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Gamma-Ⅳ(B)氮化物的物理性质以及RNA GCAA发夹结构的理论研究

摘要第1-14页
ABSTRACT第14-19页
第一章 综述第19-26页
   ·立方尖晶石结构的Ⅳ(B)-氮化物第19-23页
     ·超硬材料简介第19-20页
     ·新型超硬材料:立方尖晶石结构的Ⅳ(B)-氮化物的研究背景第20-21页
     ·研究目的和研究内容第21-23页
   ·RNA GCAA发夹结构第23-25页
     ·研究现状第23-24页
     ·研究目的和内容第24-25页
 参考文献第25-26页
第二章 基本理论和计算方法第26-38页
   ·CASTEP软件的主要功能及原理第26-32页
     ·CASTEP软件主要功能第26-27页
     ·CASTEP软件主要理论第27-32页
   ·分子动力学模拟方法第32-36页
     ·分子动力学方法的基本原理第32-33页
     ·势函数第33页
     ·有限差分算法第33-34页
     ·平衡系统MD模拟的系踪第34-35页
     ·宏观统计量的提取第35-36页
 参考文献第36-38页
第三章 第一原理研究磷掺杂的尖晶石结构的氮化硅-氮化碳的电子性质第38-44页
 引言第38页
   ·晶体结构和电子结构第38-39页
   ·磷掺杂的立方尖晶石结构的氮化硅-氮化碳的电子性质第39-43页
     ·三元体系中阳离子位置的选择性第39-41页
     ·体系的电子性质第41-43页
   ·本章小结第43-44页
第四章 第一原理研究碳和砷共掺杂的尖晶石结构的氮化硅的电子性质第44-48页
 引言第44页
   ·晶体结构和电子结构第44-45页
   ·碳和砷共掺杂的尖晶石结构的氮化硅的电子性质第45-47页
   ·本章小结第47-48页
第五章 第一原理研究锗和磷共掺杂的尖晶石结构的氮化锡的电子性质第48-52页
 引言第48页
   ·晶体结构和电子结构第48-49页
   ·锗和磷共掺杂的尖晶石结构的氮化锡的的电子性质第49-51页
     ·三元体系中阳离子的位置的选择性第49页
     ·体系的电子性质第49-51页
   ·本章小结第51-52页
第六章 第一原理研究碳掺杂的尖晶石结构的氮化锗-氮化钛的电子性质第52-58页
 引言第52页
   ·晶体结构和电子结构第52-53页
   ·碳掺杂的尖晶石结构的氮化锗-氮化钛的电子性质第53-57页
     ·三元体系中阳离子位置的选择性第53-56页
     ·体系的电子性质第56-57页
   ·本章小结第57-58页
第七章 第一原理研究压力诱导的氮化硅-氮化锗的六方相-立方相的相变第58-66页
 引言第58页
   ·晶体结构和电子结构第58-60页
   ·压力诱导的氮化硅-氮化锗固溶体的六方相-立方相的相变第60-62页
   ·本章小结第62页
 参考文献(三-七章)第62-66页
第八章 用REMD方法研究:RNA GCAA发夹结构的构象转变第66-92页
 引言第66-67页
   ·分子结构和方法第67-68页
   ·模拟结果和讨论第68-83页
     ·取样空间第68-72页
     ·GCAA tetraloop的折叠/伸展第72-75页
     ·GCAA tetraloop近天然稳定态的环部分的动力学第75-76页
     ·模拟结果与NOE数据的比较第76页
     ·碱基堆积方式第76-77页
     ·模拟中发现的环部分碱基堆叠模式第77-78页
     ·NMR结构中碱基的堆叠模式第78-80页
     ·结构转变图第80-82页
     ·新Amber parmbsc0力场第82-83页
   ·本章小结第83-85页
 计算Q值时所用到的RNA GCAA发夹结构的NOE数据第85-87页
 参考文献(第八章)第87-92页
第九章 总结第92-96页
   ·主要结论第92-94页
   ·本论文的创新点第94页
   ·研究工作计划第94-96页
攻读博士学位期间发表和完成的学术论文第96-97页
致谢第97-98页
英文论文[1]第98-105页
英文论文[2]第105-126页
英文论文[3]第126-132页
学位论文评阅及答辩情况表第132页

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