·利用RT-PCR进行PECI、WNT10B和DKK1基因组织表达谱研究的方法第36-38页
4 结果第38-62页
   ·三个猪基因片段的分离、序列分析与鉴定结果第38-45页
     ·根据猪EST信息设计特异性引物扩增结果第38-39页
       ·猪烯酰CoA异构酶基因(PECI)的分离第38页
       ·猪WNT10B基因的分离第38-39页
       ·猪DKK1基因的分离第39页
     ·基因分离片段的分析结果第39-44页
     ·扩增产物的鉴定结果第44-45页
   ·猪PECI基因、WNT10B基因和DKK1基因cDNA分析结果第45-56页
     ·总RNA的提取和检测结果第45-46页
     ·猪PECI基因RACE扩增结果第46页
     ·猪PECI基因的氨基酸序列分析结果第46-50页
     ·猪PECI基因的组织表达分析结果第50-51页
     ·猪WNT10B基因部分氨基酸序列分析结果第51-52页
     ·猪WNT10B基因的组织表达分析结果第52页
     ·猪DKK1基因的氨基酸序列分析结果第52-56页
     ·猪DKK1基因的组织表达分析结果第56页
   ·利用杂种板进行的染色体定位结果第56-57页
   ·猪PECI和WNT10B基因的遗传变异与遗传组成的检测结果第57-62页
     ·PECI基因的遗传变异与遗传组成第57-59页
       ·PECI基因3’-UTR区SNP的发现第57-58页
       ·PECI基因3’-UTR区PvuⅡ酶切位点多态性的检测结果第58-59页
     ·WNT10B基因的遗传变异与遗传组成第59-62页
       ·WNT10B基因3’-UTR区SNP的发现第59-60页
       ·WNT10B基因3’-UTR区Cfr42I酶切位点多态性的检测结果第60-62页
5 讨论第62-66页
   ·关于特异性引物的设计第62页
   ·关于三个新基因的定位第62-63页
   ·关于SNP检测第63页
   ·关于基因与性状关联分析第63-64页
   ·关于PECI和DKK1基因结构功能域的预测第64-65页
   ·关于PECI、WNT10B和DKK1基因的组织表达谱分析第65-66页
6 小结第66-68页
   ·本研究获得的主要研究结果第66页
   ·本研究的创新点与特色第66-67页
   ·本研究的不足和引出的问题第67-68页
参考文献第68-74页
附录1 缩略词表第74-75页
附录2 主要性状的中英文对照和缩写第75-76页
在读期间发表和待发表的论文题录第76-77页
致谢第77页

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