| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第6-11页 |
| ·禾本科的系统位置及其系统发育关系 | 第6-7页 |
| ·禾本科的起源和分化时间的推断 | 第7-9页 |
| ·禾本科的地理分布 | 第9页 |
| ·本文的研究目的 | 第9-11页 |
| 第二章 禾本科分歧时间和进化速率的估算 | 第11-32页 |
| ·物种分歧时间和进化速率的估算方法 | 第11-14页 |
| ·全局分子钟(Global molecular clock) | 第11-12页 |
| ·局部分子钟(Local molecular clock) | 第12-13页 |
| ·宽松分子钟(Relaxed molecular clock) | 第13-14页 |
| ·影响估算分歧时间和进化速率的因素 | 第14页 |
| ·数据和方法 | 第14-18页 |
| ·数据处理 | 第15-17页 |
| ·系统发育分析 | 第17页 |
| ·估算禾本科的分歧时间和进化速率 | 第17-18页 |
| ·结果 | 第18-31页 |
| ·讨论 | 第31-32页 |
| 第三章 禾本科祖先分枝的适应性进化检测 | 第32-43页 |
| ·引言 | 第32-38页 |
| ·正选择压力与适应性进化 | 第32-33页 |
| ·估计同义置换和非同义置换的方法 | 第33-35页 |
| ·似然法中检测适应性进化的常用模型 | 第35-38页 |
| ·数据和方法 | 第38-39页 |
| ·结果 | 第39-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| 第四章 总结与展望 | 第43-45页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| ·展望 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-53页 |
| 附录Ⅰ | 第53-57页 |
| 附录Ⅱ | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
