| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 1 引言 | 第12-30页 |
| ·生物信息学的概况 | 第12-14页 |
| ·生物信息学的定义 | 第12-13页 |
| ·生物信息学所用的方法和技术 | 第13-14页 |
| ·进化树 | 第14-18页 |
| ·Perl语言在生物数据处理中的应用 | 第18-21页 |
| ·Perl 语言的简介 | 第18-19页 |
| ·Perl 语言的优点 | 第19-21页 |
| ·Perl 语言在处理生物数据过程中的优点 | 第21页 |
| ·基因家族的研究 | 第21-22页 |
| ·锌指蛋白研究进展 | 第22-26页 |
| ·锌指蛋白的结构 | 第23页 |
| ·锌指蛋白分类 | 第23-24页 |
| ·锌指蛋白的作用方式 | 第24-26页 |
| ·CCCH 型锌指蛋白的研究进展 | 第26-28页 |
| ·本研究的目的意义 | 第28-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-41页 |
| ·材料 | 第30-35页 |
| ·植物材料 | 第30页 |
| ·生化试剂 | 第30页 |
| ·实验引物 | 第30-31页 |
| ·软件和网络资源 | 第31-35页 |
| ·实验方法 | 第35-41页 |
| ·Clustal 的使用 | 第35-36页 |
| ·Phylip 系统发育树 | 第36-38页 |
| ·Mega3.1 构建系统发生树的方法 | 第38页 |
| ·本地BLAST 方法 | 第38页 |
| ·蛋白质三维结构预测 | 第38-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-93页 |
| ·拟南芥中CCCH 基因的鉴定 | 第41-64页 |
| ·BLAST 程序鉴定CCCH 基因 | 第41-48页 |
| ·利用Perl 的正则表达式检索CCCH 基因 | 第48-64页 |
| ·拟南芥中CCCH 基因家族的系统发生分析 | 第64-67页 |
| ·基因结构及蛋白质基序分析 | 第67-69页 |
| ·拟南芥中CCCH 基因的分布 | 第69-71页 |
| ·其它物种中CCCH 基因的鉴定 | 第71-72页 |
| ·苔藓中的CCCH 基因家族 | 第71页 |
| ·裸子植物及被子植物中的CCCH 基因家族 | 第71-72页 |
| ·水稻中CCCH 基因的鉴定 | 第72-75页 |
| ·拟南芥和水稻中CCCH 基因家族的比较分析 | 第75-80页 |
| ·拟南芥和水稻中CCCH 基因的表达模式 | 第80-82页 |
| ·网络资源统计CCCH 基因的表达模式 | 第80-82页 |
| ·姊妹基因的表达模式的对比 | 第82页 |
| ·拟南芥亚家族IX 和水稻亚家族I 中基因的特征分析 | 第82-89页 |
| ·CCCH 蛋白与RNA 的结合 | 第89-93页 |
| 4 讨论 | 第93-98页 |
| ·CCCH 家族是锌指蛋白家族的一大类 | 第93页 |
| ·CCCH 锌指基序的定义 | 第93-94页 |
| ·CCCH 基因的功能分析 | 第94-96页 |
| ·CCCH 基因在逆境胁迫中的作用 | 第94-95页 |
| ·CCCH 锌指蛋白做为RNA 结合蛋白起作用 | 第95-96页 |
| ·CCCH 锌指蛋白可能是在核质之间穿梭的蛋白 | 第96页 |
| ·研究多基因家族的方法 | 第96-98页 |
| ·以已知的基因检索其同源基因 | 第96-97页 |
| ·利用Perl 语言的正则表达式分析基因家族 | 第97-98页 |
| 5 结论 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-106页 |
| 入学以来已发表的论文及成果 | 第106-107页 |
| 致谢 | 第107页 |